Стандарт цифровых изображений и коммуникаций в медицине (DICOM) определяет форматы для хранения и передачи медицинских изображений. Вопросы, не связанные с программированием, о DICOM не относятся к теме stackru. Для вопросов, связанных с конкретным набором инструментов, используйте более конкретный тег в дополнение к этому тегу или вместо него.
1 ответ

Java - Как преобразовать файл DICOM в файл JPEG2000?

Мне нужно преобразовать файл DICOM (.dcm) в формат jpeg2000, у кого-то есть фрагмент кода, который выполняет эту операцию? Я нашел в Интернете только способ преобразования dcm в jpeg (первый ответ на этот вопрос: как преобразовать файл dicom в преоб…
12 ноя '15 в 07:47
1 ответ

Гистограмма - индекс должен быть положительным целым или логическим

Я делаю нормализацию гистограммы. Когда я пытаюсь с другим изображением lena256.bmpкод работает. Но когда я пытаюсь с другим изображением, он покажет ошибку: Попытка доступа; Индекс должен быть положительным целым числом или логическим. Ошибка в tes…
16 мар '18 в 05:12
2 ответа

DICOM - SequenceDelimitationItem с определенной длиной

Можно ли использовать SequenceDelimitationItem вместе с определенной длиной в DICOM? Это один из способов: если не определена длина, то должен присутствовать SequenceDelimitationItem? Или это два пути: если и только если IDI присутствует, если и тол…
30 сен '14 в 15:22
2 ответа

DICOM регистрация изображений с использованием ITK

Я работаю над проектом (VS2012 и C#), который включает в себя регистрацию изображений. Мне нужно извлечь облако точек из стека изображений DICOM в каталоге. Я исследовал ActiViz, VTK, ITK и т. Д., И я не могу найти пример того, как это сделать. Кто-…
09 дек '13 в 22:18
0 ответов

Чтение и анализ многих файлов DICOM параллельно с использованием dyplr и oro.dicom

У меня есть датафрейм, содержащий 1065 наблюдений путей к файлам DICOM. Я хочу прочитать каждый из файлов, чтобы иметь возможность анализировать определенные значения из метаданных. Поскольку файлов много, я хочу читать их параллельно. Кажется, у ме…
12 июл '18 в 13:56
2 ответа

Повторите выборку всех изображений в базе данных до одинакового размера вокселя.

У меня есть 3 стека 512x512x133, 512x512x155 and 512x512x277, Я хотел бы пересчитать весь стек, чтобы сделать размеры 512x512x277, 512x512x277 and 512x512x277, Как это сделать? Я знаю, что могу сделать повторную выборку, используя толщину среза и ра…
05 июл '16 в 03:28
3 ответа

Интерполяция между двумя изображениями с разным размером пикселей

Для моего приложения я хочу интерполировать между двумя изображениями (от CT до PET). Поэтому я сопоставляю их между собой так: [X,Y,Z] = ndgrid(linspace(1,size(imagedata_ct,1),size_pet(1)),... linspace(1,size(imagedata_ct,2),size_pet(2)),... linspa…
19 май '16 в 12:11
1 ответ

GDCM python DICOM декомпрессия

Я выполнил этот скрипт на Python. Произошла ошибка в строке t = gdcm.Orientation.GetType(dircos) Информация об ошибке: Traceback (most recent call last): File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/IPython/core/interactiveshell.py", line 2820, in run_cod…
04 апр '16 в 02:54
1 ответ

IDL: чтение нескольких изображений DICOM сохраняет их в файле.dat

Я пишу программу в IDL для чтения изображений DICOM, затем сохраняю их в большой матрице и, наконец, сохраняю в файле.dat. DICOMs называются IM0, IM1, IM2,.. IM21777. Я написал код ниже, но я получаю ошибку. Я использую IDL версии 6.4. files = file_…
16 ноя '18 в 12:52
1 ответ

DICOM обработка изображений, визуализация и GUI- C++ и Python

У меня есть постановка задачи - разработать приложение для обработки изображений DICOM для диагностических приложений с нуля. Это включает: Сегментация и регистрация на основе модели обработки изображений (C++) Визуализация - визуализация 2D и 3D из…
01 мар '16 в 05:27
1 ответ

Отобразить маркер поверх изображения dicom из файла CADSR, который необходим для отображения

Я пытаюсь прочитать файл CADSR. Я получаю различный маркер из "Тега графических данных". Я хочу показать только те маркеры поверх файла Dicom, которые необходимы, поэтому дайте мне знать, какие критерии необходимы для отображения необходимого маркер…
09 май '13 в 07:59
1 ответ

Проблема с поворотом трехмерного изображения DICOM с помощью jogl

Я новичок в Jogl. Я кодирую для 3D-рендеринга изображений DICOM. Во время 3D-рендеринга изображений с помощью jogl я создал грубый 3D-вид. Далее следуют следующие шаги: Импортированный стек файлов DICOM. Создал BufferedImages из файлов. Текстура соз…
30 янв '15 в 06:55
2 ответа

Ошибка: не удалось найти функцию "readDICOM"

Я установил запрошенный пакет install.packages('devtools') library(devtools) Рабочий каталог был задан правильно, но когда я пытался открыть данные, R не смог их прочитать. И это то, что я получил в качестве обратной связи. slice = readDICOM ("IM-00…
22 июл '16 в 10:41
1 ответ

Чтение тега имени пациента в DICOMDIR с использованием clearcanvas в C#

Я новичок в CC, а также в мире DICOM, пытаюсь прочитать имя пациента и детали исследования в файле DICOMDIR и сохранить его в базе данных, вот мой код, я делаю это в консольном приложении на C# enter code here { DicomDirectory reader = new DicomDire…
10 авг '11 в 09:50
1 ответ

Тег DICOM RetrieveURL пуст в выводе JSON

Я использую DicomDataSet добавить теги и их значения, как показано ниже: .... var ds = new DicomDataSet(); ds.Initialize(DicomClassType.StudyRootQueryStudy, DicomDataSetInitializeFlags.None); ds.InsertElementAndSetValue(DicomTag.QueryRetrieveLevel, …
18 ноя '18 в 08:08
2 ответа

Использование информации атрибутов DICOM для определения диапазона значений пикселей кости

Я работаю с DICOM CT изображениями, чтобы сегментировать кости. Мне было интересно, могу ли я использовать информацию атрибутов DICOM для определения диапазона значений пикселей кости.
22 дек '14 в 21:29
1 ответ

Как заменить пиксельные данные в том же файле dicom, используя pydicom, чтобы снова прочитать его с помощью любого средства просмотра dicom?

Я хочу обработать некоторые файлы DICOM, поэтому я тестирую pydicom для моей работы, что я считаю значительно полезным. И теперь я хочу загрузить существующие файлы DICOM, заменить массив данных пикселей другим массивом пикселей (например, предварит…
19 фев '18 в 06:51
2 ответа

Как преобразовать DICOM файл в JPG преобразования

Как мы можем конвертировать файл dicom (.dcm) в изображение JPEG, используя Java? Вот мой код: import java.io.File; import java.io.IOException; import org.dcm4che2.tool.dcm2jpg.Dcm2Jpg; public class MainClass { public static void main(String[] args)…
07 окт '14 в 06:23
3 ответа

Закодируйте файл изображения JPG как DICOM PixelData, используя ClearCanvas

У меня есть набор изображений JPG, которые на самом деле представляют собой фрагменты компьютерной томографии, которые я хочу преобразовать в файлы изображений DICOM и импортировать в PACS. Я использую ClearCanvas и установил все необходимые теги (и…
26 авг '14 в 04:48
1 ответ

Изображения RGB JPG для DICOM с dcm4che3

Я использовал решение, предложенное medPhys-pl, решение jpg для взаимодействия с dcm4che3. Я пытаюсь конвертировать файл JPG в файл DICOM. Когда jpg монохромный, мой код успешен, однако, если файл jpg RGB, в файле dicom изменились цвета относительно…
04 мар '15 в 16:03