Spatstat - сравнение пространственных моделей

Question

Никогда ранее не использовал R, но последние несколько месяцев работал через Spatstat для анализа распределения клеток в раковой ткани. Я извлекаю координаты xy положительно окрашенных клеток для двух разных клеточных популяций, чтобы получить отмеченный ppp. Визуальное изучение данных с помощью графиков плотности и перекрестных функций K/G и т. Д. Позволяет выявить некоторые случаи, когда распределение двух клеточных популяций различается по интенсивности. кроме того, в некоторых случаях клетки, по-видимому, исключают друг друга, в то время как другие случаи характеризуются "горячими точками", общими для обеих популяций. Тем не менее, я не могу понять, как лучше это продемонстрировать, кроме изображения рядом друг с другом в качестве иллюстрации. Есть ли способ объединить два графика плотности или создать график общих областей интенсивности? Или другая функция в Spatstat, которую я пропустил?

Извиняюсь, если это глупый вопрос, но изо всех сил пытаюсь прогрессировать и был бы очень благодарен за совет.

С уважением, Мэтт

Answer 1

Тесты на значимость (= непостоянное соотношение двух интенсивностей) представлены в sparr пакет, который расширяет spatstat, Попробуйте функцию tolerance,