Результат визуализации Seurat UMAP отражается после запуска в двух идентичных средах

Question

Когда я запускаю один и тот же код R на моем локальном компьютере RStudio (R 4.0.2) и в Code Ocean R 4.0.3, у меня есть два разных результата визуализации UMAP, и они отражаются

[ ]

Я использую версию Seurat 3.2.0 в обеих средах и, в частности, для визуализации umap, вот строка:

      DimPlot(MU197PDXThgFiltered, reduction = "umap", label = TRUE, label.size = 6, pt.size = 0.5)

Я не могу привести воспроизводимый пример, но, может быть, кто-то сталкивался с этой проблемой раньше?

Answer 1

Я нашел это на Seurat github:

Точное расположение точек на графике UMAP может зависеть от разных компьютеров и ОС. Мы делаем все возможное, чтобы свести к минимуму любую случайность процедуры, исправляя случайное начальное число, но некоторые колебания между системами неизбежны, и беспокоиться не о чем.

За исключением точек на UMAP, выражения генов в кластерах и номера ячеек в них идентичны.