Описание тега openbugs
OpenBUGS - это компьютерное программное обеспечение для байесовского анализа сложных статистических моделей с использованием методов Монте-Карло цепи Маркова (MCMC).
1
ответ
Как динамически создать файл модели openbugs (R, bash) с учетом набора параметров модели
Я подгоняю набор моделей, используя r2openbugs. Это требует от меня создания нового файла модели для каждой модели, которую я пробую. У меня есть набор комбинаций, которые я хочу протестировать (различные ковариатные наборы, включать ли случайные эф…
15 июн '17 в 11:13
0
ответов
Ошибка OpenBugs: ожидается оператор сбора c ошибка поз. 7515
Я пытаюсь оценить иерархические модели из R с помощью библиотеки R2OpenBUGS. Я уже посмотрел ответы на похожие вопросы, но ничего не получалось. Я был бы очень рад, если бы кто-то мог помочь. Модель следующая. model{ for (i in 1:n) { goals1[i] ~ dpo…
24 июл '16 в 17:50
0
ответов
Wishart Prior в OpenBUGS
В настоящее время я работаю над кодом OpenBUGS относительно двумерного нормального распределения. Распределение использует Wishart априори для точности, и у меня есть некоторые проблемы при обновлении модели. Моя модель загрузится, и она скомпилируе…
05 авг '17 в 10:20
1
ответ
R2OpenBUGS - несколько проблем с матрицами, списком и векторами
Я новичок в R2OpenBUGS и очень загадочные ошибки довольно разочаровывают. Я пытаюсь запустить модель, которая довольно проста. Я имел успех запуск аналогичных моделей раньше. Мои проблемы связаны с тем, что у меня есть двумерный массив (матрица)? Я …
16 мар '16 в 22:19
0
ответов
Сообщение об ошибке "BUGSHE~1.EXE перестал работать" в BRugs (R)
Я оцениваю довольно простую модель в OpenBUGS через BRugs Пакет в R. Для оценки модели требуется только один параметр, поэтому вычисления выполняются быстро, и все выглядит хорошо. Однако модель является частью более крупного имитационного исследова…
23 фев '19 в 23:14
0
ответов
Как кодировать пропущенное начальное значение купе в ODE, используя openbugs
Я хочу вывести параметры в обыкновенных дифференциальных уравнениях (модель отделения инфекционных заболеваний), используя openBUGS. Однако я не знаю начальную стоимость одного из отсеков. Как мне кодировать недостающее значение купе в openBUGS? Ниж…
10 фев '19 в 16:41
0
ответов
Ошибка WinBugs: элементы вектора пропорциональности многочлена [1,1] должны суммироваться в единицу
Я пытаюсь воссоздать модель, описанную в этой статье, в WinBugs14, и у меня возникли некоторые проблемы с пониманием ошибок, поскольку я использую ее впервые. Это версия кода с помеченными изменениями, которые я сделал. Мне удалось скомпилировать ег…
07 май '18 в 13:10
1
ответ
Покрытие кода OpenBUGS в PYMC3
Ранее я работал с OpenBUGS/WinBUGS для выполнения моей байесовской статистики, но решил перейти к использованию пакета PYMC3 в Python. Так что я довольно новичок в pacakage и все еще учусь использовать его полностью. У меня возникли некоторые трудно…
01 июн '17 в 06:55
0
ответов
Расшифровка предупреждающего сообщения OpenBUGs/WinBUGs от R
Я запускаю симуляцию в OpenBUGs в R через BRugs пакет. Я подгоняю несколько лог-линейных моделей Пуассона на каждой итерации моего моделирования. Я буду запускать моё моделирование для 100 итераций при разных значениях точности / дисперсии для моих …
21 фев '18 в 16:30
1
ответ
У меня есть код в OpenBUGS, но ошибка "переменная CR не определена"
model { for( i in 1 : N ) { dgf[i] ~ dbin(p[i],n[i]) logit(p[i]) <- a[subject[i]] + beta[1] * CR[i] } for (j in 1:94) { a[j]~dnorm(beta0,prec.tau) } beta[1] ~ dnorm(0.0,.000001) beta0 ~ dnorm(0.0,.000001) prec.tau ~ dgamma(0.001,.001) tau<-sqr…
26 мар '17 в 06:04
0
ответов
Внутренняя ошибка "ловушки" в OpenBUGS
У меня возникли проблемы с настройкой многомерной нормальной (мановоподобной) регрессии в OpenBUGS на R версии 3.3.2 (2016-10-31), платформа: x86_64-pc-linux-gnu (64-разрядная версия), работает под: Ubuntu 14.04.5 LTS. Моя модель: model { ### Likeli…
21 мар '17 в 16:12
0
ответов
Как сделать Xb вычисление в R2OpenBUGS, когда p не известно
Я хочу вычислить x1b1+x2b2+......+xpbp. Однако p неизвестно, я не могу записать это заранее. Поэтому я хочу сделать следующее. Но в ОШИБКАХ говорится об ошибке в нескольких определениях. betax <- 0 for(k in 1:p){ betax <- betax + beta[k]*x[i,k…
25 июл '16 в 01:56
0
ответов
Байесовская категориально-логистическая модель в R2OpenBUGS
Я пытаюсь согласовать категориально-логистическую модель, используя набор данных художников, содержащийся в библиотеке MASS. Я разделил набор данных на две части, чтобы в будущем можно было прогнозировать значения переменной School, используя логист…
11 янв '16 в 16:22
1
ответ
R2OpenBUGS округляет DIC до 4 значащих цифр
Я использую R2OpenBUGS для просмотра множества различных моделей, и я заметил, что каждый зарегистрированный DIC имеет не более 4 значащих цифр. Это казалось подозрительным, поэтому я установил DEBUG=TRUE и, конечно же, DIC = pD + Dbar округляется. …
29 фев '16 в 16:37
1
ответ
Укажите функцию logit явно в WinBUGS/OpenBUGS
Я новичок в OpenBUGS, и у меня возникла проблема с подгонкой модели с помощью функции logit(). Читая вокруг, я обнаружил, что одним из возможных решений этого было бы явное указание функции logit без использования собственной функции logit WinBUGS: …
06 сен '16 в 15:17
0
ответов
Индекс массива не является целочисленной ошибкой в OpenBUGS
Я пытаюсь запустить марковскую модель в OpenBUGS для оценки переходных вероятностей. Но я получаю сообщение об ошибке "Индекс массива не является целым числом" Вот мой код модели: model{ p[1,1] ~ dnorm(0,1) p[2,2] ~ dnorm(0,1) p[3,3] ~ dnorm(0,1) p[…
29 июл '16 в 14:22
1
ответ
R - OpenBugs - Несколько определений при ошибке узла - Пользовательское распространение
Я относительно новичок в R и OpenBugs и потратил много времени на устранение неисправностей этой модели. Мне удалось выяснить изрядное количество их самостоятельно через ресурсы онлайн, но я застрял на этой ошибке. Это говорит, что это "множественны…
28 сен '16 в 01:59
0
ответов
R2openbugs bugs() ошибка winepath: такого файла или каталога нет
Моя система Mac OS X El Capitan 10.11.6. Я установил OpenBUG, используя Winebottler(версия 1.8.6) и Wine. Когда я попытался вызвать OpenBUGS с помощью R, произошла следующая ошибка: sh: /opt/local/bin/winepath: No such file or directory Error in sys…
07 июл '18 в 09:47
1
ответ
Ошибка 'ожидается запятая' в OpenBUGS
Я пытаюсь подобрать модель, используя OpenBUGS. Вот код: model { # N observations for (i in 1:N) { y[i] ~ dbin(p.bound[i],1) p.bound[i]<-max(0,min(1,p[i])) logit(p[i])<-Xbeta[i] Xbeta[i] <- a[sp[i]]-0.5*pow(((X1[i]-opt1[sp[i]])/tol1[sp[i]])…
24 июл '15 в 09:03
1
ответ
OpenBUGS: инициализация модели
У меня проблема с инициализацией следующей модели в OpenBUGS model { #likelihood for (t in 1:n) { yisigma2[t] <- 1/exp(theta[t]); y[t] ~ dnorm(0,yisigma2[t]); } #Priors mu ~ dnorm(0,0.1); phistar ~ dbeta(20,1.5); itau2 ~ dgamma(2.5,0.025); beta &…
10 мар '16 в 12:45