Описание тега survival

Вопросы с тегом
Анализ выживаемости сравнивает статистическую силу предикторов для событий, закодированных как происходящие или подвергнутых цензуре, вместе с временной переменной. Он может быть параметрическим или непараметрическим.
1 ответ

R Flexsurv- оценка функции выживания

У меня есть кривые Капплана-Мейера на выживание, и я хочу экстраполировать различные модельные кривые (например, Weibull, Gompertz,...), используя пакет flexsurv. Мне удалось выполнить экстраполяцию, но я не нашел решения для создания матрицы график…
24 авг '18 в 09:17
0 ответов

Предсказать вероятность события (событие предоплаты) с учетом модели срега

Я хочу предсказать совокупный риск предоплаты для данных за первый квартал 2016 года, где уровень ссуды был A. У меня есть данные до MOB (месяц в книге) 27, но я хочу прогнозировать до месяца 36. sr.a_q2_16 <- survreg(Surv(time=MOB,event=prepay)~…
28 июн '18 в 20:55
1 ответ

Создайте объект выживания с помощью наблюдений как правой, так и левой усеченной + правой.

У меня проблема с созданием моих объектов выживания в R. Я хочу смоделировать выживание от клиентов по подписке (ежемесячные данные), но для создания объектов выживания мне нужно включить оба типа цензуры: классическая правая цензура: некоторые клие…
19 апр '18 в 15:24
2 ответа

Изменить данные на основе разных столбцов

Мне нужно изменить свои данные, чтобы получить их в надлежащем формате для анализа выживания. Мой текущий набор данных выглядит так: Product_Number Date Status A 2018-01-01 0 A 2018-01-02 1 A 2018-01-03 0 B 2018-01-01 0 B 2018-01-02 0 B 2018-01-03 0…
07 фев '19 в 11:40
0 ответов

Создайте кривую выживаемости с зависимым от времени ковариатом и изменяющимся во времени коэффициентом

** Я хочу, чтобы код генерировал кривые выживания в условиях с ковариатами, зависящими от времени, и с изменяющимися во времени коэффициентами. Цель состоит в том, чтобы продемонстрировать, как метод выставления счетов влияет на отсутствие полиса ст…
17 май '18 в 18:47
0 ответов

Данные о рисках в конкурентной борьбе

Я пытаюсь реализовать конкурирующую модель риска риска, используя данные панели с моделью из трех состояний, аналогично рисунку 6а (стр.7, виньетка с ручным управлением МСМ), где переходы разрешены только из состояния 1 в состояние 2 или из состояни…
22 фев '18 в 08:34
1 ответ

Stata: Как очистить графики sts из памяти?

У меня есть следующий код: graph drop _all sts graph if year==2014, saving(14) sts graph if year==2015, saving(15) sts graph if year==2016, saving(16) gr combine 14.gph 15.gph 16.gph Я хотел бы добавить строку, которая очистит предыдущий график из п…
03 авг '18 в 14:45
1 ответ

Анализ выживания, объединяющий объекты выживания и ggplot

Небольшой фон, который может быть полезен. Я нахожусь в положении, что у меня есть два графика, которые нужно объединить. Я использовал пакет "выживания", чтобы сгенерировать кривую Каплана-Мейера из набора данных. Я также создал и использовал польз…
20 июл '18 в 12:24
0 ответов

Xgboost Cox запись времени выживания

В новой реализации модели выживания cox ph в xgboost 0.81, как можно указать время начала и окончания события? Спасибо
30 ноя '18 в 18:15
1 ответ

Как бороться с цензурой?

Я работаю над проектом по прогнозированию дня (сбоя трансплантата) с использованием подходов машинного обучения с набором данных, содержащим около 900 переменных, я новичок в этой области и не уверен, нахожусь ли я на правильном пути. Сначала я испо…
26 фев '18 в 22:46
1 ответ

Есть ли способ предсказать будущие вероятности выживания в R?

Вот примерный набор данных ниже: age = runif(200, min = 25, max=70) profile_id = seq(1, 200) gender = sample(c("M", "F"), size = 200, replace = T) start_date = sample(seq(as.Date('2013/01/01'), as.Date('2014/01/01'), by="month"), 200, replace = T) e…
13 дек '18 в 16:46
1 ответ

Как преобразовать мои данные в формат процесса подсчета с начальным временем остановки для усечения интервала в R?

Я хотел бы смоделировать повторяющееся событие с субъектами, которые входят и выходят из риска в течение периода наблюдения исследования. У меня есть данные о периодах отсутствия риска (даты начала и окончания), когда субъект не может испытать событ…
19 дек '18 в 08:24
0 ответов

MLR - анализ выживания с данными, зависящими от времени

Я использую mlr и хотел бы иметь возможность использовать расширенную версию модели Кокса PH для правых цензурированных, зависящих от времени ковариат. Это то, что я попробовал, следуя виньетке по зависящим от времени ковариатам https://cran.microso…
24 янв '19 в 23:58
1 ответ

forest_model не принимает факторные переменные с пробелом в имени

Я пытаюсь построить модель пропорционального отношения рисков Кокса, рассчитанную с помощью функции coxph() выживания с использованием функции forestmodel's forest_model. Ковариаты являются факторами, некоторые из их названий имеют пробел в них, т.е…
03 янв '18 в 23:49
1 ответ

Длинный формат Coxph выдает ошибки

У меня правильно хранятся данные в длинном формате, когда я запускаю функцию coxph: tryu <- coxph(Surv(entry,exit,dead==1) ~ age, na.action=na.omit,data=finalmerge) Я получаю следующую ошибку: Предупреждающее сообщение: In Surv(entry, exit, dead …
30 янв '19 в 21:29
1 ответ

Анализ выживания: количество цензурированных событий в таблице жизни

Я хочу построить жизненный стол для какого-нибудь интересного события. Смотрите ниже пример: Я пытаюсь сделать это с survival Пакет R: https://cran.r-project.org/web/packages/survival/survival.pdf. library(survival) surv <- Surv(veteran$time, vet…
25 фев '19 в 17:46
0 ответов

Трудности с новыми данными в Forext.coxph

У меня есть data.frame с именем "df" со структурой 'data.frame': 800 obs. of 4 variables: $ status: num 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 ... $ time : num 4.97 1.53 3.98 2.75 3.86 ... $ uo : chr "C" "B" "C" "B" ... $ q3 : Factor w/ 4 levels "1","2","3","4": 4 1 1…
08 авг '18 в 18:26
0 ответов

Как я могу визуализировать взаимодействие в модели Кокса в r?

Я установил модель и имел значительный эффект взаимодействия. Как я могу нарисовать это в графике? Это следует за игрушечным примером (только для иллюстрации): library(survival) # includes bladder data set library(survminer) fit2 <- coxph(Surv(st…
28 фев '19 в 19:41
1 ответ

Регулировка yscale в панели терминала на графике выживания

Я использую ctree() в упаковке party/partykit построить дерево выживания модели выживания. Общая выживаемость хорошая, выживаемость 95% в худшем случае, поэтому я хотел бы изменить yscale в c(0.9, 1) так что панели полезны на финальном сюжете. Мне н…
13 фев '19 в 18:02
0 ответов

Почему моделирование в R потребляет больше памяти, чем возвращаемый объект

При выполнении анализа выживаемости в R сообщается, что подгонка модели потребляет больше памяти, чем фактический возвращаемый объект. Более того, это, кажется, случается только несколько раз, не для каждого случая. require(survival) require(pryr) r…
31 окт '18 в 19:06