Описание тега mne-python
MNE-Python - это пакет Python с открытым исходным кодом для исследования, визуализации и анализа нейрофизиологических данных человека, таких как MEG, EEG, sEEG, ECoG и т. Д. Он включает модули для ввода / вывода данных, предварительной обработки, визуализации, оценки источника, частотно-временного анализа, анализа связи, машинного обучения и статистики.
1
ответ
mne_browse_raw (Python MNE): как я могу получить доступ к пользовательскому интерфейсу?
Как я могу получить доступ к пользовательскому интерфейсу mne_browse_raw, как показано в этой ссылке? Когда я набираю команду, например, $ mne browse_raw --raw test_raw.fif я получил Открытие файла необработанных данных C:\Users\Nico\schotest_raw.fi…
09 июл '16 в 10:37
1
ответ
Как прочитать сигнал EGG устройства Enobio8 через MNE-Python?
В настоящее время я работаю в проекте BCI. Мы читаем данные с устройства Enobio8 и когда мы записали файл. Файл сохраняется как .easy формат вместе с .info файл. Ниже приведены примеры того, что содержится в каждом файле. 1- ЭЭГ-сигналы .easy файл -…
10 май '17 в 09:36
0
ответов
Как правильно удалить артефакт EOG из других данных ЭЭГ с помощью MNE?
У меня есть данные ЭЭГ, и я использую MNE python для чтения данных и их предварительной обработки. Я застрял (Удаление артефактов EOG с использованием метода слепого разделения источников, анализ независимых компонентов (ICA).). Как я понимаю из при…
08 сен '17 в 00:12
0
ответов
Лучший подход к заполнению пробелов в сигналах
У меня есть массив 2dim, который представляет многоканальный биосигнал. Этот массив имеет размерность 20 x n_samples, где столбцы представляют: номер выборки - 16 каналов данных - время. Учитывая Bluetooth-соединение, у меня есть некоторые падения п…
02 фев '18 в 15:08
0
ответов
Сохранение отредактированного файла EDF в MNE python
Я пытаюсь редактировать событие файла EDF в MNE Python. После редактирования и замены файла событий я не могу найти какой-либо способ перезаписи основного файла для сохранения изменений. Я нашел pyedflibrary для написания EDF, но нет простой докумен…
04 янв '19 в 10:48
0
ответов
Segfault с MNE и питоном 3
Так как несколько дней я пытаюсь сделать некоторые вещи довольно простыми, но которые, тем не менее, не работают... Я хотел бы сделать некоторую визуализацию данных с MNE и python. Итак, мой код: import mne file = 'path_to_file.edf' data = mne.io.re…
30 ноя '18 в 10:42
1
ответ
mne-python: чтение и запись файлов edf приводит к ошибке во время выполнения
Я хотел бы написать файл EDF, но не нашел функцию в mne это позволило бы мне сделать это. Так что я использовал pyedflib вместо. Но когда я пытаюсь прочитать вновь созданный файл EDF, используя mne.io.read_raw_edf()Я получаю ошибку во время выполнен…
11 дек '17 в 04:58
1
ответ
Как преобразовать файл.edf в файл csv в python?
Мне нужна программа на Python для преобразования EDF-файла в CSV-файл. Я не нашел никакого вспомогательного материала из Интернета. На самом деле по некоторым причинам обязательно конвертировать файл EDF в формат CSV. Заранее спасибо.
12 сен '18 в 10:28
1
ответ
MNE, как сохранить полный необработанный сигнал ЭЭГ с событиями в виде файла Matlab?
raw, timestamp = ur.MNE_Read_EDF(path) mne_events, events_dict = ev.MNE_prepare_events(path, timestamp) epochs = mne.Epochs(raw, mne_events, events_dict, tmin=-0.5, tmax=0.5) signal = epochs.plot(block=True) Это кажется простым, но я потерян. У меня…
08 мар '18 в 12:15
2
ответа
Python MNE - чтение данных ЭЭГ из массива
У меня есть данные ЭЭГ, которые поступают в виде трехмерного массива (эпоха * канал * время). timepoint - это массив из 256 элементов, содержащий каждый выбранный момент времени (всего 1 с, при 256 Гц). эпоха - экспериментальное испытание. Я пытаюсь…
12 авг '15 в 00:39
2
ответа
.csv в.edf или другие форматы чтения ЭЭГ
Я использую набор для определения ЭЭГ под названием Gtec.NAUTILUS, который дает мне двоичные данные для 32 каналов с частотой 500 Гц. Затем данные преобразуются в формат CSV. Теперь я хочу обработать эти данные в Microsoft Azure, используя python 3.…
23 май '16 в 12:18
0
ответов
Отображение нескольких объектов Matplotlib фигура рядом
Я использую mne пакет в Python для построения ЭЭГ. У меня есть экземпляр фигуры matplotlib, и я хочу построить два из них рядом и нарисовать линии над ним, чтобы показать связи. >>import mne >>import matplotlib.pyplot as plt >>a = …
12 июн '18 в 10:28
1
ответ
Как получить исходную локализацию данных MEG в состоянии покоя без событий и эпох, используя python-MNE
Выполняя локализацию источника данных этапа покоя MEG, он запрашивает эпохи и события, которых у меня нет в моем наборе данных, поскольку это данные состояния покоя. Это также предварительно обработано.
03 окт '18 в 11:43
0
ответов
Python модуль PySurfer mne ошибка установки
Я сделал установку MNE, следуя инструкциям на веб-странице. Тем не мение: $ pip install PySurfer mne не работает. "ImportError: модуль с повторной попыткой отсутствует" Я использую: Ubuntu 16.04 LTS 64-bit
14 мар '18 в 19:04
1
ответ
Ошибка памяти! используя мне набор данных
Я пытаюсь использовать набор данных "visual_92_categories" mne-python, но когда я хочу выполнить фильтрацию и извлечь эпохи, я получаю ошибку памяти! моя оперативная память 7G. Мне интересно, может ли кто-нибудь помочь мне. Есть ли какие-либо ограни…
25 май '17 в 17:29
0
ответов
Python - MNE - не может загружать.fif-файлы
Я пытался запустить эти 3 строки кода: import mne myfile = 'test_raw.fif' raw = mne.io.read_raw_fif(myfile) Он должен загрузить.fif-файл. Пример с http://martinos.org/mne/stable/index.html Когда я пробую это с их образцами данных, это работает! Когд…
21 фев '17 в 11:21
1
ответ
Единица измерения необработанных данных в mne.RawArray
Я пытаюсь загрузить данные ЭЭГ из numpy массив в mne.io.RawArray объект. Какова правильная единица измерения для данных в массиве? Вольта? Я читаю источник mne.create_info и, похоже, блок должен быть вольт. Кто-нибудь может подтвердить?
06 фев '17 в 23:08
1
ответ
Python MNE: как вычислить непрерывные вейвлеты?
Python MNE API говорит, что я должен вычислять непрерывные вейвлеты mne.time_frequency.cwt_morlet(X, sampling_frequency, frequencies_of_interest) Однако, когда я делаю X равным необработанному файлу данных.fif, он выдает 287 # mode = "valid" 288 de…
13 июл '16 в 09:06
0
ответов
Как найти х в mne.time_frequency.stft?
Я много пытался найти х в stft функция в Mne-Python, но я не могу его найти. Моя задача состоит в том, чтобы построить спектрограмму из этого ствола. Может ли кто-нибудь из вас помочь мне в этом?
21 мар '19 в 15:13
0
ответов
Загрузка набора данных ЭЭГ в Python из файла через библиотеку mne; Почему это не работает?
Я попытался загрузить набор данных EEG в python, сначала я установил библиотеку men, затем написал следующий код: Я попробовал этот код в PyCharm в MacOS и Anaconda ( IPython, Jupyter и Spyder) с Windows import mne raw = mne.io.read_raw_edf ("S001R0…
20 июл '19 в 19:31