Описание тега imagej
ImageJ - это программа обработки изображений с открытым исходным кодом на основе Java, которая широко используется в научном анализе изображений, особенно в биологических науках. Пожалуйста, подумайте о том, чтобы задавать вопросы по ImageJ на форуме Image.sc: https://forum.image.sc/tags/imagej. Этот тег следует использовать для вопросов о программировании в / для ImageJ.
0
ответов
Доступ к таблице базы данных из ImageJ
Мне нужен кусок кода на одном из языков, поддерживаемых imageJ для запроса / добавления / изменения / удаления записей в базе данных (возможно, в MySQL). Я нашел следующий код, но не знаю, как его использовать, или он все еще работает с текущей верс…
23 мар '18 в 18:00
0
ответов
Компиляция Java-программы в Jar, отлично работает при запуске в Eclipse или Commandline, но в противном случае не работает
Компилируя Java-программу в Jar, она отлично работает при запуске в Eclipse или командной строке, она даже открывает изображения, когда я нажимаю кнопку открытия изображения, она просто никогда не завершается, когда я щелкаю по процессу. Единственны…
25 мар '14 в 13:21
2
ответа
Как я могу реализовать API ImageJ в своем коде Java?
Мне нужно использовать ImageJ API для Java, но я не знаю, где искать правильный.jar . Я посмотрел здесь, но ни один из них не подходит для реализации (у них нет классов, показанных в документации)
20 дек '14 в 05:53
1
ответ
ImageJ- как получить срезы из фактически обработанного изображения в стеке изображений
У меня проблема с получением имени файла из стека изображений в ImageJ. Я написал плагин, который может быть использован для стеков изображений и дает результат вывода для каждого изображения в стеке с помощью: if (mfpc == true) { IJ.log(fileName+":…
16 мар '16 в 09:58
2
ответа
Java: Как добавить полосы прокрутки в окно GUI, реализованное через java.awt.frame?
Я работал над ImageJ и мне нужно добавить полосы прокрутки в плагин: Weka_segmentation Он реализует java.awt.Frame для ij.gui.ImageWindow, который реализуется классом stackwindow, который, в свою очередь, реализуется классом customwindow. Я должен д…
02 июл '12 в 07:23
1
ответ
Как составить список собственных векторных элементов?
У меня есть собственный vector.class и polygon.class Vector.class package org.onvif.ver10.schema; import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessType; import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessorType; import javax.xml.bind.annotation.XmlAttribute; import…
04 дек '12 в 12:01
1
ответ
Как я могу подкрасить изображение, используя ImageJ API
Я новичок в ImageJ, и я стараюсь тонировать изображение с помощью программного API ImageJ. Является ли это возможным? Если так, как? Где находится соответствующая документация /Javadocs относительно тонирования изображения с ImageJ?
17 сен '12 в 14:42
1
ответ
Классы ImageJ, используемые для анализа
Я разрабатываю плагин ImageJ, который работает на моем настольном компьютере, а на ноутбуке - нет. По этой причине сейчас я пытаюсь улучшить и хочу изменить следующие шаги, но я не могу получить это. Это код: IJ.selectWindow("example"); IJ.run("Conv…
07 апр '15 в 22:42
2
ответа
Изображение J: Сохранить стек как анимированный GIF
У меня есть несколько стопок изображений из конфокального микроскопа, сохраненных в формате.lsm, и я хочу написать макрос, который: открывает изображение в папке Создает Composite, затем укладывает в RGB, затем устанавливает параметры анимации Сохра…
11 ноя '15 в 16:11
2
ответа
Среднее из нескольких стеков
Как я могу усреднить несколько стеков за один раз? В идеале использовать инструмент с графическим интерфейсом, как ImageJ? Я хочу сделать это на наборах из 10-20 стеков: 1500x1500 пикселей, 500 срезов, 1 канал в каждом стеке. Загрузка всех их одновр…
15 апр '16 в 09:20
1
ответ
ImageJ if оператор не будет выполнять roiManager("Выбрать",#);
Наконец-то мой код заработал, за исключением одного оператора if, который я не могу исправить. Я выбираю ROI 3 и 4 на первом шаге, а затем, если выражение "если" выполнено, я хочу выбрать только 4-й ROI и удалить его. По какой-то причине он пропуска…
08 окт '15 в 21:23
2
ответа
При копировании имени файла для последнего файла создания в imagej изображение не отображается
У меня есть большой каталог изображений и я хочу получить доступ к самой последней из командной строки. Я хочу показать это с помощью imagej, но конвейер команды открывает imagej, но не открывает изображение: ls -Art | tail -n 1| imagej это команда,…
02 янв '17 в 23:01
1
ответ
Java с ImageJ
Я использую ImageJ в коде Java для выполнения сегментации объектов в изображениях, используя LevelSet. Я импортировал файл jar с именем "levelsets.ij.LevelSet". Но я получаю ошибку как "неопознанная команда" в строковом поле "Наборы уровней" в коман…
15 сен '16 в 10:30
1
ответ
Объедините 3 стека в ImageJ
Есть ли способ "Stack Combine" 3 стека рядом. Image> Стеки> Инструменты> Объединить Поддерживает комбинацию 2 стеков, бок о бок. Два способа обойти это: Объедините первые 2, затем объедините объединенное изображение в третий стек Создайте макрос, ко…
29 ноя '16 в 18:01
1
ответ
Импорт классов из корня внешних jar-файлов (.jar) в Intellij (Maven Project)
Я использую IntelliJ 2016, и у меня есть некоторые зависимости Maven (для разработки плагинов ImageJ), которые я успешно добавил, две внешние библиотеки отображаются в виде файлов JAR. Я добавил их в структуру проекта -> модуль -> зависимости, и они…
08 фев '17 в 16:40
1
ответ
Установить глобальную калибровку свойств в ImageJ/FIJI
Я хочу включить и отключить глобальную калибровку, чтобы полученное изображение сохраняло те же свойства, что и исходное изображение, но у меня возникли некоторые трудности с его настройкой. Чтобы остановить отображение FIJI ошибки при открытии след…
16 янв '18 в 11:29
1
ответ
Преобразование данных ImageJ ROI в R spatstat не работает
Я пытался использовать RImageJROI посылка от David C Sterratt для передачи нескольких ROIs в R и преобразовать их в Spatstat, Это минимальный пример моего R-кода library(RImageJROI) ROI = read.ijzip("path/ROI.zip") spat.ROI = ij2spatstat(ROI) Чтение…
12 сен '17 в 13:05
1
ответ
ImageJ Overlay ROI zoom
Используя ImageJ, я хотел бы создать функцию масштабирования для области интереса в данном месте. до сих пор у меня что-то вроде этого: imp = IJ.getImage(); ip = imp.getProcessor(); //fill pixel array with ROI pixels for(int i = 0; i < height; i+…
13 май '13 в 14:47
2
ответа
Поиск файлов в каталоге и их сопряжение на основе общей подстроки
Я пытался запрограммировать решение для ImageJ для обработки моих изображений. Я понимаю, как получить каталог, выполнить команды для него и т. Д. И т. Д. Однако я столкнулся с ситуацией, когда мне теперь нужно начать использовать какой-либо тип фун…
12 ноя '15 в 19:57
1
ответ
Переименование областей интереса в ImageJ на основе их значения координаты x для создания последовательности
После нескольких часов интенсивных поисков мне нужно спросить вас. Итак, несколько дней назад мне предоставили макрос, который эффективно создает ROI на основе радиуса и функции (максимум). Ссылка на сайт Моя отправная точка - это следующее изображе…
15 мар '14 в 20:57