Описание тега cox-regression

Вопросы с тегом
The term Cox regression model (omitting proportional hazards) is sometimes used to describe the extension of the Cox model to include time-dependent factors. However, this usage is potentially ambiguous since the Cox proportional hazards model can itself be described as a regression model.
0 ответов

Предсказать вероятность события (событие предоплаты) с учетом модели срега

Я хочу предсказать совокупный риск предоплаты для данных за первый квартал 2016 года, где уровень ссуды был A. У меня есть данные до MOB (месяц в книге) 27, но я хочу прогнозировать до месяца 36. sr.a_q2_16 <- survreg(Surv(time=MOB,event=prepay)~…
28 июн '18 в 20:55
0 ответов

Предсказать вероятность выживания до будущего времени

У меня есть "тест" набора данных, который показывает данные за первые 27 месяцев тысяч кредитов. Используя мою модель Coxph, я хочу предсказать риск события (который в данном случае является предоплатой) до 36 месяца. У меня нет данных за 28-36 меся…
03 июл '18 в 18:43
2 ответа

R - model.frame() и нестандартная оценка

Я озадачен поведением функции, которую пытаюсь написать. Мой пример исходит из survival пакет, но я думаю, что вопрос является более общим, чем это. В основном, следующий код library(survival) data(bladder) ## this will load "bladder", "bladder1" an…
21 май '16 в 15:06
1 ответ

Как выбрать кластер по умолчанию в модели Кокса в R?

Я работаю над моделью Кокса, и у меня есть переменная, которая разрезается на кластеры. Вот несколько рабочих примеров: lung2=lung lung2$age.cl = cut(lung2$age, c(40,50,60,70,80,90)) cox = coxph(Surv(time, status) ~ age.cl, data = lung2) Возвращает …
28 июн '17 в 13:51
1 ответ

Как создать бинарный предитор из многомерной модели glmnet (coxnet)?

Давайте использовать следующий пример: генерировать данные о выживании (1000 образцов с 30 переменными) library(glmnet) library(survival) set.seed(10101) N=1000;p=30 nzc=p/3 x=matrix(rnorm(N*p),N,p) beta=rnorm(nzc) fx=x[,seq(nzc)]%*%beta/3 hx=exp(fx…
14 мар '17 в 14:32
1 ответ

Константа модели Кокса

Я вычислил прогностическую модель, используя модель Кокса (coxph функция в R). Я предоставляю стандартизированные коэффициенты регрессии в моей статье. Однако рецензент просит меня дать константу модели Кокса. Это то же самое, что и базовая функция?…
31 июл '18 в 22:39
0 ответов

Создайте кривую выживаемости с зависимым от времени ковариатом и изменяющимся во времени коэффициентом

** Я хочу, чтобы код генерировал кривые выживания в условиях с ковариатами, зависящими от времени, и с изменяющимися во времени коэффициентами. Цель состоит в том, чтобы продемонстрировать, как метод выставления счетов влияет на отсутствие полиса ст…
17 май '18 в 18:47
0 ответов

Вопрос: Как рассчитать p-значения в модели Кокса PH с максимальной статистикой теста в R?

Я заинтересован в вычислении p-значений в модели PH Кокса на основе максимальной статистики теста, чтобы получить очень надежные оценки. У кого-нибудь есть опыт с этим? Я немного поэкспериментировал с пакетом R 'coxphf', который включает в себя штра…
21 июл '16 в 23:43
1 ответ

newdata при построении кривой выживаемости регрессии Кокса в r

Я пытаюсь построить скорректированную кривую выживания путем построения регрессии Кокса при использовании переменных взаимодействий. чтение страницы surfit.coxph https://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/survival/html/survfit.coxph.html Я вижу п…
30 ноя '15 в 16:12
1 ответ

График отдельных кривых выживаемости в R

В R я организовал свою базу данных как процесс подсчета для применения расширенной модели Кокса (с изменяющимися во времени ковариатами): конечные точки - это время до события или время для цензуры, а все точки отсечения - это время события в данных…
24 июл '14 в 15:15
1 ответ

R coxph() предупреждение: Loglik сходится перед переменной

У меня возникли проблемы с использованием coxph(). У меня есть две категориальные переменные: пол и вероятная причина, которые я хочу использовать в качестве переменных-предикторов. Секс - это просто типичный мужчина / женщина, но у вероятной причин…
14 окт '13 в 21:07
0 ответов

Модель для оценки ухудшения / улучшения заболевания после смены терапии

У меня есть некоторый опыт регрессионного анализа, моделей Кокса и т. Д., Но я хотел бы спросить, какая модель лучше всего подойдет для оценки симптоматического контроля хронического заболевания, связанного с различными изменениями лекарств. Предпол…
24 окт '18 в 16:47
1 ответ

Несколько входов для coxph

Есть ли способ запустить coxph для нескольких входов. Здесь я использовал вход hsa_let_7b_5p, coxph(Surv(Time, Status)~ hsa_let_7b_5p, data=as.data.frame(test)) Call: coxph(formula = Surv(Time, Status) ~ hsa_let_7b_5p, data = as.data.frame(test)) co…
04 май '16 в 08:57
0 ответов

Интерпретация cox.zph из сплайна

Я пытаюсь следовать шагам, описанным в статье, подобной статье Кила " Сложно пропорционально: проверка непропорциональных рисков в моделях Кокса ". Он рекомендует сначала определить, относится ли нелинейный сплайн к непропорциональности, а затем на …
13 авг '18 в 00:16
1 ответ

Модель кодирования, разработанная в Proc PHREG

Я разработал модель COX с использованием процедуры SAS proc phreg. Я знаю, как оценивать, используя ковариату, используя процедуру proc. Как мне перевести модель в простой sas-код? Благодарю.
03 авг '16 в 15:18
2 ответа

Как cox.zph работает с зависящими от времени ковариатами?

У меня есть модель Coxph с 5 независимыми от времени и 2 независимыми от времени переменными. Я хочу проверить предположение о пропорциональной опасности и, кроме остатков мартингейла и отклонения, использовать cox.zph. Мой вопрос: как эта функция р…
30 июн '14 в 10:54
1 ответ

C-статистика и 95% доверительный интервал для модели Кокса с нестационарными ковариатами

Я выполняю регрессию Кокса с зависимой от времени ковариатой. Я особенно заинтересован в расчете 95% доверительного интервала индекса соответствия. Однако стандартное резюме модели coxph возвращает только индекс соответствия и его стандартную ошибку…
18 дек '18 в 22:51
0 ответов

Как включить взаимодействие между ковариатой и временем для модели непропорциональных рисков?

Как включить взаимодействие между ковариатой и временем для модели непропорциональных рисков? Я часто нахожу, что предположение о пропорциональной опасности для регрессий Кокса не выполняется. Возьмите следующие данные в качестве примера. > head(…
31 дек '18 в 09:25
0 ответов

Как выполнить тест vuong для регрессионной модели Кокса с использованием пакета R

Говорят, что тест vuong можно использовать для сравнения двух моделей регрессии, которые не являются вложенными. Но мне интересно, как это сделать для моделей регрессии Кокса. Спасибо
12 янв '19 в 13:48
0 ответов

MLR - анализ выживания с данными, зависящими от времени

Я использую mlr и хотел бы иметь возможность использовать расширенную версию модели Кокса PH для правых цензурированных, зависящих от времени ковариат. Это то, что я попробовал, следуя виньетке по зависящим от времени ковариатам https://cran.microso…
24 янв '19 в 23:58