Описание тега lsmeans

Вопросы с тегом
Пакет R для получения средних по методу наименьших квадратов для многих линейных, обобщенных линейных и смешанных моделей. Вычислите контрасты или линейные функции средних наименьших квадратов и сравнения наклонов. Сюжеты и компактные буквенные дисплеи.
1 ответ

lsmeans: ошибка в eval(predvars, data, env): объект 'location' не найден

Поэтому я запустил Двустороннюю Порядковую Регрессию с CLM с конкретными столбцами: гра, местоположение, виды, и это сработало: gra.f <- clm(gra ~ location + species + location:species, data = gra) Теперь я пытаюсь запустить попарно, используя фу…
20 дек '18 в 16:23
0 ответов

Оценка средних и доверительных интервалов с использованием lme4

Я запускаю смешанную модель логистической регрессии в R с помощью lme4::glmer(), Это модель с четырьмя категориальными переменными. Каждая переменная кодируется эффектами (-1, 1). Существуют случайные эффекты как для участника, так и для стимула (за…
26 май '17 в 20:15
1 ответ

Я получаю не значимые различия в значениях ANOVA, но есть некоторые действительно важные данные. Что не так с моими сценариями?

Я получаю не значимые различия в значениях ANOVA, но есть некоторые действительно важные данные. Что не так с моими сценариями? df <- structure(list(value = c(1.693086732, 0.25167691, 1.100272527, 1.60428654, 0.908237338, 1.449864567, 1.06604818,…
16 авг '18 в 02:49
1 ответ

Каков наиболее подходящий метод для контрастов в lme (nlme)?

У меня есть вопрос, касающийся проведения специальных контрастов в смешанной модели glmm. По сути, мои данные представляют собой серию переменных ответа с фиксированными коэффициентами "Тип объекта" (три типа субъектов), "Обработка" (четыре курса) и…
07 июн '17 в 16:57
1 ответ

Извлечение элементов lsmobj из пакета lsmeans в R

Интересно, как получить элемент lsmobj от lsmeans пакет в R, require(lsmeans) fiber.lm <- lm(strength ~ diameter + machine, data = fiber) fiber.lsm <- lsmeans (fiber.lm, "machine") fiber.lsm machine lsmean SE df lower.CL upper.CL A 40.38241 0.…
23 дек '14 в 18:23
1 ответ

Как показать количество средств +/- SE?

Я хотел показать средние и стандартные ошибки с числами в виде среднего +/- SE в верхней части каждого бара. Пожалуйста помоги! Спасибо. [![введите описание изображения здесь][1]][1] Вот код, который я использовал, но не дал того, что мне было нужно…
25 авг '15 в 23:18
0 ответов

Оцените степени свободы в линейных смешанных контрастах моделей на больших наборах данных, используя R

У меня есть большой набор данных, который я анализировал с использованием линейной смешанной модели (~600000 наблюдений). Обычно я оцениваю средние наименьших квадратов и делаю парные контрасты, используя пакет lsmeans из lsmeans. Я также использую …
28 авг '15 в 19:19
1 ответ

Увеличение max.print не всегда работает в R, равно как и глобальные параметры для lsmeans()

Половину времени без шаблона я не вижу строк в выводе, хотя я увеличиваю max.print и глобальные параметры в R studio. Подробности ниже: Я запускаю модель lmer для больших наборов данных (более 100 000 наблюдений 14 переменных) с пакетами: lme4, lmer…
05 дек '18 в 00:28
1 ответ

Неверный аргумент в модели lsmeans?

Я получаю сообщение об ошибке lsmDrugs=lsmeans(model1, -drug) Ошибка в -drug: неверный аргумент для унарного оператора " Любая помощь, пожалуйста? library(knitr) library(lsmeans) drug <- c(rep("A", 2),rep("B", 2),rep("C", 2)) drugDiff <- c(-14…
20 сен '18 в 01:26
1 ответ

Значения корректируют многократное сравнение

Я использовал lme4, чтобы запустить регрессию со смешанными эффектами (вызывая glmer) в R, и теперь я пытаюсь сделать сравнение вне случая. Так как они попарно, с Тьюки все должно быть в порядке, но я бы хотел вручную откорректировать, на сколько те…
12 мар '15 в 12:55
1 ответ

lsmeans::lsmip: как правильно построить непрерывные значения?

lsmip() команда в lsmeans Пакет, кажется, рассматривает непрерывные предикторы на оси X как категориальные предикторы. Если у меня есть наблюдения от моих непрерывных предикторов с дискретными, но неравномерными интервалами (например, когда вы удаля…
07 апр '17 в 14:33
0 ответов

Как интерпретировать биномиальные результаты GLMM

У меня большой набор данных (24765 баллов). Я пытаюсь понять, как метод очистки влияет на успешность появления (ES). У меня есть несколько факторов: пляж (4 уровня), метод очистки (3 уровня) -> фиксированный У меня также есть несколько случайных вел…
30 мар '17 в 15:58
1 ответ

Наименьшая площадь означает проблемы в R

Мои данные выглядят так с графиками в виде строк и с различными значениями Элленберга в виде столбцов вместе с Year, Лес (Skov) и тип леса (Skovtype). Мои данные за 4 разных года (1993, 1998, 2005 и 2016). У меня есть некоторые проблемы с функцией l…
20 янв '17 в 13:19
1 ответ

Значительное взаимодействие в линейной модели смешанного эффекта, но график показывает перекрывающиеся доверительные интервалы?

Это мой первый крик о помощи в stackru, поэтому, пожалуйста, извините за любые ошибки, которые я сделал, и, пожалуйста, прокомментируйте, если потребуется дополнительная информация. К сожалению, я не могу предоставить вам исходные данные, поскольку …
06 ноя '17 в 09:05
0 ответов

R: Получение lsmeans для каждой строки данных

В настоящее время я пытаюсь использовать lsmeans на отрицательной биномиальной модели, чтобы получить среднеквадратичное значение для каждого участника в моем наборе данных. Я могу выяснить смысл своей жизни, но не отрегулировал средства для каждого…
25 янв '18 в 01:10
1 ответ

Отредактировано: Как написать цикл для теста PostHoc Tukey и множественного сравнения

Это мой образец большой матрицы данных, и каждый столбец назван с несколькими данными и разделен подчеркиванием. structure(list(Gene = c("AGI4120.1_UBQ", "AGI570.1_Acin"), WT_Tissue_0T_1 = c(0.886461437, 1.093164915), WT_Tissue_0T_2 = c(1.075140682,…
30 май '18 в 02:22
0 ответов

Как успешно загрузить старую версию пакета lsmeans

Я хотел бы загрузить версию 2.26-3 пакета lsmeans. При попытке загрузить старую версию пакета lsmeans возникает ошибка. Я пробовал два варианта загрузки старых версий lsmeans. Опция 1) path<- "http://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/lsmeans…
30 ноя '18 в 17:51
1 ответ

Раздутый DF в результатах lsmeans для модели lmer

Я использовал lmer из пакета lme4 для запуска линейной модели смешанных эффектов. У меня есть данные о температуре за 3 года для необработанных (5) и обработанных участков (10). Модель: modela<-lmer(ave~yr*tr+(1|pl), REML=FALSE, data=mydata) Моде…
19 апр '17 в 15:03
0 ответов

Включает ли пост-специальный тест lsmeans случайный фактор при сравнении?

Если я выполняю линейно-смешанную модель эффектов, используя lsmeans, вот так: model <- lmer (variable ~ A * B + (1|C), data = data) Где я обнаружил значительный основной эффект "А", который имеет три уровня. Затем я выполнил специальный тест для…
24 сен '16 в 02:18
1 ответ

R: Тьюки posthoc тестирует для nnet multinom многочленовой подгонки, чтобы проверить общие различия в многочленовом распределении

Я установил мутиномную модель, используя nnet"s multinom Использование функции (в данном случае по данным, отдавающим предпочтение в рационе мужского и женского пола и разного размера классов аллигаторов в разных озерах): data=read.csv("https://www.…
24 окт '15 в 10:02