Описание тега torque

Описание тега Вопросы с тегом
TORQUE Resource Manager обеспечивает контроль над пакетными заданиями и распределенными вычислительными ресурсами. Это продукт с открытым исходным кодом, основанный на оригинальном проекте PBS.
1 ответ

Torque PBS передает переменные окружения, которые содержат кавычки

У меня есть скрипт на Python. Обычно я бы запустил это так: ./make_graph data_directory "wonderful graph title" Я должен запустить этот скрипт через планировщик. Я использую -v для передачи аргументов скрипта python через qsub. qsub make_graph.pbs -…
21 мар '15 в 06:05
1 ответ

Одна схема для привода и крутящего момента проекта

У меня есть проект, состоящий из Java и PHP-приложения. Java-приложение использует крутящий момент ORM, а PHP-приложение использует Propel ORM. У меня есть два файла schema.xml для одной базы данных. Насколько я знаю, пропел это часть крутящего моме…
20 апр '10 в 13:14
1 ответ

Torque PBS против многопроцессорной обработки Python

У меня есть скрипт Python, который работает на сервере с 512 процессорами и 4 ТБ памяти. Скрипт использует модуль многопроцессорной обработки Python для параллельной обработки, разветвляя 30 параллельных дочерних процессов. Теперь мне нужно написать…
18 фев '15 в 16:40
1 ответ

Как настроить кластер doSNOW и SOCK с помощью планировщика Torque/MOAB?

В продолжение /questions/42225063/razreshit-kazhdomu-rabotniku-registrirovatsya-i-rasprostranyat-podzadachi-drugim-rabotnikam, как лучше всего подключаться doSNOW и SOCK кластеризовать в Torque/MOAB планировщик, чтобы избежать сродства процессора во…
25 июн '13 в 02:49
1 ответ

Список значений job_state для крутящего момента

Каковы возможные значения для job_state в Torque? Я заглянул в соответствующие справочные страницы, пока не нашел полный список.
27 окт '11 в 19:23
1 ответ

Запустите RapSearch-программу с Torque PBS и qsub.

Моя проблема в том, что у меня есть кластерный сервер с Torque PBS и я хочу использовать его для запуска сравнения последовательностей с программой rapsearch. Обычная команда RapSearch: ./rapsearch -q protein.fasta -d database -o output -e 0.001 -v …
02 мар '16 в 15:19
4 ответа

Тест MPI на кластере

Я изучаю OpenMPI на кластере. Вот мой первый пример. Я ожидаю, что выходные данные будут показывать ответ от разных узлов, но все они отвечают от одного узла node062. Мне просто интересно, почему и как я могу получить отчет от разных узлов, чтобы по…
31 янв '10 в 02:40
1 ответ

Как использовать команду qsub -v в крутящем моменте PBS?

Я хотел бы передать переменные в сценарий csh с помощью команды "qsub -v". Я понимаю, что мы можем перечислить пары параметров-значений, как показано ниже, qsub -v par1=value1 par2=value2 myScript.csh Кто-нибудь знает, могут ли значения этих парамет…
18 окт '12 в 21:40
2 ответа

Как мне найти текущий процесс, выполняющийся на определенном задании PBS?

Я пытаюсь написать скрипт для обеспечения диагностики процессов. Я отправил скрипт на сервер планирования заданий, используя qsub. Я легко могу найти узел, на который отправляется задание. Но я бы хотел узнать, какой процесс выполняется в данный мом…
22 дек '15 в 01:23
0 ответов

Крутящий момент не может общаться с хостом

Я пытался настроить планировщик крутящего момента для небольшого кластера. Я следовал инструкциям по настройке планировщика с http://docs.adaptivecomputing.com/torque/archive/3-0-2/1.2configuring_torque_on_server.php Однако, когда я пытаюсь qterm -t…
18 авг '18 в 01:39
0 ответов

Не удалось получить адрес хоста. Trqauthd не удалось запустить!!! выход из настройки (во время инициализации serverdb)

Я установил крутящий момент, но во время инициализации serverdb, выполнив сценарий Torin.setup. ./torque.setup root I get following error message. Could not get host address trqauthd failed to start!!! exiting setup кошка /etc/hosts 127.0.0.1 localh…
05 авг '18 в 12:10
1 ответ

Torque/OpenMPI динамически распределяет узлы в зависимости от количества процессоров

Мне было интересно, достаточно ли крутит Torque, чтобы назначить правильное количество узлов в зависимости от того, сколько MPI-ядер вы запрашиваете. Для нашего кластера у нас есть разнородные узлы, и это может быть довольно расточительным, просто у…
04 мар '15 в 23:27
0 ответов

R пакет или методика для сохранения прогресса в работе параллельных вычислений

Я пытаюсь запланировать следующий сценарий R (exposure_train.R): .libPaths("/gscratch/csde/mienkoja/rpackages") library(Rmpi) library(missForest) library(snow) library(doSNOW) # load the data prepared above load("/home/mienkoja/pse_rodis/dat_clean.r…
30 янв '17 в 18:34
2 ответа

Как использовать команду qsub -v в крутящем моменте PBS со скриптом perl?

Я хотел бы передать переменные в сценарий Perl с помощью команды "qsub -v". Это скрипт Perl, который я бы запустил (это просто тест, но если он не работает, я не могу сделать что-нибудь более сложное) #!/usr/bin/perl use Getopt::Long; $result = GetO…
25 мар '13 в 17:09
0 ответов

PBS неоднородный запрос процесса и вывод qstat

Я работаю над кластером из 18 узлов, использующим TORQUE/PBS Pro/Open MPI. Настройка - 2 ЦП / узел, 12 ядер / ЦП (т.е. 24 допустимых процесса на узел). Если я отправляю задания PBS, которые требуют неравномерного разделения по узлам, например, задан…
31 окт '13 в 13:14
1 ответ

Hadoop в кластере Maui+Torque

У меня есть кластер с Torque+Maui. Можно ли установить Hadoop в одном кластере? Каковы плюсы и минусы, если это возможно?
27 авг '14 в 15:04
1 ответ

Как перезапустить сбойное задание PBS в кластере (qsub)?

Я запускаю задание PBS (python) в кластере с помощью команды qsub. Мне любопытно узнать, как я могу перезапустить ту же работу с того места, где она не удалась? Любая помощь будет высоко оценена.
12 дек '18 в 22:37
0 ответов

Работа с крутящим моментом застряла с mpirun

Я запустил следующий сценарий PBS для запуска задания с моим недавно настроенным Torque: #!/bin/sh #PBS -N asyn #PBS -q batch #PBS -l nodes=2:ppn=2 #PBS -l walltime=120:00:00 cd $PBS_O_WORKDIR cat $PBS_NODEFILE>nodes mpirun -np 4 gmx_mpi mdrun -d…
25 авг '17 в 09:11
1 ответ

Как скомпилировать Torque 2D с TGB Platformer Kit на Mac OS X 10.7?

Я пытаюсь перекомпилировать Torque-2d (или даже Torque) с помощью комплекта TGB Platformer на Mac OS X 10.7 (Lion), используя Xcode, и он просто не компилируется. Я пытался следовать инструкциям разработчика, но он не работал, он жалуется на некотор…
24 ноя '11 в 19:18
1 ответ

Запросить конкретные узлы с помощью TORQUE qsub?

Там кластер с установленным TORQUE qsub. Я хочу отправить задание, но хочу убедиться, что оно выполняется на одном из определенного набора узлов. Можно ли запросить список возможных узлов в qsub, так что задание отправляется на один из узлов в запро…
30 сен '14 в 18:32