FSL переназначение для некоторых карт мозга
У меня есть все эти файлы Dicom с картами мозга некоторых пациентов. Я отсортировал их по пациентам, карте, b_value и срезу. У каждого среза мозга есть 15 файлов dicom градиентов, файл dicom "b zero" и файл изотропного dicom "b_x" (который, как сказал мой учитель, бесполезен для того, что мне нужно делать). Теперь я должен провести некоторый анализ DTI, так как мой учитель попросил меня преобразовать их в файлы.nii и исправить их с помощью FSL, выполнив вихретоковую коррекцию, а затем я должен "заново выровнять" каждый из 15 градиентов в каждом срезе. к его b_zero. Знаете ли вы, как я могу сделать эту последнюю вещь ("повторное выравнивание") с FSL? Кроме того, я должен сделать коррекцию вихревых токов до или после повторного выравнивания? Заранее спасибо!
1 ответ
Извините, я не могу вам помочь, но вы, вероятно, найдете ответ в документах FSL: http://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/
Если вы хотите использовать FSL из своего собственного кода, попробуйте NiPy (Neuroimaging in Python): http://nipy.sourceforge.net/nipype/users/interface_tutorial.html