Описание тега ggdendro
Пакет ggdendro - это набор инструментов для извлечения данных дендрограммы и графика древовидной диаграммы для использования с ggplot
1
ответ
Создание дендрограммы с помощью ggdendrogram
Я делаю кластерный анализ и создаю дендрограмму. я использовал ggdendrogram пакет и хотите использовать его вывод в ggplot2, Интересно, как получить те же самые X-метки, что и листовые? Спасибо D1 <- as.dist( matrix( data= c( 0, 9, 3, 6, 11 , 9, …
08 май '13 в 04:35
1
ответ
Изменение символов легенды, когда руководство определено внутри geom_text
Вот мои данные: ddata1 <- structure(list(segments = structure(list(x = c(8.203125, 1.5, 1.5, 1, 1.5, 2, 8.203125, 14.90625, 14.90625, 10.0625, 10.0625, 5.6875, 5.6875, 3.875, 3.875, 3, 3.875, 4.75, 4.75, 4, 4.75, 5.5, 5.5, 5, 5.5, 6, 5.6875, 7.5,…
03 сен '15 в 15:47
0
ответов
Цветовой узел на основе категории в запутанной диаграмме
Я пытаюсь построить диаграмму, используя dendextra и ggdendro, но я не могу покрасить узлы на основе столбца категории в диаграмме. Пожалуйста, порекомендуйте. d1 <- c(1:5) cate <- c("cat1", "cat2", "cat3", "cat1", "cat1") d1 <- data.frame(…
03 дек '18 в 19:42
1
ответ
Повернуть метки для дгрограммы ggplot
Я пытаюсь создать дендрограмму с помощью пакета dendextend. Он создает действительно хорошие дендрограммы gg, но, к сожалению, когда вы превращаете его в "круг", ярлыки не идут в ногу. Я приведу пример ниже. Мой дистанционный объект находится здесь:…
26 июн '16 в 02:16
3
ответа
Срез дерева и прямоугольники вокруг скоплений для горизонтальной дендрограммы в R
Я пытаюсь представить результаты иерархической кластеризации в R как дендрограмма, с прямоугольниками, идентифицирующими кластеры. Следующий код выполняет трюк для вертикальной дендрограммы, но для горизонтальной дендрограммы, (horiz=TRUE), прямоуго…
10 июн '14 в 11:55
1
ответ
Отображение переменных меток под сегментами дендрограммы с помощью ggdendro
Мой вопрос связан с ответом Андри на мой предыдущий вопрос. Мой вопрос заключается в том, возможно ли отображать метки переменных и метки автомобилей под соответствующими сегментами дендрограммы? library(ggplot2) library(ggdendro) data(mtcars) x <…
26 авг '11 в 06:55
0
ответов
ggdendrogram вращается с метками оси ggplot на правой стороне для использования в графике
Я пытаюсь создать правильную дендрограмму в R с ggplot2 (более конкретно ggdendro::ggdendrogram) потому что я хотел бы поделиться им с коллегами по графике, и в настоящее время я не думаю, что с помощью API можно сгенерировать дендрограмму с помощью…
08 июл '14 в 15:52
4
ответа
Воспроизведение решетчатого графа дендрограммы с помощью ggplot2
Можно ли воспроизвести этот решеточный график с помощью ggplot2? library(latticeExtra) data(mtcars) x <- t(as.matrix(scale(mtcars))) dd.row <- as.dendrogram(hclust(dist(x))) row.ord <- order.dendrogram(dd.row) dd.col <- as.dendrogram(hcl…
13 июл '11 в 01:32
1
ответ
Сохранение цвета метки и легенды на 2 дендограммах
Цель: я хотел бы сохранить цвет метки и цвет легенды на двух дендограммах, созданных для одного и того же набора данных. У меня есть тот же набор данных (40 наблюдений), который преобразуется в дендограмму в 2 процессах (предварительно отфильтрованн…
18 июл '18 в 20:39
1
ответ
Вырезание кластера из дендрограммы
Я использую эту ссылку, чтобы построить хорошую дендрограмму с цветными метками в соответствии с категориями. Второй ответ - это то, на что я смотрю в этой ссылке ( вырезание дерева и прямоугольники вокруг кластеров для горизонтальной дендрограммы в…
29 окт '15 в 22:37
0
ответов
Окрашивание листьев и ветвей в соответствии с кластерами k-cut с помощью gg dendro
Я сгенерировал дендрограмму, используя пакет ggdendro для R, но я не могу раскрасить метки и ветви. Я хочу покрасить его в соответствии со значением k который k=8 в моем случае. Как мне это сделать? Ниже дендрограмма, которую я создал: Вторая картин…
17 сен '16 в 07:28
1
ответ
Одинаково разнесенные длины в дендрограммах
На этой диаграмме основная информация (большинство узлов) находится на крайней левой стороне. Я хочу сделать дендрограмму легко читаемой, и поэтому края должны быть пропорционально длинными. Какие-либо конкретные аргументы, которые будут использова…
01 июн '16 в 08:48
1
ответ
R: настройка высоты ggplot для кластеризации дендрограммы
Идея состоит в том, чтобы объединить пакеты R ClustOfVar а также ggdendro дать визуальное резюме кластеризации переменных. Когда в данных мало столбцов, результат довольно хороший, за исключением того, что есть области, которые не покрыты (как обвед…
09 дек '16 в 06:48
1
ответ
Добавьте метки в дендрограмму и раскрасьте кластеры
Я создаю дендрограмму, используя ggdendro в этом случае: library(igraph) library(RColorBrewer) library(GGally) library(ggplot2) library(plotrix) library(extrafont) library(ggdendro) # load dataset net <- read.graph("./dataset/lesmiserables.gml", …
16 апр '16 в 18:30
1
ответ
R: пакет ggdendro выводит на печать этикетки
Когда я использую отличный пакет ggdendro для построения своего дерева, я сталкиваюсь с проблемой: однажды все метки дерева, которое оно создает, внезапно исчезли. Когда я запускаю следующий код на моей локальной машине и на сервере, я получаю разны…
27 апр '16 в 07:36
0
ответов
Красящие кластеры в ggdendro с длинными метками
Я создаю дендрограммы, используя ggdendro и раскрасить их в соответствии с точками среза в ветвях. Я использую подход, предложенный @jlhoward в этом вопросе ( Colorize Clusters в Dendogram с ggplot2), но я сталкиваюсь с проблемами, когда мои листовы…
23 янв '19 в 20:57
1
ответ
Как увеличить длину листового узла в дендрограмме и добавить метки узла
Моя задача - создать дендрограмму, но узлы листьев показывают тупые края. Как бы я увеличил длину конечного узла и добавил метки узла? Пожалуйста, смотрите текущие и ожидаемые изображения ниже. Данные: df1 <- data.frame( z1 = c(rep('P1', 5), rep(…
25 апр '18 в 19:53
1
ответ
Перевернуть ggdendrogram сюжет
Я использую ggdendrogram для построения дендрограммы, но я хочу иметь метки слева, чтобы сделать график более интуитивным. Как мне это сделать? Спасибо!!! library(ggplot2) library(ggdendro) ### Data countries <- c("UK","AU","SA","CH") distmatrix …
28 апр '13 в 11:27
1
ответ
R: Цвет ветвей дендрограммы при сохранении цветовой легенды
Задача: создать дендрограмму с ветвями, окрашенными факторной переменной, с результирующим графиком, содержащим легенду, чтобы преобразовать цвета ветвей к каждому значению факторной переменной. У меня есть некоторые данные с факторными переменными,…
04 дек '17 в 18:38
1
ответ
ggplot2 и ggdendro - построение цветных полос под листьями узла
В настоящее время я использую ggplot2 а также ggdendro построить дендрограммы. Однако теперь мне нужно построить дискретную переменную под листьями вместе с метками. Например, в публикации (Zhang et al., 2006) я увидел такую дендрограмму (обратите…
12 ноя '13 в 10:30