Описание тега supercomputers

Supercomputers belong to a class of highly specialised hardware infrastructures, where high number of machines are typically pre-organised and smart-linked together with specialised high-speed low-latency interconnects, so as to allow new forms of concurrent processing cooperations to be orchestrated. Having any such supercomputing infrastructure is not enough, it is important to also use system tools capable to harness the most of the available CPU-powers
2 ответа

Сценарий PBS -o файл в нескольких местах

Иногда, когда я запускаю задания в кластере PBS, мне бы очень хотелось, чтобы журнал заданий (-o файл) находился в двух местах. Один в $PBS_O_WORKDIR для того, чтобы держать все вместе и один ${HOME}/jobOuts/ для greping/awking/ и т.д... Выполнение …
17 апр '13 в 05:08
2 ответа

Что такое пустое пространство / файловая система в HPC

Я изучаю приложения HPC и параллельные файловые системы. Я столкнулся с термином "чистое пространство" и "файловая система". Я не могу представить, где существует это пространство для царапин. Это на вычислительном узле в виде смонтированной файлово…
21 янв '15 в 11:32
1 ответ

Параллельная обработка: файл класса имеет неправильную версию 49.0, должен быть 48.0

Я запускаю свой код в суперкомпьютере с помощью используемого терминала. У меня есть 2 вида кода: 1- последовательный и параллельный (разделяемая память) последовательный он работает правильно, но когда я запускаю SM, у меня появляется эта ошибка, к…
1 ответ

Как сохранить результат большой симуляции в R? (несколько узлов, безопасный доступ)

Я делаю большую симуляцию для исследовательского проекта - имитация 1000 футбольных сезонов и анализ результатов. Поскольку времена года будут распределяться по нескольким узлам, мне нужен простой способ сохранить мои выходные данные в файл (или фай…
08 дек '16 в 01:26
1 ответ

Что такое Rmax/RPeak (Ratio) с точки зрения суперкомпьютера

Я работаю над базой данных суперкомпьютера top500. ( http://www.top500.org/) Rmax is maximum performance RPeak is theorotical maximum performance. Соотношение Rmax в RPeak результаты к чему-то? Как сказать, эффективность? или что-нибудь, что могло б…
28 фев '16 в 00:31
1 ответ

Производительность процессора с дополнительными ядрами

Как повысить скорость обработки одного потока за счет объединения нескольких ядер ЦП, как, например, обучение настраиваемой нейронной сети (не тензорного потока) на компьютере типа Google Compute Engine n1-highmem-64, имеющем 64 ядра ЦП? Кластерные …
25 ноя '17 в 22:27
2 ответа

Как разбить наборы данных на n блоков, чтобы сократить время очереди на суперкомпьютере?

У меня есть набор данных, который включает в себя около 2000 цифровых изображений. Я использую MATLAB для выполнения цифровой обработки изображений, чтобы извлечь деревья из изображений. Сценарий в настоящее время настроен для обработки изображений …
1 ответ

Когда SJF хуже, чем FCFS?

В операционных системах суперкомпьютеров, которые одновременно выполняют большое количество задач, есть ли ситуация, когда политика SJF занимает больше времени, чем политика FCFS, если говорить о метрике времени ожидания? Можно предположить, что в с…
1 ответ

Перебирать все файлы в каталоге одновременно

У меня есть цикл внутри цикла Внешний цикл просто проходит через каждый файл в каталоге и запускает внутренний цикл Могу ли я выбрать несколько файлов и одновременно запустить внутренний цикл для этих файлов Я использую 32-ядерный 100-Гбайт оператив…
29 дек '16 в 13:47
1 ответ

Сценарий Master SLURM, который вызывает другие SLURM S

Я - исследователь рака, и нам было интересно, знает ли кто-нибудь из вас, как написать сценарий SLURM, который вызывает другие слэмы. Если предыдущий сценарий успешно завершен, перейдите к следующему вызову. IE что-то вроде: #!/bin/bash #SBATCH --no…
06 дек '18 в 19:11
4 ответа

Орбитальные уравнения и мощность, необходимая для их запуска

Из-за сегодняшнего обсуждения SO IRC мне интересно узнать об орбитальной механике и Уравнения, необходимые для решения орбитальных задач Вычислительная мощность, необходимая для решения сложных задач В частности, вопрос заключается в том, чтобы расс…
1 ответ

Установка 'ncdf' на R, когда у меня нет привилегий суперпользователя

У меня есть доступ к суперкомпьютеру, для которого у меня нет привилегий суперпользователя. На компьютере доступны версии 3 и 4 netcdf, но я не знаю, есть ли у него библиотеки dev, необходимые для установки R ncdf, Я обычно использую его для запуска…
02 апр '13 в 02:00
2 ответа

Ускорение MPI с тривиально распараллеливаемой петлей DO (F90)

У меня есть простой цикл DO (Fortran 90), в котором отдельные итерации независимы друг от друга и только данные ввода / вывода с / на жесткий диск (процессы не обмениваются сообщениями /MPI между собой), которые я распараллелил используя MPI. При по…
2 ответа

Широко ли используется библиотека HPM (параллельная виртуальная машина) в HPC?

Все ли перешли на MPI (интерфейс передачи сообщений) или PVM все еще широко используется в суперкомпьютерах и HPC?
20 ноя '09 в 16:21
3 ответа

Как увидеть очередь текущего пользователя в SLURM

В кластере, управляемом SLURM, я хочу проверить очередь текущего пользователя (и кластера). Обычно я должен использовать эту команду: squeue --user=username --clusters=clustername Проблема с этим, за исключением того факта, что это довольно длинная …
1 ответ

Наивное распараллеливание в файле.pbs

Можно ли сделать распараллеливание через цикл for в файле PBS? Ниже приведен файл моей попытки. Я хотел бы выделить 4 узла и одновременно выделить 16 процессов на узел. Я успешно сделал это, но теперь у меня есть 4 работы, и я хотел бы отправить одн…
1 ответ

Суперкомпьютер: мертвый простой пример программы для запуска в суперкомпьютере

Я учусь тому, как использовать суперкомпьютеры, чтобы эффективно использовать ресурсы. Допустим, у меня есть скрипт на python, который создаст текстовый файл с заданным случайным числом. myfile.py # Imports import random,os outdir = 'outputs' if not…
14 окт '16 в 17:43
1 ответ

CPM и APM в суперкомпьютерах?

Я делаю исследование для моей бумажной работы по теме суперкомпьютера, специально для Тяньхэ-2. Итак, я читал отчет профессора Джека Донгарра, и он упоминает половинки платы CPM и APM: "Вычислительная плата имеет два вычислительных узла и состоит из…
29 дек '13 в 02:02
3 ответа

Может ли анонсированный Tegra K1 стать конкурентом чипов x86 и x64 в суперкомпьютерных приложениях?

Чтобы уточнить, можно ли использовать этот базовый процессор RISC (Tegra K1) без существенных изменений в современных программах суперкомпьютеров и, возможно, изменить правила игры, потому что это мощность, размер, стоимость и энергопотребление? Я з…
15 фев '14 в 00:50
1 ответ

Можно ли изменить идентификатор работы на что-то понятное человеку?

Я хотел бы отправить себе сообщение, когда работа будет завершена. Я понимаю, как изменить имя задания, чтобы файлы.o и.e имели соответствующее имя. Но я не уверен, есть ли способ изменить идентификатор задания со строки чисел на указанный ключ, что…
25 фев '18 в 00:53