Перевернуть ggdendrogram сюжет
Я использую ggdendrogram для построения дендрограммы, но я хочу иметь метки слева, чтобы сделать график более интуитивным. Как мне это сделать? Спасибо!!!
library(ggplot2)
library(ggdendro)
### Data
countries <- c("UK","AU","SA","CH")
distmatrix <- matrix(c(0.00, 0.16, 1.01, 0.97, 0.16, 0.00, 0.84, 0.79, 1.01, 0.84, 0.00, 1.49, 0.97, 0.79, 1.49, 0.00),
nrow=4,dimnames=list(countries, countries))
### Cluster
hc = hclust(as.dist(distmatrix), method = "ward")
### Plot
ggdendrogram(hc, rotate=TRUE, theme_dendro=FALSE)
1 ответ
Дело в том, что код ggdendrogram
когда rotate=TRUE
Является ли это:
if (rotate) {
p <- p + coord_flip()
p <- p + scale_y_reverse(expand = c(0.2, 0))
}
Но ты не хочешь этого scale_y_reverse(.)
быть сделано. Итак, один из способов для вас сделать coord_flip()
сам.
ggdendrogram(hc, rotate=FALSE, theme_dendro=FALSE) + coord_flip()
Но одна очевидная проблема заключается в том, что labels
не будет оправдано должным образом. И вы не можете многое сделать в ggdendrogram()
функция, потому что она не позволяет настройку hjust
а также angle
свойства внешне.
Итак, я бы предложил для вашего случая, чтобы вы создали ggplot()
самостоятельно, копируя строки изнутри ggdendrogram
функция.
data <- dendro_data(hc)
p <- ggplot() + geom_segment(data = segment(data),
aes_string(x = "x", y = "y", xend = "xend", yend = "yend"))
p <- p + geom_text(data = label(data),
aes_string(x = "x", y = "y", label = "label"), hjust = 1, angle = 0)
p + scale_y_continuous(expand=c(0.2, 0)) + coord_flip()
Это дает:
Другой способ для вас изменить ggdendrogram
функционировать в соответствии с вашими потребностями и перекомпилировать его. Я думаю, что гораздо проще сделать это таким образом, и это вполне то, что вы хотите: