Описание тега runumap
UMAP (Uniform Manifold Approximation and Projection) - это новый метод обучения многообразию многообразий для уменьшения размерности. Алгоритм UMAP конкурирует с t-SNE по качеству визуализации и, возможно, сохраняет большую часть глобальной структуры и превосходную производительность во время выполнения. UMAP не имеет вычислительных ограничений на встраивание измерений, что делает его жизнеспособным в качестве универсального метода уменьшения размерности для машинного обучения.
0
ответов
RunUMAP дает ошибку сегментации
Я попробовал следующее > my.exp <- RunUMAP(my.exp, dims = 1:30) UMAP(a=None, angular_rp_forest=False, b=None, init='spectral', learning_rate=1.0, local_connectivity=1, metric='correlation', metric_kwds=None, min_dist=0.3, n_components=2, n_epo…
03 авг '19 в 04:16
2
ответа
UMAP Error TypeError: требуется байтовый объект, а не `` список ''
Я пытаюсь запустить код, который использует UMAP для уменьшения размерности на основе работы здесь: https://umap-learn.readthedocs.io/en/latest/basic_usage.html Я использую Spyder (Python 3.7). Я получаю такую ошибку: TypeError: a bytes-like objec…
29 июн '20 в 06:31
1
ответ
Есть ли способ нарисовать график UMAP или t-SNE для таблицы данных?
У меня есть огромный файл (ниже небольшой набор данных), как показано ниже, я хотел бы нарисовать PCA, я мог бы нарисовать PCA с помощью функции PCA, но это выглядит немного беспорядочно, потому что у меня 200 столбцов, поэтому я думаю, что, возможн…
28 окт '19 в 17:54
0
ответов
Проблема Cytofkit2: ошибка в match.arg arg должна быть> = 1
У меня было несколько проблем с установкой umap-learn, но я решил их, установив пакет reticulate после установки библиотеки cytofkit2, а затем используя команду: reticulate::py_install(пакеты ='umap-learn') Однако, когда я пытаюсь запустить анализ U…
10 апр '20 в 11:09
1
ответ
Использование функции карты из purrr для проверки двух параметров одной функции UMAP в R
Новичку снова нужна помощь. Я играю с набором данных с помощью UMAP, инструмента для уменьшения размеров. Такие вещи будут иметь 2 параметра, которые нужно настроить и посмотреть. Раньше я использовал tSNE, и он требует настройки одного параметра. Д…
18 июн '20 в 19:12
0
ответов
Как использовать категориальные метки данных при частичной маркировке (полууправляемый UMAP)?
Я действительно новичок в науке о данных в целом, в настоящее время я пробую частично контролируемое обучение с использованием UMAP для моих данных о потреблении энергии, поскольку я хочу классифицировать, какие устройства включаются в определенный …
18 май '20 в 15:47
1
ответ
umap выделяет две разные модели
Я пытаюсь создать umap для данных одной ячейки из образцов человека и образцов ptx. Я могу получить umap туда, где он показывает umap с различными кластерами, но я хочу показать, где находятся образцы ptx и где находятся образцы людей. Мой код выгля…
03 апр '20 в 14:38
0
ответов
Как обобщить параметры umap
Основные параметры, которые я использую для создания umap, - это min_dist, a и b. Я установил min_dist=0.5, a=1, b=1, что дает значимое низкоразмерное представление для большинства наборов данных изначально, когда используются все функции (примерно …
14 июл '20 в 03:22
0
ответов
Кластеризация модели активного обучения в UMap
В настоящее время я работаю с UMAP и modAL для создания записной книжки. Используя данные MNIST (sklearn.datasets.load_digits), Я начинаю подгонять UMAP к моему Train-data. Затем я перехожу к преобразованию всех данных, которые у меня есть (трениров…
16 окт '20 в 11:13
1
ответ
UMAP PicklingError: ("Невозможно рассолить <class 'numpy.dtype [float32]'>:…)
Попытка запустить UMAP вызывает ошибку: import pandas as pd import numpy as np import umap df = pd.DataFrame(np.arange(25).reshape(-1,5)) um = umap.UMAP(random_state=0) um.fit(df) PicklingError: ("Can't pickle <class 'numpy.dtype[float32]'>: i…
14 мар '21 в 05:34
0
ответов
Несколько советов и несколько вопросов о моем подходе к рекомендательной системе [закрыто]
Я пытаюсь создать рекомендательную систему для изображений и видео, учитывая не такую большую базу данных (сейчас около 20 тысяч сообщений), и она, конечно, растет, но все еще не так быстро. Обработка данных и извлечение функций из изображений и в…
07 апр '21 в 12:27
1
ответ
Результат визуализации Seurat UMAP отражается после запуска в двух идентичных средах
Когда я запускаю один и тот же код R на моем локальном компьютере RStudio (R 4.0.2) и в Code Ocean R 4.0.3, у меня есть два разных результата визуализации UMAP, и они отражаются [ ] Я использую версию Seurat 3.2.0 в обеих средах и, в частности, для …
15 апр '21 в 06:22
1
ответ
Невозможно импортировать umap: невозможно импортировать имя 'structref' из 'numba.experimental'
Я попытался импортировать umap в свой блокнот jupyter, но имел следующую ошибку: ImportError: cannot import name 'structref' from 'numba.experimental' (C:\Users\name\Anaconda3\lib\site-packages\numba\experimental\__init__.py) Я пытался обновить cond…
30 апр '21 в 00:11
2
ответа
Python: сделать UMAP быстрым (er)
Я использую UMAP (https://umap-learn.readthedocs.io/en/latest/#), чтобы уменьшить размер моих данных. Мой набор данных содержит 4700 образцов по 1,2 миллиона функций в каждом (которые я хотел бы уменьшить). Однако это занимает довольно много времени…
05 июл '21 в 16:34
2
ответа
Могу ли я сохранить координаты для встраивания UMAP?
Я использую модель UMAP следующим образом: embedding = umap.UMAP(n_components=2,n_neighbors=30, min_dist=0.0, metric='euclidean').fit(data) И построение: f = umap.plot.points(embedding, labels=df['name']) Это создает красивый график. Я хочу получить…
01 сен '21 в 04:39
0
ответов
вставлять данные с помощью UMAP
поэтому я пытаюсь встроить данные, называемые числовыми, с помощью UMAP кто-нибудь знает, как это исправить? Спасибо..
01 окт '21 в 19:51
0
ответов
AttributeError: объект «UMAP» не имеет атрибута «tqdm_kwds». Уже установлен umap-learn
(https://colab.research.google.com/drive/16E6-Og5iwPDu5Cf4TSk0sm4L6rxbdTd8?usp=sharing) Я получаю сообщение об ошибке в следующей строке input_embedding = umap_model.transform (input_scaled) **file_name = "/content/drive/MyDrive/umap_model.pkl" open…
03 ноя '21 в 05:01
0
ответов
На моем Mac не отображается график морского дна без сообщения об ошибке?
In [14]: import seaborn as sns ...: import matplotlib.pyplot as plt ...: ...: l = [41, 44, 46, 46, 47, 47, 48, 48, 49, 51, 52, 53, 53, 53, 53, 55, 55, 55, ...: 55, 56, 56, 56, 56, 56, 56, 57, 57, 57, 57, 57, 57, 57, 57, 58, 58, 58, ...: 58, 59, 59,…
12 ноя '21 в 09:35
0
ответов
Утерянная информация при уменьшении размерности с помощью umap
Я работаю с базой данных треков Spotify и пытаюсь понять, как танцевальность, живость и энергия колонок влияют на популярность (используйте дискретную популярность: -1, 0, 1). Я хочу уменьшить размерность с трех столбцов до двух. Вот фрагмент: reduc…
24 ноя '21 в 18:43
0
ответов
UMAP не работает на Jupyter (через Anaconda)
Я пытаюсь использовать UMAP в Jupyter (в среде Anaconda), но что-то работает неправильно. Ниже приведен код, который я использовал. # INSTALL UMAP conda install -c conda-forge umap-learn # this was what was mentioned on umap's website import umap.um…
11 дек '21 в 04:17