(R MuMIn) Ошибка поднабора функции земснаряда

Я пытаюсь выбрать переменные, используя корреляционную матрицу в качестве аргумента "подмножество" с помощью dredge() в MuMIn (R).

Моя проблема точно такая, как описано в этом неразрешенном посте: я запускаю модель fm1* и использую dredge для проверки всех комбинаций переменных. Чтобы исключить некоторые комбинации, я использую матрицу sub1 sub1, следуя методу, описанному в демонстрационной версии dredge.subset.

> sub1
       X1    X2    X3    X4    X5    X6    X7    X8    X9  X10  
X1     NA    NA    NA    NA    NA    NA    NA    NA    NA   NA 
X2   TRUE    NA    NA    NA    NA    NA    NA    NA    NA   NA  
X3  FALSE FALSE    NA    NA    NA    NA    NA    NA    NA   NA
X4  FALSE FALSE  TRUE    NA    NA    NA    NA    NA    NA   NA
X5  FALSE FALSE FALSE FALSE    NA    NA    NA    NA    NA   NA 
X6  FALSE FALSE FALSE FALSE  TRUE    NA    NA    NA    NA   NA
X7   TRUE FALSE  TRUE FALSE FALSE  TRUE    NA    NA    NA   NA
X8  FALSE  TRUE  TRUE  TRUE  TRUE FALSE  TRUE    NA    NA   NA 
X9   TRUE  TRUE  TRUE  TRUE FALSE  TRUE FALSE FALSE    NA   NA
X10  TRUE  TRUE  TRUE  TRUE  TRUE FALSE FALSE FALSE  TRUE   NA 

Работает до 9 переменных; с более я получаю сообщение об ошибке:

> form
N ~ X1 + X2 + X3 + X4 + X5 + X6 + X7 + X8 + X9 + X10
> fm1<-glm(form,data=dfmod)
> ms1<-pdredge(fm1,subset=sub1,cluster=clust) 
Warning message: In pdredge(fm1, subset = sub1, cluster = clust) :
non-missing values exist outside the lower triangle of 'subset'

Это не так, как показано:

     any(!is.na(sub1[!lower.tri(sub1)]))
     [1] FALSE

В дополнение к предупреждению таблица выбора модели включает наборы переменных, которые не были разрешены матрицей корреляции.

Я нашел обходной путь, преобразовав матрицу sub1 в логическое выражение, которое затем отлично работает как условие поднабора. Но было бы интересно понять, что происходит с матрицей.

* обратите внимание, что то же самое происходит с glm и glmer

0 ответов

Другие вопросы по тегам