Описание тега spatstat
NoneSpatstat is an R package for analysing spatial data, mainly Spatial Point Patterns.
0
ответов
"Ошибка в имени makeunitname(s[[1]], s[[1]]): в имени модуля первая запись должна быть строкой символов" при использовании плотности.lpp из библиотеки spatstat
Я использую функцию density.lpp с данными о дорожно-транспортных происшествиях. Вот мой набор данных: summary(X.lpp) Point pattern on linear network 442 points Linear network with 93641 vertices and 98584 lines Total length 3977060 units Average int…
14 апр '18 в 16:27
1
ответ
Преобразование матрицы в объект im из пакета spatstat - строки в обратном порядке
Первый раз пользователь здесь. Я конвертирую матрицу в объект im из пакета spatstat. Тем не менее, верхнее левое значение из матрицы mat[1,1] записывается в нижнем левом углу изображения, например, функция im считывает строки матрицы сверху вниз, но…
17 мар '15 в 14:55
2
ответа
Найти ближайшего соседа точек с одинаковым значением при сравнении двух разных наборов данных в R
У меня есть 2 кадра данных (df1 и df2), которые состоят из трех столбцов; x координата, y координата, категория (с 5 уровнями AE). Таким образом, у меня, по сути, есть 2 набора данных точек, каждая из которых относится к категории. например X Y Cat …
04 фев '16 в 14:41
3
ответа
R - Построение шестигранных тесселяций
Я хотел бы создать несколько квадратных графиков, в которых есть массивы шестиугольников, как показано здесь. Я хотел бы построить как регулярные (геометрически правильные), так и ненормальные шестиугольные тесселяции, поэтому я не думаю, что инстру…
08 ноя '16 в 04:41
1
ответ
Сеть не подключена - пакет spatstat в R
Я изучаю spatstat в R. В качестве первого шага я преобразовываю свой шейп-файл, чтобы он подходил для алгоритмов spatstat. Когда я использую as.linnet для преобразования в линейную сеть (последняя строка в коде ниже), я получаю предупреждение networ…
28 окт '16 в 07:56
1
ответ
Преобразование данных ImageJ ROI в R spatstat не работает
Я пытался использовать RImageJROI посылка от David C Sterratt для передачи нескольких ROIs в R и преобразовать их в Spatstat, Это минимальный пример моего R-кода library(RImageJROI) ROI = read.ijzip("path/ROI.zip") spat.ROI = ij2spatstat(ROI) Чтение…
12 сен '17 в 13:05
2
ответа
Проверка гипотез на основе симуляции на пространственных точечных гиперкартах с использованием функции "envelope" в spatstat
Я хочу использовать реплицированные пространственные точечные шаблоны для проверки гипотез в spatstat, spatstat имеет прекрасную документацию, и вы можете найти подробную информацию об анализе точечных образцов здесь: https://cran.r-project.org/web/…
02 июл '16 в 00:04
1
ответ
Как конвертировать список объектов psp в linnet
Используя виньетки шейп-файлов spatstat, я смог создать список объектов psp, чтобы каждая особенность шейп-файла была элементом в этом списке psp с атрибутами в виде меток. Чтобы быть конкретным, я использовал раздел 3.2.4 в виньетке следующим образ…
02 янв '17 в 14:27
1
ответ
Ripleys K не правильно строит графики?
Я делаю точечный анализ с использованием пакета spatstat и запускаю Ripley K (spatstat::Kest) на своих точках, чтобы увидеть, есть ли кластеризация. Однако, похоже, что не все линии, которые должны появиться на графике (kFem), построены. Например, к…
07 ноя '18 в 18:23
2
ответа
Псевдослучайная картина с фиксированной плотностью и зоной исключения
Я хочу создать 2D набор из N точек (обычно 1e2 - 1e4) в квадрате со следующими ограничениями: между всеми точками должно быть минимальное расстояние (зона исключения жесткого ядра) количество точек, заполняющих квадрат, дается заранее (или близкая о…
19 ноя '11 в 21:03
2
ответа
Ошибка печати при использовании функции ppp
Я планирую расположение нефтеперерабатывающих заводов в Хьюстоне, штат Техас. Я определил область исследования с помощью следующего кода. P4S.latlon <- CRS("+proj=longlat +datum=WGS84 ") county.lines <-readShapePoly("tl_2017_us_county/tl_2017_…
19 мар '18 в 01:59
1
ответ
Как установить точечные шаблоны гиперкадра, используя метки из информационного кадра
У меня гиперфрейм с 93 рядами. Каждая строка содержит карту стволов деревьев класса ppp, а также факторы группировки на уровне графика. Фрейм данных меток предоставляет данные для конкретной точки, такие как диаметр, вид и высота для каждой точки. М…
29 окт '18 в 21:37
2
ответа
Создание объектов ppp с помощью lapply (пакет spatstat)
Моя конечная цель - рассчитать индекс Кларка-Эванса (clarkevans.test) для списка фреймов данных, используя пакет spatstat. Итак, у меня есть список моих точечных данных: points.li <- list(structure(list(x.n = c(-1.37977544977995, 0.07870531261162…
15 мар '16 в 10:47
1
ответ
Spatstat - сравнение пространственных моделей
Никогда ранее не использовал R, но последние несколько месяцев работал через Spatstat для анализа распределения клеток в раковой ткани. Я извлекаю координаты xy положительно окрашенных клеток для двух разных клеточных популяций, чтобы получить отмеч…
30 ноя '15 в 22:46
2
ответа
Получение подмножества точек, которые находятся за пределами указанного неправильного многоугольника, с помощью {spatstat}
У меня есть большой набор точек (широта и долгота), ограниченных сложным многоугольником. Однако некоторые из точек не находятся в границах многоугольника, и я хотел бы поместить эти точки в исходный фрейм данных (не объект ppp, описанный ниже). #Si…
12 окт '14 в 03:37
0
ответов
Как сохранить поле SHP для использования в качестве ковариаты в lppm?
У меня есть записи о мертвых животных вдоль дорог (полилинии SHP), и мне нужно прогнозировать эти записи по ряду ковариат, включая тип дороги (поле SHP). Мне нужно преобразовать шейп-файл в объект linnet, и я хотел бы использовать поле "тип дороги" …
22 май '18 в 08:09
1
ответ
Погрешность linearK в послед. default() не может быть NA, NaN
Я пытаюсь узнать оценки linearK для небольшого объекта linnet из книги спатстата CRC (глава 17), и когда я использую функцию linearK, spatstat выдает ошибку. Я задокументировал процесс в комментариях в коде r ниже. Ошибка, как показано ниже. Error i…
07 авг '17 в 14:57
1
ответ
Направленное тестирование пространственной кластеризации по расстоянию от источника
У меня есть пространственный набор данных местоположений животных, поскольку (x,y) указывает вокруг источника (круговая схема с радиусом 5 км). Мне нужно проверить, сгруппированы ли точки (или отталкиваются) вокруг источника относительно источника д…
12 дек '18 в 12:40
1
ответ
Могу ли я использовать spatstat для измерения пространственной агрегации среды?
В настоящее время у меня есть индивидуальные растровые данные, которые представляют подходящую среду для 18 видов на основе MAXENT-прогнозов. Я хотел бы знать, агрегирована ли подходящая среда для каждого вида или нет. Я знаю, что обычно spatsat пак…
13 фев '19 в 16:10
1
ответ
Пространственно-временная кластеризация:: точечные узоры в разных пространствах
Следуя этим инструкциям Томаса, я создал объект ppp с помощью пакета spatstat в R. Поскольку мой набор данных включает измерение времени, я хочу расширить этот анализ, чтобы рассмотреть трехмерное пространство-время для кластерного анализа. В редакц…
16 июн '14 в 20:17