Невозможно импортировать изображения dicom в SPM
У меня есть некоторые изображения dicom, которые SPM не может импортировать, для каждого файла dcm я вижу следующую ошибку:
S11956_I11604.dcm ", по-видимому, не имеет позиционной информации.
Кажется, мои dcm файлы не имеют поля DimensionIndexSequence. Я пытался преобразовать их в файлы nii с помощью других инструментов, таких как dcm2nii. Но они предоставляют единый файл nii для всего моего образа DCM, который при выборе кадров SPM рассматривает как один кадр. поэтому я не могу указать какой-либо диапазон кадров, который необходим в "указать 1-й уровень".
пожалуйста, дайте мне знать, если у вас есть какие-либо предложения. Спасибо.
1 ответ
Похоже, эта ошибка может возникнуть, если в вашем файле DICOM отсутствует ImageOrientationPatient, ImagePositionPatient или PixelSpacing. Без них ни одна программа не сможет определить правильную геометрию вашего объема.
См. https://github.com/canlab/spm12/blob/master/spm_dicom_convert.m#L1403 для ошибки кода.
Если у вас есть файл расширенного MR, то может потребоваться преобразовать его в серию устаревших изображений MR (для этого можно попробовать MRIConvert или другой инструмент). Я не очень знаком с SPM, поэтому я не знаю, поддерживается ли Enhanced MR, но, безусловно, будет серия стандартных изображений MR.