Описание тега survminer
Вопросы, связанные с пакетом Survminer
0
ответов
Есть ли способ перейти от x к 100 по оси R?
Я хочу построить данные анализа выживаемости в R с использованием пакетов Survial и Survminer. Моя вероятность выживания колеблется от 0% до примерно 5%. Мне нужен график, у которого ylim установлено от 0 до 20, но также должно быть 100% по оси. Выг…
27 май '20 в 14:19
1
ответ
Ошибка "объект 'статус' не найден" при использовании coxph в R
Всякий раз, когда я добираюсь до функции "coxph" в моем коде, она выдает ошибку "Ошибка в Surv(время, статус): объект" статус "не найден". Но я не получаю такой же ошибки в другом месте. Что я могу сделать? Это мой текущий код: install.packages("sur…
21 янв '20 в 07:09
1
ответ
Длина переменной ошибки различается ggsurvplot_facet
Я пытаюсь бежать ggsurvplot_facet() но не могу пройти Error in model.frame.default(formula = surv_object2 ~ id, data = list( :variable lengths differ (found for 'id'). Любая помощь будет принята с благодарностью. Я считаю, что ошибка в survfit()/sur…
30 янв '20 в 02:47
1
ответ
Почему ggsurvplot_facet игнорирует pval.size?
Почему pval.size игнорируется ggsurvplot_facet()? Я пытаюсь изменить размер текста p-значения на моем графике выживания, используя ggsurvplot_facet(), но звонок pval.sizeпохоже, игнорируется. Если бы кто-нибудь мог помочь мне изменить размер p-значе…
30 янв '20 в 08:39
1
ответ
R: ggsurvplot цветные метки легенды (текст)
Я делаю сюжет выживания с помощью ggsurvplot, и единственное, чего я не могу добиться, это получить цветные метки на моей легенде: линии легенды окрашены в соответствии со слоями, но не соответствующими метками. Как я могу это сделать? Что у меня ес…
10 май '20 в 16:20
1
ответ
В R Studio моя таблица рисков удаляется из моего графика выживания, когда я добавляю линию перехвата. Есть ли способ решить эту проблему?
В R Studio моя таблица рисков удаляется из моего графика выживания, когда я добавляю линию пересечения. Есть ли способ решить эту проблему? Мой исходный код, который показывает таблицу рисков: library(readxl) library(ggplot2) library(survival) libra…
10 янв '20 в 02:35
1
ответ
Можно ли настроить текст p-значения в Survminer
Я генерирую кривые выживания для использования в презентации, и в идеале я хотел бы настроить цвет текста значения p. Возможно ли это? Я сделал пример с образцами данных, чтобы показать вам, что я сделал до сих пор. Все, что осталось, это цвет текст…
23 янв '20 в 20:25
1
ответ
Измените ggsurvplot (font.size) и тип доверительных интервалов
Я пытаюсь изменить и лучше понять, как функция ggsurvplot() работает (пакет: survminer): Прежде всего, немного кода: suppressPackageStartupMessages(library(survival)) suppressPackageStartupMessages(library(survminer)) suppressPackageStartupMessages(…
06 фев '20 в 23:08
0
ответов
Построение кривых выживаемости объекта coxPH с помощью ggsurvplot - каков самый простой способ?
Я хотел бы отобразить кривые выживаемости из ранее подобранной модели coxPH в R. R-Версия: 3.6.2 Версии пакета: выживаемость: 3,1-8 выживший: 0.4.6 У меня есть большой скрипт двухлетней давности, в котором есть разные фрагменты кода, которые выглядя…
09 мар '20 в 19:30
0
ответов
Добавление оси времени под графиком нескольких графиков ggsurvplots
У меня есть 3 ggsurvplots, которые объединены и упорядочены с помощью range_ggsurvplots() в 1 столбце. Я хочу добавить ось времени под окончательным графиком. Я пробовал 2 способа: В первом подходе я покрасил ось x первых двух таблиц рисков в белый …
16 июн '20 в 15:12
0
ответов
Построение кривой выживаемости с помощью функции выживания ()
У меня есть данные о выживании, df, как показано ниже: df <- structure(list(time_to_event = c(369L, 4597L, 2154L, 4426L, 823L, 4248L, 1045L, 4186L, 1305L, 1960L, 3905L, 5L, 3840L, 3802L, 3730L, 280L, 3678L, 81L, 59L, 3360L, 3318L, 3142L, 2912L, 2…
29 июл '20 в 10:24
1
ответ
Создайте пустой участок с помощью ggsurvplot
Можно ли создать пустой участок с помощью survminer::ggsurvplot? Вот пример. Скажем, в зависимости от количества групп я хочу создать график ggsurvplot. На рисунке 1 показан пример с 2 группами. Если нет групп, желаемым результатом будет Рисунок 2 (…
20 май '20 в 11:00
0
ответов
Постройте объект Survexp с помощью ggsurvplot
Я пытаюсь построить кривую ожидаемой выживаемости для когорты, рассчитанной с использованием таблицы смертности населения вместе с survexp, создавая объект Survexp, который затем хочу построить с помощью ggsurvplot из survminer(из-за эстетики). Он о…
16 янв '20 в 00:38
3
ответа
как я могу устранить ошибку "undefined columns selected" для ggforest
Как я могу устранить ошибку с выбранными неопределенными столбцами? Я загрузил выживший и пакеты для выживания. cox4<- coxph(formula= Surv(LOS,Mortality)~ BNPcat+HF_dx+Age+Sex+BMI+ Admit_QTc+FI02_comb+Admit_Lactate,data=DF) ggforest(cox4) > co…
12 июл '20 в 11:31
1
ответ
Вставка математических символов в легенды графиков R
Я использую Survminer для построения графика выживаемости с двумя кривыми выживаемости, одну для пациентов, получивших 4 единицы упакованных красных кровяных клеток (PRBC) во время операции, и одну для пациентов, получивших более 4 единиц PRBC. К со…
06 мар '20 в 17:35
1
ответ
Указание пользовательских временных точек для графика выживания
Я работаю над созданием графика выживания / совокупного события, используя ggsurvplot функция от survminerпакет. Я хочу указать пользовательские моменты времени для своего сюжета, но не могу понять, как это сделать. Вxlim а также break.x.byпараметры…
22 апр '20 в 20:19
0
ответов
Невозможно построить значения p при использовании facet.by из ggsurvplot. Сообщение об ошибке: "разная длина отличается"
У меня проблема, которую я не знаю, как решить. И похоже, это связано с моим набором данных (или нет?). Действительно, я действительно могу построить различные значения p при использованииfacet.byкогда я использую ваш пример из выпуска № 205 через н…
01 май '20 в 13:33
1
ответ
"Нечисловой аргумент бинарного оператора" при использовании ggsurvplot() + geom_dl()
Я хочу прикрепить ярлыки с помощью geom_dl к сюжету Каплана – Мейера (KM), созданного ggsurvplot. Он отлично работает, если я использую сюжетную частьggsurvplot. library(survival) library(survminer) library(directlabels) fit <- survfit(Surv(time,…
07 янв '20 в 10:32
3
ответа
Удалить имя переменной из легенды в ggsurvplot
Есть ли краткий способ удалить имя переменной в легенде графиков, созданных ggsurvplot? Пример: library(survival) library(survminer) set.seed(123) df=data.frame(gender=c(rep("male", 10), rep("female", 10)), value=c(rnorm(10,mean = 2), rnorm(10,mean …
12 май '20 в 11:56
0
ответов
Сообщение об ошибке недопустимого типа (список) с использованием ggadjustedcurves (пакет Survminer) в R
Я пытаюсь получить кривую выживаемости, показывающую влияние переменной "пол" с поправкой на переменную "days_to_birth". fit<-coxph(Surv(time = data$futime, event = data$fustat) ~ data$gender + data$days_to_birth ,data = data) ggadjustedcurves(fi…
13 май '20 в 00:43