Простой способ перечислить свойства / информацию раздела NEURON?

Question

Есть ли в симуляторе NEURON более простой способ составления списка свойств раздела, кроме итерации каждого свойства по отдельности?

Answer 1

Здесь psection() метод. Как только интересующий раздел push()редактор Typing psection() или из Python, h.psection() выдаст следующий пример результата:

>>> h.Granule[0].soma.push()
<nrn.Section object at 0x109826dc8>

>>> h.psection()

Granule[0].soma { nseg=1  L=8  Ra=80
    /*location 0 attached to cell 5*/
    /* First segment only */
    insert morphology { diam=8}
    insert capacitance { cm=4}
    insert pas { g_pas=0 e_pas=-65}
    insert kamt { gbar_kamt=0}
    insert nax { sh_nax=15 gbar_nax=0}
    insert na_ion { ena=60}
    insert kdrmt { gbar_kdrmt=0}
    insert k_ion { ek=-90}
    insert Exp2Syn { tau1=5 tau2=50 e=0}
    insert IClamp { del=50 dur=200 amp=0.09}
}

Answer 2

Если вы используете графический интерфейс NEURON, вы также можете найти свойства раздела в меню управления NEURON:

Инструменты-> Вид модели

Это откроет окно Model View, в котором есть детали раздела и сегмента, такие как:

• Тип клеток: настоящие клетки / искусственные клетки
• ОбъектыNetCon
• ОбъектыLinearMechanisms
• Механизмы плотности
• Точечные процессы

Если щелкнуть каждое свойство, появится раскрывающееся меню, отображающее сведения о выбранном свойстве.

Вы также можете просмотреть структуру модели, нажав на тип ячейки (реальные / искусственные ячейки)