Описание тега pls

Вопросы с тегом
0 ответов

Результаты для PLS изменены с версией sci-kit

Я подключил свои данные к модели PLS, используя sci-kit / python. Я заметил, что мои результаты с Python 3.7/ Sci-kit 0.20.1 составляют примерно половину результатов с Python 2.7 / Sci-kit 0.17. По сравнению с другими кодами, следует ожидать результ…
03 дек '18 в 08:11
0 ответов

Только один компонент создан при использовании PLSR в r

Я пытаюсь провести PLS на некоторых данных спектров. Я создал набор данных со столбцами wavelength, intensity, sample level а также replicate и попытался использовать следующий фрагмент кода: myplsr <-plsr(intensity~wavelength, data=mydata, valid…
21 мар '18 в 10:16
0 ответов

Многоответный PLS - один MSE - Matlab

Мне было интересно, почему я получаю только одну среднеквадратичную ошибку ответа (MSE) для PLS с несколькими ответами (мой y имеет 3 колонки ответа). Это среднее значение за 3 ответа? Если да, то как я могу рассчитать их отдельно относящиеся к plsr…
23 ноя '18 в 09:00
0 ответов

plsRglm с несколькими переменными y

В настоящее время я использую частичную регрессию наименьших квадратов, чтобы предсказать некоторые многомерные данные ответа (здесь композиционные данные), используя гораздо больший многомерный пояснительный набор данных (здесь данные черты). Испол…
19 июн '18 в 19:39
0 ответов

semPLS: как определить модель со скрытыми переменными второго порядка?

Я пытаюсь оценить модель с компонентами первого и второго порядка, извлеченными через PCA. я использую semPLS потому что компоненты второго порядка являются индикаторами формирующей конструкции. plsm Функция, используемая для определения модели, тре…
26 ноя '18 в 15:37
0 ответов

Ввод данных для пакета PLS в R

Я новичок в R. Я создал CSV- файл, содержащий 1 столбец значений хлорофилла (имя столбца - хлорофилл), а все остальные столбцы содержат значения отражательной способности от 400 нм до 2500 нм (999 столбцов) (имена столбцов соответствуют числу длин в…
19 апр '18 в 06:11
1 ответ

PLS в R: извлечение значений статистики PRESS

Я относительно новичок в R и в настоящее время нахожусь в процессе построения модели PLS с использованием пакета pls. У меня есть два независимых набора данных одинакового размера, первый используется здесь для калибровки модели. Набор данных состои…
29 дек '15 в 12:37
0 ответов

Как мне следует интерпретировать коэффициенты пути, полученные при запуске plspm() в R (PLS Path Modeling)?

Я провожу свой первый анализ PLS Path Modeling. Я использую пакет plspm() в R и следую указаниям, приведенным в Sanchez, G. (2013) PLS Path Modeling с выпусками R Trowchez. Беркли, 2013. Данные, с которыми я работаю, - это данные об удовлетворенност…
30 окт '18 в 10:35
0 ответов

Редкая частичная регрессия наименьших квадратов в питоне

Я знаю, что есть библиотека для разреженного PLS (разработанная Chun and Keles 2010; DOI: 10.1111/j.1467-9868.2009.00723.x) в R, есть ли библиотека для SPLS в Python, чтобы я мог ее легко использовать? Кстати, SPLS отличается от "редкой регрессии на…
04 дек '18 в 03:43
1 ответ

Названия компонентов в PLS

Я использую pls Пакет и документация великолепны и просты для понимания, но все упоминается и наносится на график в терминах "компонентов", которые пронумерованы. Как узнать, к каким переменным предиктора относятся "компоненты" 1-n? Похоже, моя лучш…
30 окт '17 в 21:29
0 ответов

PLS-DA с каретой: несбалансированные классы и: "Нет сходимости в 100 итерациях. В измеренных показателях производительности отсутствовали значения".

Я управляю PLS-DA с пакетом каретки в R. Категориальная переменная имеет 4 уровня (но с очень неодинаковым числом наблюдений в каждом классе). Ycalib<-factor(file2[,1664],levels=c("0","1","2","3"),labels=c("open","preg_begin","preg_mid","preg_end…
18 фев '19 в 00:42
0 ответов

Q-Squared vs Число компонентов графика отображает плоские линии для PLS в scikit-learn

Я использую научный набор для оценки моделей перекрестного разложения на наборе данных. К ним относятся PLSRegression, CCA и PLSCanonical. Я хотел бы построить значения Q-квадрата по количеству компонентов, чтобы увидеть, сколько компонентов необход…
31 янв '19 в 15:17
1 ответ

PLS в R: моделирование обучения и прогнозирования значений с двумя переменными Y

Мне нравится моделировать обучение и прогнозировать значения, используя модель PLS для более чем одной переменной Y, но у меня есть некоторые проблемы, когда я пробую этот подход, в моем коде ниже: #First simulate some data set.seed(123) bands=20 da…
14 ноя '18 в 17:41
0 ответов

Использование функции R, которая требует ввода в knitr, для генерации статического отчета

Я пытаюсь использовать функцию rebus.pls в библиотеке plspm. Эта функция генерирует дендрограмму, а затем запрашивает ввод пользователя (количество желаемых классов) перед продолжением. (Извините, я не могу предоставить пример кода, так как для испо…
17 мар '18 в 12:35
1 ответ

Сравнивая все переменные в функции ПЦР из пакета pls, R

Я пытаюсь провести регрессионный анализ главных компонентов (PCR) в R. Обычно я делаю PCA (анализ основных компонентов), однако у меня есть мультиколлинеарность и я прочитал, что PCR может справиться с этим. Я использую pcrфункция от pls пакет. Это …
25 авг '17 в 01:47
0 ответов

Почему возникает ошибка "Path [k1, k2]" при запуске plspm () на R?

У меня есть набор данных, который я хочу проанализировать с помощью пакета "plspm" в R. Я сделал все конструкции блоков и определил путь как отражающий. Моя таблица содержит данные, которые я использовал (pao) из столбцов 1–126 (c1 – c126) в качеств…
08 ноя '18 в 01:00
0 ответов

Корреляционный график загрузки из PLSR с наблюдениями с использованием ggplot2

Я изучаю корреляцию между сенсорными данными и химическими измерениями, используя регрессию PLS из pls пакет. В конечном итоге я хочу отобразить результаты на графике корреляционной загрузки, как показано в примере ниже. До сих пор мне удавалось пос…
20 окт '18 в 13:51
1 ответ

R с параллельным & pls - как обрабатывать не завершающиеся процессы Rscript в Windows

Я хочу запустить несколько моделей наименьших квадратов в R и пытаюсь использовать преимущества параллельного пакета. Однако после выполнения моего кода я вижу экземпляры Rscript в моем диспетчере задач, которые не завершаются, пока я не закрою RStu…
16 авг '18 в 00:24
0 ответов

Применить модель PLSDA для прогнозирования других данных?

Я разрабатываю дискриминантную модель с использованием PLSDA (пакет mixOmics, модель хорошо работает с помощью внешних проверок. Чтобы выполнить внешнюю проверку, я использую функцию предиката (). Однако, предположим, теперь я должен передать это ур…
08 мар '18 в 02:04
0 ответов

sPLS-DA: проблема со смешением числовых и категориальных переменных: ошибка в одном%*% x: требуются числовые / сложные матричные / векторные аргументы

Я использую пакет spls для выполнения sPLS-DA для прогнозирования двоичного результата. Моя матрица X состоит из смеси непрерывных переменных и категориальных переменных. Мой Y это фактор с 2 уровнями. Я центрировал и масштабировал непрерывные перем…
30 авг '18 в 15:01