Описание тега proc-r-package

Описание тега Вопросы с тегом
NoneP ROC - это пакет R для кривых ROC.
1 ответ

Определение положительного класса в пакете pROC

Я хочу рассчитать различные метрики классификации (чувствительность, специфичность) с помощью пакета pROC. Для этого я могу использовать coords функция в pROC пакет как: # Load library library(pROC) # Load data data(aSAH) #Convert Good and Poor to 1…
23 июл '16 в 01:27
1 ответ

РПЦ Кривая в Блестящем

Я пытаюсь сделать Roc Curve, используя блестящий. Я попытался использовать оба пакета pROC и ROCR, и использовать renderPlot, но outputplot, показывающий NULL. Есть ли способ визуализации кривой ROC в блестящем приложении?
22 мар '18 в 03:51
2 ответа

R и Случайный Лес: Как CareT и PROC справляются с положительным и отрицательным классом?

В последние дни я анализировал эффективность реализации Random Forest в R и различные инструменты, доступные для того, чтобы получить: ППК чувствительность специфичность Таким образом, я использовал два разных метода: mroc и координаты из библиотеки…
04 окт '16 в 11:56
2 ответа

Можно ли вставить строку без дискриминации на графике ROC, используя ggroc?

Я создал график ROC с несколькими кривыми ROC, используя ggroc на основе pROC. Как я могу вставить строку без дискриминации? Я бы хотел, чтобы на моем графике не было линии от 0,0 до 1,1, чтобы я мог лучше визуально оценить свои ROC-кривые. Я попыта…
08 янв '19 в 16:26
1 ответ

Специфичность / чувствительность по сравнению с точками среза с использованием пакета pROC

Мне нужно построить следующий график, чтобы я мог выбрать оптимальный порог для модели логистической регрессии. Однако я не могу использовать пакеты (epi и roc), которые используются во многих исследованиях, которые я провел. У меня есть пакет PROC.…
20 дек '18 в 11:43
1 ответ

Функция прогнозирования ROCR в R возвращает сообщение об ошибке

Я смотрю на набор данных с одной непрерывной независимой переменной (Quant) и одной двоичной зависимой переменной (Binary). Я использовал полиномиальную модель, чтобы предсказать двоичное значение из непрерывной независимой переменной. Я надеялся сд…
27 июл '17 в 02:22
1 ответ

Изменить параметры по умолчанию для вычисления ROC (pROC) в процессе RFE (каретка) - R

Я вычисляю модель SVM-RFE, используя "ROC" в качестве метрики, с rfe функция (caret пакет). Насколько мне известно, rfe алгоритм оптимизирует значения AUC, используя roc функция pROC пакет, с его предопределенными аргументами. Тем не менее, я хотел …
24 май '16 в 10:25
1 ответ

Белые поля на графике R с использованием функции plot.roc()

Я пытался создать фигуру, похожую на фигуру на сайте. Однако я столкнулся с более простой проблемой: в моем R-графике есть пробелы, от которых я хотел бы избавиться. Это использует пакет pROC, Я включил воспроизводимый пример, который иллюстрирует п…
02 авг '16 в 15:33
1 ответ

Ошибка R при расчете значения AUC из пакета pROC

Я пытаюсь использовать pROC пакет в R для расчета чувствительности, специфичности и порогового уровня. Вот пример данных library(pROC) x<-sample(0:1,7974,replace=T) y<-sample(0:16049.2,7974,replace=T) myroc<-roc(x,y) coords(myroc, "best", r…
04 май '16 в 15:13
1 ответ

Можно ли изменить имена осей в ggroc?

Я строю несколько ROC-кривых с помощью ggroc и хотел бы, чтобы имена осей были "Истинно положительная скорость" и "Ложно-положительная скорость", а не чувствительность и спецификация. Возможно ли это сделать с помощью ggroc? Я уже пробовал следующее…
08 янв '19 в 08:32
2 ответа

Пакет pROC R с настроенными значениями отсечки?

Могу ли я использовать некоторые предварительно заданные значения отсечения (пороги) для построения кривой ROC с pROC пакет? Например, могу ли я ввести контрольные значения / значения случая и свои собственные пороговые точки, где рассчитать соответ…
17 июл '14 в 15:44
1 ответ

Передача объекта в функцию линий для данных графика

Моя проблема заключается в следующем. я использую ROCR пакет для построения графика данных. performance Функция возвращает объект, который я передаю, чтобы построить данные следующим образом: example <- performance(prediction1,"tpr","fpr") plot(e…
24 авг '18 в 17:03
2 ответа

Создайте ROC-кривую с помощью for или sapply

После долгих поисков я не смог найти ответ на свою проблему. Я хотел бы сгенерировать ROC-кривую с помощью pROC pakkage, используя цикл for или sapply. Моя база данных выглядит так (только с 26 столбцами и 74 строками): PT Bpt PA mnT1G mnT01 1 1 1 2…
11 ноя '16 в 07:56
1 ответ

Разница в среднем расчете AUC с использованием ROCR и pROC (R)

Я работаю с данными перекрестной проверки (10-кратное повторение 5 раз) из модели SVM-RFE, созданной с помощью caret пакет. я знаю это caret пакет работает с pROC пакет при вычислении показателей, но мне нужно использовать ROCR пакет для получения с…
16 май '16 в 10:59
1 ответ

Ошибка ROCR: неверный формат прогнозов

После получения моих прогнозов из glmnet я пытаюсь использовать функцию "прогнозирования" в пакете "ROCR" для получения tpr, fpr и т. Д., Но получаю эту ошибку: pred <- prediction(pred_glmnet_s5_3class, y) Error in prediction(pred_glmnet_s5_3clas…
24 ноя '16 в 10:05
2 ответа

pROC - изменение масштаба диаграммы ROC

Я использую следующий код для построения кривой ROC после выполнения логистической регрессии. fit1 <- glm(formula=GB160M3~Behvscore, data=eflscr,family="binomial", na.action = na.exclude) prob1=predict(fit1, type=c("response")) eflscr$prob1 = pro…
09 дек '16 в 09:17
1 ответ

Пакет pROC для вычисления AUC

Глядя на пакет pROC, я немного озадачен ответом и предиктором: ответ: коэффициент, числовой или символьный вектор ответов, обычно кодируемый 0 (контроли) и 1 (регистры). Предмет. Только два класса могут быть использованы в кривой ROC. Если вектор со…
01 май '12 в 14:25
3 ответа

Как работать с ROC-анализом нескольких классов в R (пакет pROC)?

Например, когда я использую функцию multiclass.roc в R (пакет pROC), я обучил набор данных случайным лесом, вот мой код: # randomForest & pROC packages should be installed: # install.packages(c('randomForest', 'pROC')) data(iris) library(randomF…
11 дек '13 в 10:29
1 ответ

Граничные значения ROCR и графики точности

У меня есть непрерывная независимая переменная (скажем, "высота") и бинарная независимая переменная (скажем, "получает работу"). Я хочу видеть, какое значение отсечения для высоты лучше всего предсказывает способность человека получить работу. Я так…
27 июл '17 в 04:47
1 ответ

Ошибка с предсказанием - пакет ROCR (с использованием вероятностей)

Я использовал функцию "rfe" с svm, чтобы создать модель с ограниченными возможностями. Затем я использую "прогнозирование" на тестовых данных, которые выводят метки классов (двоичные), 0 вероятностей классов, 1 вероятностей классов. Затем я попыталс…
29 ноя '16 в 02:38