Описание тега r2jags

Описание тега Вопросы с тегом
R2Jags is an R package that interfaces with the JAGS Gibbs sampler.
4 ответа

Использование jags.parallel изнутри функции (ошибка языка R в get(name, envir = envir): объект 'y' не найден)

Использование jags.parallel из командной строки или сценария работает нормально. Я могу запустить этот модифицированный пример с http://www.inside-r.org/packages/cran/R2jags/docs/jags просто отлично # An example model file is given in: model.file &l…
21 май '14 в 17:50
0 ответов

Гамма-распределение в JAGS - Ошибка в узле

Я пытаюсь параметризовать гамма-распределение в JAGS - кусочно-линейным предиктором, но моя модель не запускается со следующим сообщением об ошибке: Error: Error in node (ashape/(aexp(mu[59]))) Invalid parent values Модель работает, когда timber.rec…
11 дек '16 в 21:29
1 ответ

Несоответствие размеров при попытке использовать dmulti с rjags

Я пытаюсь подогнать модель ниже, используя rjags, но получаю ошибку несоответствия размеров. Модель хорошо работает в WinBUGS, и я не могу понять, как изменить код. Заранее благодарю за любую помощь. Данные: dataset <- list(n1 = 462, n2 = 537, y1…
15 июл '15 в 18:16
0 ответов

Ошибка в коде JAGS при использовании пакета R2jags

Я пытаюсь сделать байесовскую полиномиальную логистическую регрессию с помощью пакета R2jags на R. Так я объявляю свои данные... library(R2jags) library(mlbench) data(Glass) attach(Glass) n <- as.double(nrow(Glass)) # Sample size p <- as.doubl…
25 ноя '17 в 16:11
1 ответ

Ошибка в векторе ("список", n.chains): неверный аргумент "длина"

Я использую R2jags и CODA для создания некоторой диагностической статистики для моих цепочек MCMC, но у меня возникли проблемы. Я хочу запустить MCMC следующим образом: modelfit <- jags(data=jags.data, inits=jags.inits, model.params, n.iter = 100…
18 июн '13 в 13:45
2 ответа

Байесовская скользящая пуассоновская регрессия в зазубринах (через R2jags)

Эта проблема У меня есть небольшой набор данных (N=100). Мне нужно запустить регрессию Пуассона, но исключая одно наблюдение за раз (следовательно, регрессию Роллинг- Пуассона). В уравнении есть несколько предикторов, но я забочусь об одном (назовит…
10 фев '18 в 17:12
1 ответ

Странная ошибка jags.parallel / избегать ленивых вычислений при вызове функции

У меня есть вызов функции (для jags.parallel), который работает, когда дан числовой аргумент, такой как n.iter = 100 но терпит неудачу, когда аргумент использует значение переменной, n.iter = n.iter, Похоже, что это может быть ошибка в jags.parallel…
23 май '13 в 20:12
0 ответов

Сохранение jags.model в файле RData

Есть ли способ сохранить объект jags.model() в файл RData или TXT? Чтобы выполнить MCMC на лучшем компьютере, я должен сохранить свою модель на одном и использовать ее в новом рабочем пространстве. Но у меня есть некоторые трудности с использованием…
29 ноя '13 в 14:04
2 ответа

Перевод бинарной модели Winbugs в Rjags

Я работаю над учебником "Байесовские идеи и анализ данных", написанным Christensen et al. В книге есть простое упражнение, которое включает в себя вырезание и вставку следующего кода для запуска в Winbugs: model{ y ~ dbin(theta, n) # Model the data …
03 фев '17 в 07:46
1 ответ

Не удалось проверить дискретные параметры в распределении dbin JAGS

Я пытаюсь воссоздать интегрированную модель населения из книги Кери и Шауба "Байесовский анализ населения с использованием WinBUGS" в "Главе 11 - Оценка демографических показателей, численности населения и проекционных матриц из нескольких типов дан…
10 июн '18 в 12:40
3 ответа

JAGS - иерархическое сравнение моделей, не перепрыгивающее между моделями даже с псевдопримерами

Я использую инфраструктуру иерархического моделирования, описанную Крушке, чтобы настроить сравнение между двумя моделями в JAGS. Идея в этой структуре состоит в том, чтобы запустить и сравнить несколько версий модели, указав каждую версию как один …
21 сен '15 в 07:20
2 ответа

Как перепараметризовать распределение Беты по его среднему значению и стандартному отклонению в JAGS?

В одном эксперименте участники могут использовать комбинацию стратегий X и Y для решения проблем. θ - это вес X (в диапазоне от 0 до 1, распространяемый как бета-версия), который можно каким-то образом вывести из человеческих данных (возможно, здесь…
14 янв '18 в 05:17
1 ответ

Rmarkdown ошибка RJAGS

Каждый раз, когда я пытаюсь создать уценку в R, я получаю следующее сообщение об ошибке: "Error in jags.model(model.file, data = data, inits = inits.values, n.chains = n.chains, : Nothing to compile calls: <Anonymous>... withVisible -> eval…
13 окт '16 в 16:46
1 ответ

Ошибки JAGS: "Разрешение необъявленных переменных" и "Недопустимый векторный аргумент в exp"

Я впервые использую JAGS, и при моделировании моих данных я столкнулся с некоторыми ошибками. Вот краткое описание моих данных: в общей сложности n человек (например, 2) каждый решил m проблемы (например, 6). На все задачи есть 3 ответа, каждое из к…
22 авг '17 в 08:19
0 ответов

Не удается загрузить R2jags, потому что rjags не найден

Не могу за всю жизнь заставить R2jags бежать. Я пробовал все разные версии rjags, JAGS, R... каждый раз, когда я получаю одну и ту же ошибку: .onLoad не удалось выполнить в loadNamespace() для 'rjags'. Все остальные файлы в пакете R2jags загружаются…
03 окт '16 в 10:57
1 ответ

Как я могу извлечь данные из mcmc RJAGS

Я использую следующую модель, где я получал результаты измерений для каждой недели голосования. Который производит более 100 альфа-векторов для каждой партии. Может быть, вопрос в том, как я мог бы накапливать их так, чтобы я мог нарисовать линейный…
31 мар '14 в 20:28
1 ответ

Как использовать RJAGS для запуска логистической модели

Я использую логистическую модель по rjags, но ошибка всегда происходит (см. Ниже), и я чувствовал, что мои коды содержат все необходимое, и они логичны, поэтому до сих пор я не могу обнаружить ошибку в своих кодах. вот ошибка Error in jags.model(tex…
03 сен '16 в 00:37
1 ответ

Цикл r2jags с использованием оценочной переменной

Я пытаюсь выяснить, как оценить точку изменения в моих данных, и для этого я хотел бы оценить случайные эффекты за период до точки изменения, а затем за период после точки изменения. Тем не менее, я не знаю, когда должна быть точка изменения, поэтом…
06 май '14 в 15:44
1 ответ

Как соответствовать модели с и без взаимодействия в регрессионной модели JAGS

Я использую этот урок, чтобы обернуть голову вокруг кода JAGS. В разделе "Та же модель с дополнительным категориальным предиктором" говорится, что "Эта модель включает в себя взаимодействие между полом и длиной тела". Как я могу удалить это, чтобы н…
22 фев '18 в 17:30
1 ответ

Rjags Недопустимая ошибка родительского значения с использованием гиперпримера

Я использую rjags для расчета численности вида с использованием модели N-смеси и подсчета данных. Чтобы захватить дисперсию моих данных, я использовал гиперприоры. Но я получаю "Error in node S[1,1,2] Invalid parent values" Я предполагаю, что у меня…
13 июл '16 в 08:45