Описание тега pomegranate
0
ответов
Не могу построить график граната (pygraphviz не найден)
Я не могу понять, что происходит, но я больше не могу построить график граната внутри PyCharm. Я использую conda в качестве менеджера пакетов и пошел как обычно: conda install graphviz conda install python-graphviz но каждый раз, когда я звоню model…
05 дек '18 в 10:48
2
ответа
Байесовская сеть в гранате: ValueError: Образец не имеет того же числа измерений, что и модель
Я пытаюсь смоделировать байесовскую сеть в python, используя пакет граната. Сеть должна быть извлечена из данных. Поэтому я использую метод.from_samples. Однако у меня возникают проблемы с использованием метода.predict_proba(), и это дает мне ошибку…
25 окт '18 в 00:23
1
ответ
Установка бета-распределения с использованием граната
Я пытаюсь приблизить распределение бета-версии, используя библиотеку граната. Однако, когда я пытаюсь приблизить параметры из сгенерированных данных, я получаю очень разные параметры. Код для воспроизведения такой ошибки выглядит следующим образом i…
01 апр '19 в 21:24
0
ответов
Как исправить "PermissionError: [Errno 13] В доступе отказано:" C:\\Temp\\tmp2ihdqrzq "" в Python
Я использую Spyder с Python 3.7. Я хочу построить графики для байесовской сети и пытаюсь запустить код из этого учебника: https://github.com/jmschrei/pomegranate/blob/master/tutorials/B_Model_Tutorial_4b_Bayesian_Network_Structure_Learning.ipynb Я у…
11 апр '19 в 20:32
0
ответов
AssertionError: должно быть два ребра из model.start, два от Rainy и два от Sunny
Пока я делал модель в HMM, застрял в проблеме AssertionError, но не смог понять, в чем проблема? import matplotlib.pyplot as plt import numpy as np import pandas as pd from helpers import show_model from pomegranate import State, HiddenMarkovModel, …
06 авг '19 в 16:22
3
ответа
Гранат не в состоянии обнаружить существующий пиграфиз
Я пытаюсь работать с пакетом Pomegranate в среде Python 3.7, Win 10. У меня были проблемы с установкой пакета pygraphviz (это был кошмар). Я наконец закончил тем, что установил пакет после этого поста. Теперь, когда я пытался работать с гранатом, он…
05 июл '19 в 03:36
0
ответов
Errno 13 при попытке построить HMM с гранатом
Я пытаюсь построить модель HMM, реализованную с помощью библиотеки Pomegranate. Вызов метода сюжета с помощью model.plot() вызывает следующую ошибку: PermissionError Traceback (most recent call last) <ipython-input-29-405034733d4b> in <modu…
28 июл '20 в 18:43
4
ответа
Байесовская сеть в Python: как построение, так и выборка
Для проекта мне нужно создать синтетические категориальные данные, содержащие определенные зависимости между атрибутами. Это можно сделать путем выборки из заранее определенной байесовской сети. После некоторого поиска в Интернете я обнаружил, чтоPo…
29 ноя '19 в 18:15
0
ответов
Как отформатировать продольные / панельные данные для HMM
Как следует вводить продольные данные в модель HMM (меня не волнует, будет ли пакет seqlearn, hmmlearn, pomegranate,...)? Все эти пакеты не имеют надлежащей документации о том, как вводить данные, где для каждого временного шага есть несколько перем…
17 апр '20 в 14:44
1
ответ
Как включить предварительную информацию в гранат? Другими словами: поддерживает ли гранат постепенное обучение?
Скажем, я подхожу к модели, используя pomegranateк данным, доступным на тот момент. Когда появятся новые данные, я хотел бы соответствующим образом обновить модель. Другими словами, возможно ли это сpomegranateобновить существующую модель новыми дан…
11 дек '19 в 23:09
0
ответов
Байесовские сети: изучение структуры в Python происходит очень медленно по сравнению с R
В настоящее время я работаю над проблемой классификации изображений с использованием байесовских сетей. Я пробовал использоватьpomegranate,pgmpy а также bnlearn. Мой набор данных содержит более 200000 изображений, на которых я выполняю некоторый алг…
30 май '20 в 10:39
0
ответов
Обучение с учителем HMM с гранатом
Спасибо за вашу помощь, я новичок в этой теме. У меня есть набор данных, состоящий из последовательности двоичных наблюдаемых переменных, связанных с меткой, как это. trainset = [ [0,0,1,0],[0,0,1,0],[0,0,0,1],...,] labels = [ 0,1,2,...,] states = 3…
23 июн '20 в 12:26
0
ответов
Попытка сгенерировать файл png из Pomegranate
Я попытался создать байесовскую сеть, сгенерировав случайные выборки данных и используя функцию модели в библиотеке граната для ее создания. Однако у меня возникает проблема при попытке сгенерировать png-файл байесовской сети. Я проверил, и все мои …
27 июн '20 в 19:27
0
ответов
Гранатовый тренировочный HMM с данными, размеченными для групп состояний
Я пытаюсь обучить HMM, построенный с гранатом, на питоне, чтобы предсказать присутствие сигнальных пептидов в AA-последовательностях белка, а также сайт расщепления сигнального пептида. Более или менее повторяя работу SignalP2.0, я разделил сигнальн…
01 апр '20 в 11:42
0
ответов
Ошибка ключа байесовской сети граната для вероятности
** Я продолжаю получать ключевую ошибку (0,0), может ли кто-нибудь отладить это и сказать мне, где я ошибся, я потратил на это слишком много часов. Все работает, если бы я использовал model.predict_proba(доказательство), но я хочу найти точную вероя…
22 апр '20 в 18:46
0
ответов
Как я могу обучить байесовскую сеть с помощью граната на Python?
Я новичок в программировании на Python и пытаюсь обучить байесовскую сеть. Я создал дискретные распределения и таблицы условной вероятности. import math from pomegranate import * import pandas as pd import csv import numpy as np edad = DiscreteDistr…
31 май '20 в 18:39
0
ответов
Ошибка утверждения сети Python Pomegranate Bayes
import csv import pandas from pomegranate import * csvFile = pandas.read_csv('data.csv') layer1= DiscreteDistribution({0: 1./3, 0.5: 1./3, 1.0: 1./3}) layer2 = DiscreteDistribution({0: 1./5, 0.25: 1./3, 0.5: 1./5, 0.75: 1./5, 1.0: 1./5}) node1 = Nod…
21 авг '20 в 08:10
1
ответ
Проблема с установкой Pomegranate в моем коде
Привет, ребята, так что для моего класса программирования я хочу протестировать один из практических примеров, используя вероятность. Файл импортирует Pomegranate, но когда я пытаюсь установить Pomegranate, он продолжает выдавать мне эту ошибку: вве…
02 июн '20 в 02:41
0
ответов
Извлечение выбросов и начальных вероятностей из гранатового HMM
Я обучил модель HMM, используя пакет Python Pomegranate, например from pomegranate import * model = HiddenMarkovModel.from_samples(DiscreteDistribution, n_components=n, X=[trace]) Запуская этот код, я могу эффективно обучать HMM из образца последова…
23 апр '20 в 23:21
1
ответ
Проблемы с установкой Pomegranate
Я несколько раз пробовал установить Pomegranate, а также загрузил и установил VisualStudio C++ Buildtools, версия 14.0.25420.1 . К сожалению, у меня все еще возникают проблемы с установкой пакета, как показано в приведенном ниже коде. У кого-нибудь …
30 июн '20 в 20:17