Описание тега neuroscience
Неврология - это изучение нервной системы. Этот тег широко применяется к вопросам из различных подотраслей, таких как визуализация мозга, нейронная инженерия, вычислительная и системная нейробиология.
1
ответ
Создание трехмерной каркасной модели коры головного мозга из шаблона мозга MNI с помощью Matlab с использованием MyRobustCrust
Я пытаюсь создать каркасную 3d-модель из шаблона мозга MNI, используя MyRobustCrust на matlab. Моя цель - определить координаты MNI на поверхности коры. Для этого я следую инструкциям, перечисленным на этом сайте: http://soundsfromthenorth.com/?p=3 …
24 мар '15 в 20:57
1
ответ
Отрицательные шипы в нейронах
Я новичок в нейробиологических исследованиях и натолкнулся на термин, называемый отрицательными шипами (иногда также используемый в сочетании с термином двухфазный шип), но не смог найти, что он имел в виду в научных работах. Может ли всплеск произо…
18 янв '18 в 15:44
0
ответов
Почему я не могу применить интегрированную функцию оценки, обратную к меткам времени, заканчивающимся прямо во время испытания в неоднородном пуассоновском процессе в R?
Я довольно новый в R. Учусь, как я работаю. Мой вопрос касается неоднородных реализаций Пуассоновского процесса. Я использую скорострельность, зависящую от времени 100*(sin(pi*t)+1) где t он соответствует времени. Я использую метод пересчета времени…
25 апр '18 в 09:13
1
ответ
MAC NEURON-Python: ошибка. Доступен более новый выпуск инструментов командной строки. Обновите их с помощью Software Update в App Store
При попытке установить NEURON с поддержкой Python (например, можно запустить python -c "import neuron" ), используя инструкции с сайта портала Human Brain Project. После: brew install neuron Я получаю следующую (вводящую в заблуждение) ошибку: Error…
29 июн '17 в 16:19
1
ответ
Нейрофизиологическая запись MATLAB
Мои данные хранятся в структурах, касающихся записи с нейронов. Нейронные пики хранятся в логическом массиве, где пик равен 1, а пик не равен 0. spike = <1x50 logical> spike = [1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 1 0 1 0 0 0 1 1 0 0 ...] Что м…
15 июл '15 в 01:31
1
ответ
Топоплот в ggplot2 - 2D визуализация, например, данных ЭЭГ
Можно ggplot2 использоваться для производства так называемого топоплота (часто используется в нейробиологии)? Пример данных: label x y signal 1 R3 0.64924459 0.91228430 2.0261520 2 R4 0.78789621 0.78234410 1.7880972 3 R5 0.93169511 0.72980685 0.9170…
26 янв '16 в 16:55
1
ответ
В файлах NEURON .MOD каков порядок операций с разделами?
В каком порядке выполняются команды в разделах файла NEURON .MOD/NMODL? В частности, в этих блоках: ПРОИЗВОДНОЕ, BREAKPOINT и NET_RECEIVE.
28 апр '16 в 17:23
1
ответ
Как прочитать сигнал EGG устройства Enobio8 через MNE-Python?
В настоящее время я работаю в проекте BCI. Мы читаем данные с устройства Enobio8 и когда мы записали файл. Файл сохраняется как .easy формат вместе с .info файл. Ниже приведены примеры того, что содержится в каждом файле. 1- ЭЭГ-сигналы .easy файл -…
10 май '17 в 09:36
1
ответ
Моделирование временного ряда hrf в MATLAB
Я пытаюсь смоделировать данные МРТ, чтобы проверить эффективность экспериментального проекта. Я прошел несколько уроков и у меня есть вопрос. Сначала мне нужно смоделировать реакцию BOLD, свернув временные ряды ввода стимула с канонической функцией …
18 окт '17 в 02:42
1
ответ
Ускорить пост кровать параллелизмом
Я использую инструмент под названием bedpostx, который используется для подгонки диффузионной модели к моим (предварительно обработанным) данным. Проблема в том, что этот процесс был запущен более 24 часов. Я хотел бы ускорить процесс путем распарал…
11 ноя '15 в 18:19
1
ответ
Leaky Интегрируйте и запустите модель нейрона
Я нырял в нейронные сети в последнее время. Они потрясающие, но немного неясные и очень недоступные, если не сказать больше. Я особенно заинтересован в машинах с жидким состоянием, которые интенсивно используют модель интегрирования и запуска нейрон…
09 июл '15 в 02:10
1
ответ
Ижикевич Нейронная модель - уравнения
В литературе, работах и книге (например, [1] и [2]) я нашел разные уравнения для модели нейрона Ижикевича. В [1] я нашел это: v' = 0.04v^2 + 5v + 140 - u + I u' = a(bv - u) if v >= 30 mV => v = c; u = u + d В [2] я нашел это: C*v' = k(v - v_…
12 дек '18 в 14:25
2
ответа
Простой способ перечислить свойства / информацию раздела NEURON?
Есть ли в симуляторе NEURON более простой способ составления списка свойств раздела, кроме итерации каждого свойства по отдельности?
01 мар '16 в 00:53
1
ответ
Компиляция FSL: "фатальная ошибка: libxml++/libxml++. H: такого файла или каталога нет"
Я понимаю, что это очень много, но я просмотрел все остальные ответы, и ни один из них не имеет отношения к мне. Я пытаюсь скомпилировать программное обеспечение для нейровизуализации FSL из исходного кода (я должен, это не поддерживается в моем дис…
26 окт '17 в 21:50
0
ответов
Нибабель противоречивый заголовок изображения / ориентация данных
Я обнаружил несоответствие в моем изображении между заголовком и данными: >>> im = nib.load('image.nii') >>> im.shape (512, 512, 112) >>> im.get_data().shape (112, 512, 512) Это ожидается? Могу ли я попросить Nibabel предо…
05 дек '16 в 02:08
0
ответов
Пользовательские цвета для регионов фри-серферов Desikan-Killiany atlas
Я хотел бы знать, как лучше всего получить изображение мозга, которое показывает конкретные значения или цвета для каждого из 68 атласов freesurfer Desikan-Killiany (на шаблоне fsaverage). Мой вклад будет только эти 68 значений. Создание собственног…
05 май '15 в 21:02
1
ответ
Как получить кластер, к которому принадлежит ячейка, используя AllenSDK?
На странице "Клеточная таксономия зрительной коры мыши " в разделе "Исследование данных" в верхней строке показан список имен кластеров ячеек зрительной коры мыши: Вопрос: Как узнать идентификатор кластера, которому принадлежит эта ячейка, учитывая …
09 май '18 в 15:19
1
ответ
FSL переназначение для некоторых карт мозга
У меня есть все эти файлы Dicom с картами мозга некоторых пациентов. Я отсортировал их по пациентам, карте, b_value и срезу. У каждого среза мозга есть 15 файлов dicom градиентов, файл dicom "b zero" и файл изотропного dicom "b_x" (который, как сказ…
10 мар '15 в 15:02
1
ответ
Читаю ли я обозначение корреляции функции большого шага для модели нейронов с утечкой интегрированного огня или взрыва?
Как страстный проект, я воссоздаю нейронную модель из лаборатории XJ Wang в NYU. Статья написана Wei, W. & Wang, XJ (2016). Ингибирующий контроль в кортикально-базальных ганглиев-таламокортикальных петлях: сложная регуляция и взаимодействие с процес…
12 мар '18 в 02:49
1
ответ
Запуск jnml приводит к ошибке: не удалось найти или загрузить основной класс org.neuroml.JNeuroML
При запуске jNeuroML я получаю следующую ошибку: Error: Could not find or load main class org.neuroml.JNeuroML Как мне это исправить?
30 дек '15 в 18:31