Описание тега mumin

Вопросы с тегом
MuMIn (**Mu**lti**m**odel **In**ference) - это пакет R для выбора модели и усреднения модели на основе информационных критериев (AICc и т.п.).
0 ответов

Как построить график из резюме MuMIn model.avg()

Есть ли способ напрямую отобразить средние итоговые результаты модели из MuMIn model.avg() для разных переменных с доверительными полосами. Ранее я использовал ggplot и ggpredict для построения графиков из реальных моделей, но мне не удалось найти с…
02 мар '19 в 19:15
1 ответ

Сделайте модели из пакета rugarch для настройки с MuMIn

Я пытаюсь выполнить усреднение моделей и хочу объединить модели из пакета rugarch и модели, оцененные с помощью функции "lm". Я использую данные ежедневного финансового индекса, преобразованные в объект XTS. Тем самым я запускаю функции lm: X<-as…
11 мар '17 в 18:18
2 ответа

Dredge не работает при указании оптимизатора glmer

Я пытаюсь использовать dredge из пакета R MuMIn с глобальным биномом glmer модель. Я считаю, что мне нужно указать оптимизатор с control = glmerControl(optimizer="bobyqa") для сближения. Тем не менее, когда я иду использовать dredgeЯ получаю ошибку.…
19 дек '18 в 17:26
1 ответ

Прогресс-бар для MuMin Dredge

Я занимаюсь дноуглубительными работами, и некоторые операции по дноуглублению занимают дни, а некоторые - часы. Мне интересно, могу ли я сказать R дать мне статус прогресса, пока дноуглубитель работает, поэтому я знаю, как долго ждать. L <- lmer(…
21 дек '18 в 14:28
1 ответ

R MuMIn model.avg() - относительная важность не работает с вставленными формулами

Я пытаюсь использовать функцию MuMIn model.avg с модельными формулами, которые вставляются и используют индекс, а не прямой ввод, например: m1<-gls(as.formula(paste(response,"~",paste(combns[,j], collapse="+"))), data=dat) 'combns' - это двумерны…
03 авг '17 в 16:34
1 ответ

R - Подмножество в драге (MuMin) - включает взаимодействие только с b, если также взаимодействие с

Я новичок в R и здесь впервые, поэтому прости меня, если я не совсем правильно сформулировал это… Я хочу использовать dredge::MuMIn для изучения моих данных. Я только хочу включить взаимодействие между I(GISalt^2) и одна из других переменных среды, …
09 янв '18 в 11:49
0 ответов

Почему MuMIn дает странные результаты с MCMCglmm?

В качестве одного из вариантов выбора модели для MCMCglmm (см. Также этот связанный вопрос) я пробую усреднение модели с использованием пакета MuMIn. Кажется, это не работает - смотрите вывод ниже. Есть идеи почему? Вывод выглядит глупо. В частности…
23 июн '16 в 16:12
1 ответ

Модели не сходятся при использовании MuMIn::dredge

Я получаю некоторую ошибку от MuMIn::dredge функция в R и не знаю, как ее решить. Вот мои данные... library(lme4) library(MuMIn) library(arm) Я построил глобальную модель: options(na.action = "na.fail") global.model<-lmer(yld.res ~ rain + brk+ ac…
30 июл '16 в 18:37
1 ответ

MuMIn model.sel ошибка с моделями glmmTMB

Когда я подаю заявку model.sel функция к g0 Модель ниже, работает нормально. Однако, когда я создаю подобные модели, используя мои данные, я получаю ошибку, как показано ниже. Какие-нибудь подсказки, почему я мог получить эту ошибку? data(sleepstudy…
11 июн '18 в 12:13
1 ответ

Модель графика, подходящая для дискретной переменной, от средней модели

У меня есть набор линейных смешанных моделей, и я создал среднюю модель. Я хотел бы построить модель, подходящую для двух уровней фактора, включенного в среднюю модель. Простой пример: library(lme4) library(MuMIn) mtcars2 <- mtcars mtcars2$vs &lt…
24 ноя '17 в 11:18
0 ответов

Интервалы прогнозирования от среднего по модели

Можно ли получить интервалы прогнозирования из среднего значения модели в R? Я использовал MuMIn пакет, чтобы моделировать в среднем несколько линейных смешанных моделей (которые я использую, используя lme4::lmer()). MuMIn Пакет поддерживает модельн…
06 фев '18 в 21:34
2 ответа

Предсказание завершается неудачно, когда пакет "MuMin" установлен в R

Я получаю сообщение об ошибке при использовании предиката.gls, когда установлен пакет "MuMIn". Следующее (Пример 1) работает: ### EX. 1 library(nlme) # example code from https://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/nlme/html/predict.gls.html fm1 &l…
24 май '17 в 19:05
1 ответ

Невозможно запустить модели glmer с na.action=na.fail, необходимым для функции драгирования MuMIn

Mac OS 10.9.5, R 3.2.3, MuMIn_1.15.6, lme4_1.1-10 Воспроизводимый пример кода, используя пример данных Руководство пользователя MuMIn рекомендует использовать na.action=na.failиначе функция dredge не будет работать, что я нашел: Ошибка в драге: аргу…
29 фев '16 в 08:18
2 ответа

Получить model.avg, чтобы вернуть верхнюю модель, когда размер поднабора = 1

Я биолог, смотрящий на среду обитания многих видов птиц. Таким образом, у меня есть список глобальных моделей для каждого вида, и я использовал драги на каждой из них. Теперь я хочу использовать model.avg, чтобы получить усредненные коэффициенты для…
29 сен '17 в 11:41
1 ответ

Прогнозируемые значения с ошибкой выбрасывания MuMIn при заполнении = FALSE

Я сталкиваюсь с ошибкой, когда пытаюсь вычислить прогнозируемые значения из усредненного объекта модели, используя MuMIn пакет-х predict.averaging, Я был уверен, что когда full аргумент установлен в FALSE функция должна возвращать прогнозируемые зна…
29 окт '18 в 22:52
0 ответов

(R MuMIn) Ошибка поднабора функции земснаряда

Я пытаюсь выбрать переменные, используя корреляционную матрицу в качестве аргумента "подмножество" с помощью dredge() в MuMIn (R). Моя проблема точно такая, как описано в этом неразрешенном посте: я запускаю модель fm1* и использую dredge для провер…
09 фев '16 в 09:33
2 ответа

Извлечение средней модели из MuMIn для вывода латекса

Я пытаюсь извлечь две разные усредненные модели из MuMIn для вывода в латекс через texreg или же stargazer, Я хотел бы иметь одну таблицу, в которой я могу сравнить реакцию двух видов на различные наборы абиотических переменных, которая выглядит так…
09 мар '15 в 20:21
1 ответ

Генерация вложенных подмножеств в драге

В dredge (пакет MuMIn) я хочу использовать "подмножество", чтобы исключить любую модель, объединяющую переменную A с одной из B,C или D. Я пытался library(MuMIn) dg <- dredge (global.model, subset = !("A"&c("B","C","D")) который дает тот же р…
16 сен '17 в 13:30
1 ответ

Сообщение об ошибке dredge (пакет MuMIn): нет подходящего метода для logLik

Я столкнулся с ошибкой, о которой я не смог найти никакой информации, и я пока не смог ее выяснить. Вот пример: x1 <- rnorm(100,0,1); x2 <- rnorm(100,5,1); x3 <- rnorm(100,8,4) x4 <- rnorm(100,3,3); x5 <- rnorm(100,1,2); x6 <- rnor…
09 апр '14 в 01:21
2 ответа

Ранговая модель с QAIC с использованием MuMIn

Мне нужно ранжировать модель кандидата, используя критерий QAIC. Вот что я попробовал: library(MuMIn) model_global <- glm(vs ~ mpg + disp + wt, family = quasibinomial, mtcars) model_1 <- glm(vs ~ mpg, family = quasibinomial, mtcars) model_2 &l…
02 мар '14 в 11:40