Описание тега gtsummary
Используйте этот тег, чтобы задать вопросы об использовании пакета gtsummary для R. Пакет gtsummary выпускается CRAN и может быть установлен с помощью `install.packages("gtsummary")`
1
ответ
Как изменить тип переменной по умолчанию, определенный all_categorical() в gtsummary? когда требовалось среднее значение порядковой переменной?
Переменная "Var2" по умолчанию была установлена как категориальная переменная, в то время как среднее значение (sd) требовалось иногда. Так что мне интересно, как это изменить. data_table_1 = data %>% dplyr::select(group, var1, var2) data_table…
19 май '20 в 20:28
1
ответ
Как отформатировать количество цифр для категориальных переменных в 'gtsummary::tbl_summary'?
Я не могу понять, как указать функции tbl_summary отображать десятичные знаки при суммировании категориальных переменных. Он довольно хорошо работает с непрерывными переменными, такими как mpg, но не с цил. library(tidyverse) library(gtsummary) # wi…
11 мар '20 в 22:59
1
ответ
как суммировать несколько моделей логистической регрессии в таблице?
У меня есть набор данных с непрерывным возрастом и фактором, полом как фактором и 4 группами. structure(list(Age = c(9, 12, 16, 57), Age_1 = structure(c(2L, 3L, 3L, 7L), .Label = c("8", "1", "2", "3", "4", "5", "6", "7" ), class = "factor"), Sex = s…
31 мар '20 в 23:04
2
ответа
R/gtsummary: исключить некоторые p-значения и изменить сноску
Кто-нибудь знает, можно ли исключить некоторые p-значения из сводной таблицы (tbl_summary() с add_p())? Кроме того, можем ли мы изменить сноску об используемых тестах? library(gtsummary) mtcars %>% tbl_summary(by = am) %>% add_p()
30 апр '20 в 22:43
2
ответа
Как сгенерировать t-значение, F-значение или хи-квадрат в сводной таблице с помощью пакета R "gtsummary"?
Я работаю над созданием сводной таблицы с использованием отличного пакета R "gtsummary", он действительно очень помогает мне в эффективном и точном создании сводных таблиц. Но мне интересно, могут ли некоторые статистические данные, такие как t-знач…
05 май '20 в 07:41
1
ответ
Как вывести таблицы {gtsummary} как изображения?
Я пытаюсь вывести таблицы {gtsummary} (в частности, tbl_regression()вывод) как изображения. Я используюkableExtra::as_image()но результат не очень красивый. Представление ниже, но у меня нет репутации, чтобы размещать изображение. Есть ли способ про…
19 мар '20 в 08:01
1
ответ
Почему функция "округление" не работает с цифрами p-значения? и как отрегулировать цифры процентов в сводных таблицах с помощью gtsummary?
Когда я создавал "настраиваемую функцию pvalue для add_p()", я пытался настроить цифры p-значения, но обнаружил, что функция "круглой" дозы не работает. (см. код "result $ p <- round (result $p, 3)") Кроме того, я обнаружил, что не могу изменить …
06 май '20 в 18:25
1
ответ
Как изменить заголовки таблиц в пакете gtsummary?
Очень простой вопрос, но я не могу найти простой способ сделать это. Я хочу изменить текст по умолчаниюtbl_summaryобъект, чтобы сказать "Переменная" вместо "Характеристика" в первом столбце. Пример: library(gtsummary) library(dplyr) head(trial) tria…
19 май '20 в 19:14
1
ответ
Установить указанный уровень фактора в качестве эталона в регрессии GT?
Я использую пакет gtsummary для создания таблиц из логистических регрессий. Я хотел бы, например, использовать уровень этапа "T3" в данных испытания в качестве контрольного уровня вместо уровня "T1" по умолчанию. Как я могу сделать это в этом пример…
31 май '20 в 13:14
1
ответ
Как сгенерировать размер эффекта [90% ДИ] в сводной таблице с помощью пакета R "gtsummary"?
Я работаю над созданием сводной таблицы с использованием пакета R "gtsummary". На самом деле это очень хорошо. Функция add_stat дает вам большую свободу для включения надстроек. Например, в моем районе мы хотим сообщить размер эффекта с помощью дове…
01 июн '20 в 20:20
1
ответ
Пакет R gtsummary: как управлять / скрывать строки в сводной таблице
Я работаю над проектом с gtsummary. Для одной из таблиц мне нужно создать длинную таблицу, в которой перечислены ковеременные до и после процесса matchit. Моя проблема в том, что для всех переменных (например,ожирения) он читает одну строку, ожирени…
18 июн '20 в 21:07
1
ответ
Как изменить имя строки в tbl_regression?
В примере онлайн есть: mod1 <- glm(response ~ trt + age + grade, trial, family = binomial) t1 <- tbl_regression(mod1, exponentiate = TRUE) Он создает красивую таблицу регрессии, которая работает, но как я могу написать код, чтобы просто отобра…
23 июн '20 в 02:32
1
ответ
Как установить "na.rm = TRUE" в синтаксисе R glue
Я использую gtsummary::tbl_summary для создания сводной таблицы статистики. stats_summary_table <- dat_wide%>% tbl_summary(by = mss_plate_id, missing = "no", statistic = list(all_continuous() ~ " {mean} ± {sd} {cv}" )) В cv…
29 июл '20 в 22:13
1
ответ
Как в R создать таблицу непредвиденных обстоятельств с пятью бинарными факторами с помощью gtsummary (или любого другого пакета r)
Я пытаюсь воспроизвести таблицу: который показывает количество людей, сгруппированных по пяти двоичным переменным. Я могу загрузить данные и отобразить счетчики с такими ужасными метками: Drugs2 <- read.table("http://users.stat.ufl.edu/~aa/cat/da…
03 сен '20 в 19:58
1
ответ
Невозможно связать в PDF с помощью пакета {gtsummary} в r
Я не могу связать в pdf с помощью пакета gtsummary. Вот представитель: library(gtsummary) reg <- lm(hp ~ cyl, mtcars) tbl_regression(reg, intercept = TRUE) Эта ошибка возникает только тогда, когда я использую intercept = TRUEаргумент. Если я удал…
24 фев '20 в 01:56
2
ответа
Как добавить индексы к меткам в таблицах с помощью пакета gtsummary в R?
Я хотел бы ввести нижний индекс в имени переменной для сводной таблицы регрессии, созданной с помощью tbl_regression в пакете R gtsummary. Может ли кто-нибудь дать указания, как это сделать? Код, использованный для создания таблицы, и итоговая табли…
04 мар '20 в 23:30
2
ответа
модели регрессии в r вывод из таблицы в слово
Я использовал sjplot для создания комбинированной таблицы. Это создает таблицу HTML. Я хотел бы сделать таблицу, которую можно было бы экспортировать в word. Я просмотрел этот пост, в котором обсуждается копирование и вставка в слово, но это меняет …
02 апр '20 в 20:38
3
ответа
ошибка в add_p()'для переменной X и теста' fisher.test', p-значение опущено
Я получаю сообщение об ошибке ниже, когда пытаюсь использовать функцию add_p(), чтобы получить значение p для различий между моей переменной by (с 10 уровнями) и категориальной переменной с двумя уровнями (да / нет). Я не знаю, как привести воспроиз…
22 апр '20 в 11:49
1
ответ
Можно ли использовать функцию tbl_regression с функцией lmer со случайным эффектом?
Я работаю над противогрибковой активностью некоторых молекул ("цикло"), добавленных фунгицидами, и хочу оценить влияние этих цикло и соотношение их концентраций. CMI - это количественная переменная, а все остальные переменные - факторы. У меня есть …
22 апр '20 в 18:34
1
ответ
Лучший способ получить вывод LaTex из объекта tbl_summary в пакете gtsummary
Я пытаюсь подготовить документ к публикации и делаю все в LaTeX. Однако я только сейчас заметил, чтоgtsummaryеще не поддерживает вывод LaTeX для своих таблиц. Мне интересно, как лучше все же преобразовать таблицы HTML в LaTeX? Одна из идей - создать…
20 май '20 в 18:51