Описание тега lmertest
Пакет R, обеспечивающий различные виды тестов для моделей линейных смешанных эффектов, реализованный в пакете lme4.
1
ответ
lmertest и доверительные интервалы
Есть ли способ получить lmertest для получения доверительных интервалов? Я пытался использовать этот код из https://cran.r-project.org/web/packages/lmerTest/lmerTest.pdf contest(mymodel , L, rhs = 0, joint = TRUE, collect = TRUE, confint = TRUE, lev…
22 май '18 в 06:27
2
ответа
Вычисление p-значений для модели с нулевым случайным эффектом в lm4/lmerTest
Edit1: как сообщается @RolandASc ниже, похоже, ошибка в lmerTest , Я уже написал электронное письмо сопровождающему пакета с сообщением о проблеме. Edit2: Ответ сопровождающего: "мы работаем над обновлением, где, как мы надеемся, такие проблемы буду…
23 янв '18 в 09:18
0
ответов
Ошибка загрузки для пакета R 'lmerTest': "Ошибка загрузки пакета или пространства имен"
Я не могу заставить работать пакет lmerTest R (он используется для предоставления статистических тестов для объектов, созданных с помощью пакета lme4) При загрузке выдает следующую ошибку Loading required package: Matrix Loading required package: lm…
30 окт '17 в 14:31
2
ответа
R 3.3.2: проблемы lme4 + lmerTest под Mac OS Sierra
Я столкнулся с проблемой, касающейся версии R 3.3.2 для Mac OS (и.3 тоже!) При использовании lme4 и lmerTest. lmerTest выдает ошибку: Ошибка в вычислении приближения Саттервейта. Выходные данные пакета lme4 возвращают сводку, из lme4 возвращается не…
09 мар '17 в 21:06
0
ответов
lmerTest::rand() ведет себя странно, когда имена переменных содержат '.'
У меня есть некоторый опыт работы с lme4, но сегодня я впервые попробовал lmerTest и был удивлен некоторыми результатами при использовании функции rand() для проверки случайных компонентов. (Я знаю, что это не рекомендуется авторам lme4!) При устран…
14 мар '18 в 19:46
1
ответ
lmerTest::anova не показывает p-значения
Я задаю новый вопрос, потому что dublicate ( anova () не отображает значение p при использовании с lmerTest) на самом деле не дает ответа: я столкнулся с той же проблемой, что lmerTest::anova не будет выводить степени свободы и p -значения для конкр…
04 мар '17 в 11:42
1
ответ
Значительное взаимодействие в линейной модели смешанного эффекта, но график показывает перекрывающиеся доверительные интервалы?
Это мой первый крик о помощи в stackru, поэтому, пожалуйста, извините за любые ошибки, которые я сделал, и, пожалуйста, прокомментируйте, если потребуется дополнительная информация. К сожалению, я не могу предоставить вам исходные данные, поскольку …
06 ноя '17 в 09:05
0
ответов
Какой дистрибутив использовать в моделях lmer?
Привет всем, Приношу свои извинения, если этот вопрос тривиален или был задан ранее. Я искал, но не смог найти удовлетворительный ответ на мой случай. Я не очень знаком со статистическим моделированием, так как по профессии я полевой эколог. Поэтому…
14 авг '18 в 12:01
2
ответа
Ввод аргументов столбцов из списков данных в пользовательской функции с использованием purrr::map
Я пишу пользовательскую функцию, которая делает линейную модель смешанных эффектов для каждого элемента списка с помощью purrr::map, Блок кода работает отлично, но когда я превращаю его в пользовательскую функцию, не ясно, как мне вводить аргументы,…
28 янв '18 в 20:15
0
ответов
Попытка использовать lsmeans без пакета "lmerTest"
Я использую следующую смешанную модель, используя пакет lme4: moms.rest.lmer <- lmer(rest ~ habitat + (1|year) + (1|ID)) где отдых - это числовое значение, а среда обитания - факторная переменная с 3 уровнями. Я пытаюсь получить попарные сравнени…
11 май '17 в 05:44
1
ответ
Имитация смешанной линейной модели и оценка ее с помощью lmerTest в R
Я пытаюсь понять, как использовать смешанные линейные модели для анализа моих данных путем имитации модели, но я не могу воспроизвести входные параметры. Что мне не хватает? Я хочу начать моделирование модели со случайным перехватом для каждого пред…
09 мар '18 в 13:04
1
ответ
Получение p-значений для сравнения по cld в R
Приведенный ниже код и выходные данные дают мне требуемую интерпретацию - то есть два нижних контраста существенно не отличаются, но третий отличается от двух других. Как я могу найти сравнения и p-значения, используемые для этого сравнения? т.е. мо…
28 окт '16 в 01:48
1
ответ
lmerTest:::anova использует ленивую загрузку наборов данных?
Столкнулся с этой проблемой, пытаясь получить эмпирическое распределение степеней свободы КР... Это кажется довольно опасным поведением? Это ошибка? Воспроизводимый пример: ## import lmerTest package library(lmerTest) ## an object of class merModLme…
15 мар '17 в 09:25
1
ответ
Как я могу предотвратить открытие пакета при запуске проекта RStudio
У меня установлен пакет lmerTest, но он маскирует некоторые функции lme4 и загружается автоматически, когда я запускаю конкретный проект. Я попытался удалить пакет, но теперь я просто получаю сообщение об ошибке: Загрузка требуемого пакета: lmerTest…
10 янв '17 в 13:44
0
ответов
Значения p в lmer с использованием теста lmer. Запускать модель несколько раз, чтобы получить надежные значения p?
Я использую lmerTest для получения значений p для моих моделей lmer в R. К сожалению, многократный запуск модели дает мне разные значения p каждый раз. Есть ли способ запустить модель несколько раз, чтобы вычислить одно устойчивое значение p? Любой …
26 июл '18 в 12:11
0
ответов
Как получить VIF для случайных эффектов для объекта merMod в R?
Не ищет случайных эффектов; Я могу получить те, кто использует ranef(). Но я пытаюсь получить VIF (или эквивалент) для них. Я нашел немного кода в stackru, который дает мне VIF для "фиксированных эффектов" (поищите "vif.mer", если интересно), но я п…
14 авг '18 в 22:07
1
ответ
rand() из lmerTest: как бороться с отсутствующими значениями?
Я работаю с большим набором данных и анализирую непрерывную зависимую переменную с помощью линейной модели смешанных эффектов с использованием пакета R. lme4. Я также использую расширение lmerTest, которое позволяет вычислять различные графики и зна…
17 июл '17 в 23:41
1
ответ
Построение фиксированных эффектов от lme4
Я строю оценки из модели с фиксированными эффектами. Есть ли способ построить только некоторые из фиксированных эффектов, а не все? sjp.lmer (model.name, type = "ri.pc", facet.grid = FALSE) Я также использую lmerTest для получения значений p для отч…
09 май '18 в 01:27
1
ответ
Тест Даннета для модели со смешанным эффектом неполного блочного проектирования в R
(Первый вопрос здесь, ТАК, извиняюсь за любые ошибки!) Я пытаюсь проанализировать данные с помощью линейной смешанной модели, учитывающей блочные (сюжетные) и генотипические (линейные) эффекты, с помощью корректировки степеней свободы Уэлча-Саттертв…
19 июл '18 в 20:47
1
ответ
Построение фиксированного наклона эффектов от модели Lmer
У меня есть следующий набор данных: > dput(df) structure(list(Subject = c(1L, 2L, 3L, 5L, 6L, 6L, 6L, 7L, 7L, 7L, 8L, 8L, 8L, 9L, 9L, 9L, 10L, 10L, 11L, 11L, 11L, 12L, 12L, 13L, 13L, 14L, 14L, 15L, 15L, 16L, 16L, 16L, 17L, 17L, 17L, 18L, 18L, 18L…
04 авг '16 в 15:33