Описание тега sundials

Солнечные часы (набор средств решения нелинейных и дифференциальных / алгебраических уравнений)
1 ответ

Солнечные часы установлены, но не работают в python с ассимуло

Cheerio, Я пытаюсь использовать Assimulo 2.9. на Mac OS X. Для этого я скачал и установил солнечные часы через cmake, создав builddir для файла загрузки и запустив../Downloads/sundials-2.7.0 $cmake ../Downloads/sundials-2.7.0 $make $make install Это…
11 окт '16 в 04:20
0 ответов

Как установить scikits.odes на Python 3.X

Я пробую другие решения ODE, кроме одаренности SciPy. Я нашел возможный, пакет scikits.odes. Требования включают в себя компилятор C и FORTRAN (я скачал MinGW-w64, никаких проблем), LAPACK (скачал, собрал, протестировал, кажется, хорошо) и SUNDIALS …
21 сен '18 в 15:01
2 ответа

Установка ассимуло и солнечных часов - ошибка

Я хочу использовать Ассимуло и Солнечные часы для решения дифференциальных алгебраических уравнений в Python, и поэтому я пытаюсь установить его на Ubuntu. Для установки солнечных часов я следовал инструкциям по установке, и, насколько я понимаю, эт…
31 янв '19 в 09:38
1 ответ

Связывание с библиотекой a c/ C++

У меня есть несколько основных вопросов относительно связи с C/C++ библиотека. Я пытаюсь понять разницу в использовании двух разных способов использования -L/usr/local/lib -lm использование и /usr/local/lib/libm.a использование. Например, когда я со…
24 июл '16 в 03:01
0 ответов

Сборка солнечных часов с MKL

Мне нужно собрать солнечные часы (как зависимость для другой библиотеки C/C++) в кластере Linux, который обеспечивает только MKL в качестве поддержки BLAS и LAPACK. Насколько я знаю, в отличие от других версий, обертки MKL BLAS и LAPACK не являются …
09 окт '18 в 20:24
0 ответов

Не удалось скомпилировать mex в Matlab 2014a

Я пытался скомпилировать файл.c в Matlab 2014a на Windows 7(64-битной) машине. Компилятор представлял собой Mingw-w64 gcc: mex -lsundials_nvecserial -lsundials_cvode -lm -IC:/sundials/include -LC:/sundials/lib model_pike_cvode.c Тогда это дало мне о…
30 авг '15 в 16:20
1 ответ

Солнечные часы ODE_vector преобразование в броненосец для приближения ODE

Я пытаюсь использовать библиотеки решателей Sundials ODE, чтобы аппроксимировать динамику расширения к уравнениям конкуренции Лотки-Вольтерра с множеством видов. Например, в случае двух видов dx1 / dt = r1 * x1 * (1 - (x1 + a12 * x2)) dx2 / dt = r2 …
21 апр '17 в 16:10
1 ответ

Солнечные часы Dropwizard Запланированное задание с объектом Hibernate

У меня есть эта солнечная задача в моем проекте dropwizard: @SimpleTrigger(repeatInterval = 10, timeUnit = TimeUnit.SECONDS) public class GitlabImporter extends Job { private static BranchDAO branchDAO; @Override @ExceptionMetered public void doRun(…
28 авг '18 в 14:19
0 ответов

Солнечные часы установлены, но не могут установить scikits.odes

Я хочу использовать python для решения системы уравнений DAE. Я обнаружил, что солнечные часы с scikits.ode могут быть полезны для этого случая. Однако я не могу установить то же самое. Я использую Ubuntu и установленные солнечные часы со следующими…
21 фев '19 в 22:09
0 ответов

Солнечные часы ARKode- прикрепить несколько полей к Солверу

Я хотел бы присоединить несколько полей (например, матрицы и векторы) к блоку памяти ARKode. К сожалению, вызывая подпрограмму присоединения ( int ARKodeSetUserData(void* arkode_mem, void* user_data) перезаписывает предыдущие прикрепленные данные. К…
04 окт '18 в 10:57
0 ответов

Решение жестких обыкновенных дифференциальных уравнений с использованием C и MATLAB

У меня есть 2 * m + 3 STIFF обыкновенные дифференциальные уравнения для решения. Я попытался решить эту проблему, используя MATLAB ode15s для m=1, и он отлично работает. Но я хотел бы использовать пакет CVODE Sundials для решения уравнений. Пытаясь …
18 янв '16 в 20:39
1 ответ

SimBiology симулятор не работает

Я пытаюсь смоделировать модель (с помощью решения солнечных часов) в MATLAB, и я получаю следующую ошибку: CVODES returned -4 from module CVODES function CVode: At t = 0 and h = 1.3093e-009, the corrector convergence test failed repeatedly or with |…
11 янв '17 в 03:36
1 ответ

Компиляция C++ в Rcpp с внешней библиотекой C

Я пытаюсь собрать пакет R с Rcpp код, который использует внешнюю библиотеку. Ранее я спрашивал SO о том, как использовать внешнюю библиотеку C в пакете здесь. Проблема, с которой я сталкиваюсь, состоит в том, как только я включаю следующую строку ко…
14 июн '16 в 18:53
0 ответов

Редкая, казалось бы, случайная ошибка сегментации и ошибка памяти только для чтения: почему? Как мне исправить?

Я пытаюсь решить систему DAE в Юлии, используя sundials.jl. Исходный код работает нормально, но симуляция Монте-Карло для количественного определения неопределенности иногда вызывает ошибку сегментации. `struct s_base s1::Float64 s2::Float64 end #DA…
10 июл '19 в 00:19
2 ответа

Как исправить "IDASolve: сбой корректора" при решении DAE с scikits.odes и Sundial?

Я пытаюсь решить систему DAE (2 ODE и 1 алгебраическое уравнение), используя решатель IDA из Солнечных часов ( https://computation.llnl.gov/projects/sundials/ida), через пакет Python scikits.odes ( https://scikits-odes.readthedocs.io/). Я использую …
24 июн '19 в 14:09
0 ответов

Dropwizard 2 Sundial Hibernate не имеет сеанса

Мы использовали Dropwizard в версии 1.3.13. Вместе с этим мы реализовали автоматизированные задачи с солнечными часами и солнечными часами dropwizard в версии 1.3.1. Большинство наших вакансий требует доступа к базе данных. Поэтому мы реализовали ме…
1 ответ

Python: как эффективно решить DAE с якобианом?

Я пытаюсь использовать пакет Assimulo для решения набора дифференциально-алгебраических уравнений (ДАУ). Я пытаюсь использовать алгоритм, аналогичный показанному здесь. Однако, похоже, нет возможности передать разреженную матрицу. Моя матрица Якоби …
0 ответов

Pathos KeyError с укропом при использовании метода экземпляра

Я пытаюсь запустить простую систему ODE с разными значениями параметра, используя Assimuloдля вызова CVode SUNDIAL. В качестве примера я написал эти функции и параллельно успешно решил проблему: from assimulo.solvers import CVode from assimulo.probl…
03 янв '20 в 20:41
0 ответов

Решатель солнечных часов для MATLAB или python

Я инженер, который работает над решением сложных, мультифизических, многодоменных одномерных задач PDE в MATLAB с использованием метода конечных разностей или конечных объемов. У меня нет проблем с этим, но я действительно хочу сделать то же самое в…
28 авг '20 в 16:24
1 ответ

неопределенные символы остаются, но общие библиотеки компилируются и, похоже, работают правильно

Моей целью было построить разделяемые библиотеки из SUNDIALS 2.7.0 - это решатели обыкновенных дифференциальных уравнений, написанных на C. Я загрузил исходный код и выполнил руководство по установке: запустите Cmake (с графическим интерфейсом), отм…