Описание тега multcompview

Вопросы с тегом
1 ответ

R: Как использовать функцию cld для получения результатов от односторонней Anova

Итак, я установил пакеты multcomp и multcompview для RStudio; Тем не менее, когда я иду использовать функцию cld, я получаю эту ошибку Error in UseMethod("cld") : no applicable method for 'cld' applied to an object of class "data.frame" Мои данные т…
30 окт '17 в 12:16
1 ответ

Неправильный порядок букв Tukey в пакете R multcompView

Я не понимаю порядок букв в функции multcompletters из multcompView. Согласно документации это должно быть в соответствии со средним значением группы. В следующем примере средняя группа получила c (из abc) и должна была получить b. Это ошибка? requi…
27 сен '18 в 09:03
1 ответ

TukeyHSD и multcompView с dplyr и метлой в R

Упоминается в broom веб-сайт, который может быть использован для TukeyHSD а также multcomp (См. Здесь). Тем не менее, я не мог понять, как использовать broom за TukeyHSD а также multcomp, Смотрите MWE, приведенный ниже. df1 <- data.frame( Rep = f…
23 сен '17 в 10:12
0 ответов

Эффект повторения в парных множественных сравнениях в модели GLM

Я хотел бы знать разницу и интерпретацию парных множественных сравнений в модели GLM. Если мне нужно рассмотреть повторения в модели. Смотрите мой пример ниже: Сначала я создаю некоторые переменные set.seed(123) d<-NULL N<-54 d$Production <…
26 фев '19 в 13:01
0 ответов

multcompBoxplot: ошибка xy.coords ("x" является списком, но не имеет компонентов "x" и "y")

У меня есть датафрейм DF с 2 столбцами: df <- data.frame(runif(80,0.5,1), as.factor(rep(1:8, 10))) names(df) = c('A','B') Я хотел бы создать коробочные диаграммы, которые показывают результаты для специального теста Tukey на разных уровнях фактор…
27 авг '18 в 11:00
0 ответов

Как исправить: ошибка "размеры коэффициентов и ковариационная матрица не совпадают" в функции glht (пакет multcomp)

Я использую функцию glht (multcomp) для вычисления точечных оценок и стандартных ошибок линейной комбинации коэффициентов после регрессии. Регрессия включает четырехсторонний член взаимодействия, для которого не все комбинации имеют точки данных, по…
31 май '19 в 21:24
0 ответов

multcompLetters пропустил одно сравнение

Когда я выступаю multcompLetters от multcompview пакет. Одно сравнение отсутствует (в моем случае). h <- structure(c(4.91705503037395e-27, 7.39556093715795e-33, NA, 4.75683170514963e-07 ), .Dim = c(2L, 2L), .Dimnames = list(c("t14", "t29"), c("t0…
17 апр '19 в 22:18
0 ответов

Как производить Tukey CLD, используя lmer с несколькими факторами

Я пытаюсь проанализировать сельскохозяйственное испытание и хотел бы выполнить многократное сравнение, аналогичное HSD.test. Я предоставил пример кода, демонстрирующий, чего я хотел бы достичь с помощью lmer. Я пробовал использовать emmeans и cld/gl…
15 авг '19 в 12:30
0 ответов

Есть ли способ добавить cld к комбинированному ggplot?

Я анализирую набор многомерных данных, сначала сравниваю их с контролем, а затем сравниваю различные обработки между собой. Данные можно найти здесь. Для сравнения с контролем я использую ggpubr: ggbarplot(s1, x = "media", y = c("Ca", "Cu", "Fe", "K…
11 июн '19 в 10:35
1 ответ

Двусторонний тест ANOVA Тьюки и коробчатая диаграмма в R

Я следую этому руководству и этому вопросу 1, вопросу 2, чтобы построить график двустороннего ящика с фасетами и буквами, обозначающими статическую разницу между обработками. Кто-нибудь знает, как сделать такой график? Немного кода о моих попытках: …
10 окт '19 в 20:03
0 ответов

Как использовать функцию cld для определенных генов в большом наборе данных?

Я новичок в программировании на R. Я предварительно сформировал двухфакторную аниову для моих данных КПЦР для разных генов, в разных обработках и линиях. Когда я преформcldдля моего набора данных результат отображает алфавиты для всех генов вместе. …
24 июн '20 в 18:28
0 ответов

Ошибка в glht.matrix(model = new("glmerMod", resp = new("glmResp", .xData = <environment>),: 'ncol (linfct)' не равно 'length(coef(model))'

Я запустил GLMM: **m7 = glmer(CF ~ (Morph * Habitat)/Can+ (1|Subject), data = Muntjak2, family = poisson(link = "log"), nAQ=0, control=glmerControl(check.nlev.gtr.1="ignore"))** **summary(Muntjak2)** *Subject Sampling Morph Species CF HC Habitat Can…
08 апр '20 в 20:31
1 ответ

glht() дает тот же std. ошибка для каждого лечения

Я пытаюсь провести тест Даннета на линейной смешанной модели с использованием lme4 и glht. Я настроил и запустил модель, как показано ниже Untransformed.lmer <- lmer(Sum ~ Treatment + (1|Block), data = EggCounts_poolSUM) anova(Untransformed.lmer)…
05 апр '20 в 05:23
2 ответа

Неправильные буквы ANOVA+tukey с пакетом multcompView и функцией multcompLetters4

Я пытаюсь визуализировать свои статистические показатели ANOVA и апостериорного Тьюки в виде гистограммы. До сих пор это работало, но мои буквы в неправильном порядке, полоса «mit Downsampling» (2) должна отличаться от других, а не первой «ohne Samp…
26 янв '22 в 16:39
2 ответа

Как извлечь значение (минимальную разницу), которое функция multcomp::glht использует для вычисления множественных сравнений средних значений в R?

У меня есть этот пример, где я хотел бы иметь несколько сравнений между методами лечения. Вот данные: data.1 <-read.csv(text = " location,treat,response loc1,T1,120 loc1,T2,60 loc1,T3,59 loc1,T4,10 loc2,T1,129 loc2,T2,55 loc2,T3,59 loc2,T4,8 loc3…
27 янв '22 в 00:58
1 ответ

Как разделить компактный буквенный дисплей (CLD) в multcomp по группам, не меняя метод настройки p-значения?

Проблема Я хотел бы построить оценочные предельные средние из трехфакторного эксперимента с буквами, обозначающими существенно разные средние, скорректированные для множественных сравнений. Мой текущий рабочий процесс заключается в том, чтобы подогн…
02 фев '22 в 17:07
1 ответ

Неравная дисперсия в R-линейной смешанной модели с апостериорными средними значениями

Я подогнал линейную смешанную модель к сельскохозяйственным данным, учитывая неравные различия между группами (культурными сортами), пропустив weights = varIdent(...)к lme. lsmeansпоказывает стандартные ошибки, которые не совпадают со значительными …
22 янв '22 в 02:30
0 ответов

Множественные сравнения с gtsummary

Поскольку мой вопрос аналогичен тому, который задавался ранее, я украду репрекс (также ниже) для согласованности из сводной таблицы (среднее значение + стандартная ошибка) со значениями p для двухфакторного анализа. Мне любопытно, как интегрировать …
24 мар '22 в 16:16
0 ответов

Объединение двух диаграмм с общей осью Y с использованием ggplot2

У меня есть две диаграммы, каждая со своими значениями, но с общей легендой и осью y. Я попытался объединить их, используя функцию пэчворка, но как я могу поместить их в один сюжет вместе с буквами Тьюки поверх них? Я прикрепил свой код ниже, а такж…
26 янв '23 в 03:24
0 ответов

Есть ли в R способ зациклить функции multcompview (например, CLD) через списки ANOVA и Tukeys?

В конце концов я хочу построить каждую переменную с помощью CLD. Но в то же время у меня проблемы с получением CLD. У меня есть данные, которые выглядят так; df <- data.frame(Treat = rep(LETTERS[1:4], 100, replace = TRUE), A = rnorm(400), B = rno…
24 фев '23 в 00:03