Описание тега r-markdown

R Flavored Markdown или "R Markdown" - это вариант уценки, используемый для создания контента и / или документации по программированию, чередующихся с кодом R.
1 ответ

rmarkdown::render() в цикле - не может выделить вектор размера

У меня есть несколько каталогов с файлами Rmd для компиляции в HTML. Каждый звонок rmarkdown::render включает в себя большой список params, Все отлично работает, когда я рендерим файлы Rmd по отдельности. Однако, когда я выполняю функцию, которая за…
17 апр '18 в 21:30
0 ответов

Выход.pdf не существует - ошибка, когда я вяжу свой файл rmd в pdf

У меня появляется следующая ошибка, когда я вяжу свой файл rmd в pdf в Rmarkdown Выход создан: Academics/PhD Resources/MMED/rabiesElimination/Writing/Report_V7.pdf Ошибка в инструментах:file_path_as_absolute(выходной_файл): файл 'C:/Users/bkamangira…
01 авг '18 в 16:44
2 ответа

Запустите RMarkdown с аргументами в командной строке

Я пытаюсь запустить файл Rmarkdown (myfile.Rmd) из терминала командной строки. Этот файл должен принимать аргумент для работы. Мы можем использовать этот простой файл в качестве примера: --- title: "Simple example" output: pdf_document: default --- …
18 апр '18 в 16:43
2 ответа

Включить несколько графики с R-markdown

У меня есть R-вектор путей к файлам PDF, которые я хотел бы вставить в свой документ knitr и связать с html. Я вижу, что могу получить один PDF для включения в knitr::include_graphics(filepaths[1]) Мой вектор filepaths длинный и меняет размер между …
19 окт '17 в 14:01
0 ответов

Создание таблицы с графиками и ссылками рядом с ней в rmarkdown

У меня есть фрейм данных с некоторыми данными для построения, а также ссылка на веб-сайт. Я хочу создать документ с разметкой r с графиком в левом столбце и ссылкой, а может быть, еще немного текста и статистики в правом столбце. Для следующей строк…
05 окт '15 в 14:36
0 ответов

Как я могу сделать svglite рендеринга портативных svgs на travis-ci?

Графики, отображаемые через svglite, выглядят по-разному, когда отображаются через Travis, а затем локально. Это происходит потому, что мой локальный компьютер (в данном случае macOS) использует псевдонимы различных (более стандартных?) Шрифтов для …
25 ноя '18 в 13:59
1 ответ

Таблицы не вязать и распечатывать в Rmd блокноте?

Я пытаюсь просмотреть таблицу в моей записной книжке Rmd, не связывая весь документ. Когда я звоню: xtable(anthro_table_f) Я получил: % latex table generated in R 3.5.1 by xtable 1.8-3 package % Sun Sep 16 16:10:36 2018 \begin{table}[ht] \centering …
16 сен '18 в 20:11
0 ответов

Составной график, отображающий значения во всплывающей подсказке в документе уценки в R

Мне нужно построить гистограммы со сложенными значениями в rmarkdown документ. Это можно сделать с помощью ggplot, конечно, как: df1 <- read.csv('Data_New.csv') df1$year <- factor(df1$year) ggplot(df1,aes(x = year,y=value, fill = type)) + geom…
21 окт '15 в 18:42
1 ответ

`bookdown`/`rmarkdown`/`knitr`: как выполнить некодовую последовательную обработку?

Программно мой bookdown Проект осуществляется следующим образом: Чтение в необработанных данных - производит все виды статистики. Предварительная обработка данных (логарифмизация, нормализация, импутация) - создает различные графики для мониторинга …
17 июл '18 в 17:22
1 ответ

Переменная как заголовок в rmarkdown

Вкратце: как я могу напечатать html-заголовок внутри чанка в rmarkdown (используйте переменную для создания заголовка внутри чанка кода)? В длинных: Допустим, в моем наборе данных есть несколько переменных (имена также хранятся в векторе 'Vars'), и …
30 ноя '16 в 15:27
2 ответа

Контроль цвета текста в презентации ioslides

Я готовлю презентацию ioslides. По независящим от меня причинам весь текст на титульном слайде должен быть белым, а на всех последующих слайдах должны быть белые заголовки. Следующий CSS исправляет все, кроме цвета текста для автора и даты. slides &…
20 апр '17 в 15:10
0 ответов

Прямой LaTeX-код в RMarkdown

Допустим, у меня есть таблица LaTeX, которую я хочу включить в свой отчет Rmarkdown. Что-то вроде этого: \begin{table}[!htbp] \centering \footnotesize \begin{tabular}{@{\extracolsep{5pt}} cccc} \\[-1.8ex]\hline \hline \\[-1.8ex] & (1) & (2) …
02 май '18 в 15:35
1 ответ

RMarkdown: согласовать оглавление с помощью CSS

У меня есть документ Rmarkdown с оглавлением (TOC) с левой стороны. Файл rmd имеет заголовок YAML: --- title: "Foo" author: "Bar" date: "`r format(Sys.time(), '%d-%B-%Y')`" output: html_document: css: bam.css theme: flatly toc: true --- Вот полный b…
23 май '18 в 05:57
1 ответ

Возможно ли в RStudio ускорить предварительный просмотр PDF на Суматре после компиляции?

Мне пришлось переустановить все на моем компьютере. После переустановки R, Rstudio, Pandoc и MikTex предварительный просмотр вязаных PDF-файлов с использованием RStudio и Sumatra занимает ОЧЕНЬ много времени. До переустановки весь процесс ток всего …
28 янв '16 в 23:16
1 ответ

Можно ли автоматизировать файлы уценки R?

Мне нужно сгенерировать тысячу файлов R Markdown, по сути, одинаковых, только с разными заголовками и различным подмножеством данных. Есть ли способ сохранить эти заголовки и подмножества в объектах и ​​автоматизировать создание и вязание файлов R M…
27 мар '18 в 12:41
1 ответ

Изображение через шорткод в RMarkdown с использованием blogdown не отображается

Я хочу отображать изображения с помощью шорткода в файле RMarkdown, используя blogdown. Я использую код: ```{r echo=FALSE} blogdown::shortcode("figure", src = "/img/to/path/my-picture.png", alt = "Some alt text") ``` Я не получаю сообщение об ошибке…
08 сен '17 в 08:20
2 ответа

Ширина блока кода knitr, в котором есть вызов source() в блоке

У меня есть файл сценария R f2.R со следующим содержанием: f2 <- function(Delta, delta, sigma){ pnorm(Delta, mean=delta, sd=sigma) - pnorm(-Delta, mean=delta, sd=sigma) } Теперь у меня есть следующее Rmd файл: --- output: html_document --- ```{r …
06 ноя '16 в 11:40
1 ответ

Как используется блестящий::markRenderFunction?

Вопрос Как я могу изменить размер графиков rgl в Shiny RMarkdown? обсуждается тот факт, что трудно установить размер rglwidget в динамическом документе R Markdown. Проблема заключается в том, что функция вывода Shiny устанавливает размер, но нет оче…
25 мар '17 в 18:35
1 ответ

Как переместить таблицу в документ уценки R?

Предположим, я печатаю фрейм данных с именем summary_table следующим образом: summary_table = data.frame(a=c(1,2,3), b=c(11,12,13),c=c(21,22,23),d=c(31,32,33),e=c(41,42,43),f=c(51,52,53),g=c(61,62,63),h=c(71,72,73),i=c(81,82,83),j=c(91,92,93),k=c(10…
30 дек '13 в 22:30
2 ответа

Можно ли сгенерировать RTable (FlexTable) в PDF с RMarkdown?

Мне просто интересно, можно ли сгенерировать RTable (FlexTable) в pdf с помощью RMarkdown? Я могу сгенерировать его в выводе HTML, но он не работает для вывода PDF. Я гуглю этот вопрос, но нет точного ответа на него. Мой код: ```{r, echo=FALSE, resu…
09 ноя '16 в 21:16