Описание тега spm
SPM (Statistical Parametric Mapping) - это библиотека Matlab для предварительной обработки и анализа данных функциональной магнитно-резонансной томографии (fMRI).
0
ответов
Ссылка на статическую библиотеку Swift с внутренней зависимостью статической библиотеки требует ссылки на оба
У меня есть 2 статические библиотеки, написанные на swift с использованием spm. Давайте назовем их LibA и LibB, где LibB импортирует LibA и строится с помощью этой команды: swift build -Xswiftc -I -Xswiftc path/to/LibA -Xswiftc -L -Xswiftc path/to/L…
11 янв '19 в 01:36
1
ответ
Можно ли применить матрицу произвольного преобразования к изображению в SPM?
У меня есть несколько специфическая задача, которую я хотел бы выполнить в SPM. В основном у меня есть входной файл NII scan.nii и я хотел бы применить к нему произвольное аффинное преобразование, определенное x y z p r yw, x,y,z,p,r,yw представлять…
30 окт '17 в 22:37
0
ответов
Как прочитать несколько файлов nifti в Matlab с помощью spm_select?
Я хочу использовать spm_select в цикле в Matlab, чтобы выбрать несколько файлов NIFTI. Тем не менее, кажется, что цикл не может работать правильно. В каждой папке темы (всего 18 субъектов в subjList = {'2','3','6',...}, в каждой папке темы есть 4 пр…
24 дек '18 в 10:19
1
ответ
Как правильно использовать файл nifti при глубоком обучении?
Я имею дело с использованием медицинских изображений с глубоким обучением. Существует несколько типов форматов файлов, таких как nifti, dicom, анализ, mnic и т. Д. Я использую mif-файлы nifti для своих экспериментов по глубокому обучению. В течение …
06 фев '19 в 13:00
1
ответ
DICOM датируется в нифити для анализа SPECT
Похоже, что программное обеспечение того места, где я работаю, выводит данные DICOM вместо простых файлов.dcm. Datatable включает в себя все изображения для объекта. Таким образом, если у субъекта есть иктальные и межприступные ОФЕКТЫ, они поступят …
06 июн '16 в 02:51
0
ответов
SPM: среднее и стандартное отклонение значений серого после сегментации
В статье я читаю: "Алгоритм сегментации SPM99 включает в себя вычисление средних значений и стандартных отклонений значений серого для каждого класса тканей". Кто-нибудь знает, как это возможно в SPM12? Заранее спасибо.
18 окт '18 в 14:42
1
ответ
Ошибка импорта: нет модуля с именем 'spm1d
У меня есть Python 3.5.2 |Anaconda 4.2.0 (x86_64)| на моем ноутбуке Mac, и я сталкиваюсь с этой проблемой: импорт spm1d Traceback (последний вызов был последним): Ошибка импорта: нет модуля с именем 'spm1d' Я искал о проблеме, и я не нашел никакого …
08 апр '17 в 02:55
0
ответов
Когда spm_jobman будет запускать задания параллельно?
Я использую spm_jobman() запустить большое количество заданий SPM. У меня есть машина с большим количеством процессоров, поэтому я хотел бы иметь возможность запускать их параллельно. Можно spm_jobman() выполнять задания параллельно? Если так, как э…
21 апр '16 в 19:59
0
ответов
Вызов внешней функции в SPM matlabbatch
Я попытался использовать частную функцию MATLAB (частная означает, что я написал ее сам) через объект matlabbatch в SPM12, который я скомпилировал: run_spm12.sh $MCR_ENV run batch.m с файлом batch.m, содержащим следующие строки: matlabbatch{1}.cfg_b…
11 апр '16 в 14:28
1
ответ
SPM Dicom Конвертировать в Python (Ipython/ Nipype)
Я новичок в Python или, более конкретно, ipython. Я прошел через шаги, чтобы выполнить то, что должно быть очень простым Dicom Conversion в статистическом пакете SPM для файла изображения МРТ, как описано в NiPype. Я не могу заставить его работать, …
28 май '15 в 13:29
1
ответ
Невозможно импортировать изображения dicom в SPM
У меня есть некоторые изображения dicom, которые SPM не может импортировать, для каждого файла dcm я вижу следующую ошибку: S11956_I11604.dcm ", по-видимому, не имеет позиционной информации. Кажется, мои dcm файлы не имеют поля DimensionIndexSequenc…
13 июл '18 в 12:01
1
ответ
SPM12 отладка на Matlab
У меня проблема с использованием SPM на Matlab. у меня есть m-file что мне нужно отлаживать и я не написал. Этот код старый, и, вероятно, ошибка объясняется различием в синтаксисе более новых версий. Ошибка выскакивает с помощью этой функции spm_get…
26 авг '16 в 21:16
1
ответ
Как я могу сегментировать ткани мозга с SPM без графического интерфейса?
Мы пытаемся сегментировать типы тканей мозга с помощью SPM, и почти невозможно найти в Интернете, как вызывать базовые функции matlab без использования GUI. Некоторые ресурсы, которые я нашел, которые не помогли: Руководство по СЗМ Книга SPM на Вики…
23 дек '14 в 15:18
1
ответ
Вложенная Anova в python с помощью Spm1d. Невозможно распечатать статистику f и значения p
Я ищу простое решение для выполнения многофакторного анализа ANOVA в Python. Мне нужна двухфакторная вложенная ANOVA, и Python-модуль SPM1D - один из способов сделать это, однако у меня возникла проблема. http://www.spm1d.org/doc/Stats1D/anova.html …
16 янв '18 в 02:29
0
ответов
Как я могу иметь дело с одной осью файла nii (мозг) на SPM (статистическое параметрическое отображение)?
Мне нужна сегментация серого вещества и белого вещества в некоторых файлах.nii. Я сталкивался с SPM (статистическое параметрическое отображение). Это выглядит хорошо, и я пытаюсь обнаружить это. После некоторых исследований я понимаю, как сегментиро…
05 фев '19 в 13:38
0
ответов
Удаление черепа из серого вещества МРТ
Я работаю над изображениями мозга (нифти). Я сегментировал мозг с помощью SPM12. Таким образом, сегментация прошла хорошо, но для некоторых (многих) субъектов я получаю следующее: Это 3D изображение (T1 MRI) из базы данных "ADNI". Как вы можете виде…
06 ноя '17 в 11:00
1
ответ
MATLAB выбирает элементы с учетом конца их имени
Я должен извлечь время начала эксперимента МРТ. У меня есть вложенный вывод с именем "ResOut", который содержит разные матрицы. Один из них называется "cond", и мне нужен 4-й элемент [1,2,3,4]. Но мне нужно знать время его начала, только когда элеме…
28 ноя '17 в 15:23
2
ответа
Быстрое построение, использование неразрешенного идентификатора
Я использовал пар для создания проекта. создайте файл swift, используя xcode. структура, как это: ├── Sources │ └──App │ │ └── Controllers │ │ └── Models │ │ │ └── File.swift │ └──Run │ └── main.swift └── Package.swift с main.swift let config = try …
29 авг '17 в 05:39
1
ответ
SPM в Matlab: как вызвать функцию Matlab в Batch Editor
Я пишу пакет, используя Batch Editor в SPM8, используя matlab. Теперь я хочу включить простую функцию Matlab, которую я написал сам. Я уверен, что эта функция сохраняется в пути SPM. В качестве входной переменной функция использует файл из предыдуще…
14 янв '15 в 15:51
1
ответ
Скомпилированная ошибка MATLAB: неопределенная функция 'ft_datatype_sens' для входных аргументов типа 'struct'
У меня есть программа MATLAB, написанная одним из моих пользователей, которая использует набор инструментов SPM8. Если запустить напрямую, он работает нормально. Однако при компиляции и последующем запуске возникает следующая ошибка: Undefined funct…
21 июн '17 в 12:19