Описание тега circlize
NoneCirclize - это бесплатная реализация программного обеспечения circos с открытым исходным кодом на языке R для визуализации данных в круговом формате.
1
ответ
Схема аккордов с несколькими уровнями данных
Я нахожусь немного застрявшим, я хочу показать потоки между регионами для выловленных видов через диаграмму аккордов на циклическом цикле, но не могу понять, как построить график, когда столбцы 1 и 2 представляют "связь", столбец 3 - " фактор "интер…
28 авг '16 в 06:59
1
ответ
r обрезать отчет зазор. Степень слишком велика
Я пытаюсь построить аккорд с помощью функции chordDiagram в пакете R.circlize, код ссылки похож на " матричная визуализация" set.seed(999) chordDiagram(mat) circos.clear() сообщение об ошибке вроде: circos.initialize(factors = factors, xlim = xlim) …
31 май '15 в 07:54
1
ответ
R: Изменение цвета на диаграмме аккордов в R
Основной вопрос. У меня есть таблица ввода, как это: 1 2 3 4 5 6 7 1 0 0 1098 11 137 105 338 2 0 0 351 0 1 0 0 3 0 0 0 132 215 91 191 4 0 0 0 0 6 10 19 5 0 0 0 0 0 37 95 6 0 0 0 0 0 0 146 7 0 0 0 0 0 0 0 Я написал этот код в R: library(circlize) tab…
28 мар '18 в 21:44
1
ответ
Ошибка "выбраны неопределенные столбцы" - Аккордовая диаграмма (округлить пакет) в R
Мне нужна помощь с сообщением об ошибке при использовании chordDiagram() функция от circlize пакет. Я работаю с рыболовецкими уловами. Рыболовные суда начинают свое плавание в одном порту PORT_DE) и выгрузить добычу (в данном случае гребешки) в друг…
10 апр '17 в 15:28
1
ответ
R circlize: ошибка в circos.initialize
Я могу легко следовать примеру Circlize в описании пакета на CRAN: library('circlize') set.seed(123) mat = matrix(sample(1:100, 18, replace = TRUE), 3, 6) rownames(mat) = letters[1:3] colnames(mat) = LETTERS[1:6] ### basic settings par(mfrow = c(3, …
27 янв '16 в 16:25
0
ответов
Реализация ггвис с блеском и кружком
Я пытаюсь понять, как работает ggvis в контексте блестящего, и это была настоящая головная боль. На данный момент я просто пытаюсь сделать что-то, что-нибудь интерактивное. В идеале я хотел бы иметь возможность фильтровать точки данных с помощью пол…
25 окт '17 в 21:27
1
ответ
R: Регулировка меток в круговой диаграмме
У меня есть код ниже, который я пытаюсь превратить в круговую диаграмму, используя удивительный пакет Circize Я прочитал vigenette и признаю, что некоторые из них прошли через мою голову, Мне было интересно, есть ли быстрый способ удалить все метки …
06 сен '15 в 14:07
0
ответов
Подгонка данных в круговой график
Я пытаюсь сделать простой циркулирующий сюжет, содержащий два трека. Внешний путь - это общее финансирование, выделенное на каждую область помощи. Предполагается, что внутреннее направление - это финансирование, выделенное на каждую область помощи, …
22 ноя '17 в 16:38
1
ответ
R (кружить): Как удалить самостоятельные ссылки?
Вот пример кода: df <- rbind(matrix(rep(sample(5),2),5,2),matrix(sample(10),5,2)) model_color <- unique(as.vector(df)) names(model_color) <- model_color brand <- unique(as.vector(df)) names(brand) <- brand chordDiagram(data.frame(df),…
30 май '17 в 16:44
1
ответ
Отсутствие ссылок на круговой миграционный участок
Я пытался следовать R-коду от Гая, чтобы создавать циклические графики миграции. Мои файлы похожи на те, которые он представляет с пакетом "migest" (science/region_custom). Мой пример файла данных: 'region_oceanos': - - - 1 2 4 3 - - - Pacífico Índi…
06 мар '15 в 01:50
0
ответов
Circlize: текст смещен по сравнению с нижележащими дорожками
Хорошо, я пытаюсь попасть в circlize пакет для некоторых геномных сюжетов, которые я хочу сделать. Однако у меня проблемы с смещенным / смещенным текстом (и другими вещами, которые я пытаюсь добавить в треки). Вот некоторый (надеюсь, воспроизводимый…
26 апр '18 в 16:42
1
ответ
Как преобразовать данные из кадра / данных в матрицу в R для диаграммы аккордов?
Это может показаться относительно простым, но я пытаюсь преобразовать данные из фрейма данных в матрицу, поскольку я работаю с новым пакетом chorddiag D3. Раньше я использовал циклизацию и зависел от использования возможностей dataframe. Chorddiag, …
03 фев '17 в 16:35
2
ответа
Маркировка круговой дендекстенд дендрограммы
Я пытаюсь построить круговую дендрограмму композиционных данных. Используя следующий код: library(dendextend) library(circlize) library(compositions) data("Hydrochem") hydro<-Hydrochem d <- dist(hydro[7:19], method="euclidean") hc <- hclust…
15 сен '17 в 11:20
1
ответ
R Circlize, Аккордовый граф с пустыми секторами
Я пытаюсь создать аккордовую диаграмму, используя пакет circlize в R. Я хотел бы включить сектора, для которых нет оттока (нет ссылок, исходящих от них). Есть ли способ: Заставить программу сообщать строки из моего фрейма данных, даже если в этой ст…
25 май '15 в 06:14
0
ответов
Круговой сюжет - Рисование перевернутой хромосомы
Я пытаюсь сделать синтенический график, используя графику ссылок пакета Circlize. Мне нужно, чтобы референсная хромосома была представлена инвертированной по отношению к остальным хромосомам сравнения. То есть, когда остальные хромосомы представле…
31 янв '19 в 15:37
2
ответа
Поворот меток в chordDiagram (R кружить)
Вот код из circlize Пакет для создания аккордов. Прямо сейчас метки параллельны краю круга. Можно ли повернуть метки на 90 градусов, чтобы они были перпендикулярны кругу? library(circlize) set.seed(999) mat = matrix(sample(18, 18), 3, 6) rownames(ma…
11 авг '15 в 13:26
1
ответ
Удалить метки и цифровые метки из диаграммы аккордов Circlize
Я ищу способ удалить стандартные "галочки" и "цифровые метки", которые появляются на диаграмме аккордов, созданной с помощью пакета R Circlize. Я пытаюсь использовать пакет для визуализации сотрудников, переходящих из одного отдела в другой. Ниже пр…
30 авг '16 в 14:02
1
ответ
Как увеличить радиус на круговом участке
Я нарисовал следующий сюжет, используя circlizeпакет. Красный круг - это единичный круг, нарисованный впоследствии, используя plotrix, Я хочу построить первый трек за пределами красного круга. По этой причине я изменился canvas.xlim а также canvas.y…
17 мар '16 в 17:13
3
ответа
R: круговой сюжет - как построить несвязанные области между секторами с минимальным перекрытием
У меня есть фрейм данных с общими чертами между 4 группами пациентов и типами клеток. У меня много разных функций, но общих (присутствующих в более чем 1 группе) - это всего несколько. Я хочу сделать обходной сюжет, который отражает несколько связей…
21 мар '17 в 02:25
1
ответ
Найти центр и добавить текст в заговор
Центр круга (a,b) может быть получен из уравнения круга <a href="http://www.codecogs.com/eqnedit.php?latex=\inline&space;(x-a)^2&plus;(y-b)^2&space;=&space;r^2" target="_blank"><img src="http://latex.codecogs.com/gif.latex?\…
17 дек '17 в 06:23