Нейровизуализация МРТ подготовка модели CNN
Я хотел бы знать пару вещей, чтобы прояснить мое замешательство. Я хочу работать над набором данных сканирования медицинских изображений МРТ из базы данных ADNI.
Каждое изображение МРТ при болезни Альцгеймера (БА) состоит из нескольких срезов. Должен ли я разделять каждый фрагмент сканирования изображения и маркировать каждый из них как AD или объединять все фрагменты сканирования изображения как сканирование одного изображения и маркировать его для классификации?
Большинство медицинских нейроизображений формата DICOM, NfINT, NII и др. Обязательно ли конвертировать их в png или jpg для сетевой модели CNN или сохранять в формате NfNIT или nii?
Я прочитал несколько существующих работ по нейровизуализации болезни Альцгеймера, но не нашел ответа на указанный выше вопрос. Даже я отправил электронное письмо автору исследовательской работы в ответ; Я понял, что они не могут помочь с этим, так как они очень заняты, и приносят искренние извинения за это.
Будет очень полезно, если у кого-нибудь найдется ответ, чтобы развеять мое замешательство и мысли. Спасибо.
1 ответ
Тренироваться с НИФТИ можно, например, с TorchIO. Нет необходимости разделять каждый фрагмент, вы можете использовать трехмерное изображение как есть.
Вы можете найти несколько примеров в документации .
Отказ от ответственности: я главный разработчик TorchIO.