Описание тега ropensci
Пакеты R, созданные организацией R Open Science (сокращенно rOpenSci), которые взаимодействуют с хранилищами научных данных, журналами и поставщиками научных показателей.
0
ответов
Ошибка при использовании эластичного на сервере Linux, но нет ошибки на Windows
Когда я выполню elastic::Search(index=index,body=body,size=1000,scroll="3m") на сервере Linux я получаю следующую ошибку. invalid char in json text. <!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C// На окнах все нормально. Тем не менее, если я выполняю astic:: Sea…
23 янв '18 в 10:29
1
ответ
Передача переменной в solr auery
Я работаю с Solr с помощью библиотеки R Solrium После подключения к solr в переменной conn1 я делаю запросы следующим образом: solr_search(conn1,"collection_name", params = list(q = "price:1000",start = 0, rows = 20000,fl=c('column_name'))) Но тепер…
28 июл '18 в 21:10
0
ответов
Как загрузить ключ API в rnoaa с помощью R?
Я новичок в r и пытаюсь загрузить свой токен API, чтобы получить доступ к пакету rnoaa. У меня есть токен API, я просто не знаю, как получить к нему доступ. Кто-нибудь может объяснить, как загрузить мой ключ API в rnoaa с помощью R? Спасибо!
26 фев '14 в 21:59
1
ответ
Ошибка при использовании install_github: exdir не существует
Я пытаюсь установить пакет с github, но продолжаю получать следующую ошибку; "Error in unzip(src, list = TRUE) : 'exdir' does not exist". Я предполагаю, что у unzip нет разрешения на создание каталога для распаковки, но я не знаю, как передать парам…
10 окт '12 в 22:00
1
ответ
Преобразовать данные в ошибку Geojson
Я пытаюсь использовать пакет geojsonio для записи некоторых файлов geojson из data.frames, извлеченных из некоторых других пакетов R. library(ggplot2) library(geojsonio) us_state <- map_data('state') geojson_write(us_state, geometry="polygon", gr…
03 дек '16 в 21:22
3
ответа
Как искать в PubMed или других базах данных, используя R
Я недавно использовал отличный rplos пакет, который облегчает поиск по статьям, размещенным в API публичной библиотеки науки (PLOS). Я наткнулся на загвоздку в том, что в самом API, похоже, есть некоторая недостающая информация, главная из которых з…
08 мар '14 в 07:57
0
ответов
Блокировка среды, но не.Random.seed
Можно ли заблокировать глобальную среду и разрешить .Random.seed быть установленным или удаленным? Поведение по умолчанию lockEnvironment() слишком агрессивен для моего случая использования. lockEnvironment(globalenv()) rnorm(10) #> Error in rnor…
21 фев '19 в 16:17
1
ответ
Что делать, если набор данных NOAA ERDDAP не найден?
Я пытаюсь загрузить данные ERDDAP с использованием сетки rnoaa пакет в R. Хотя получение данных отлично работает для некоторых наборов данных, у меня есть некоторые проблемы с получением данных для некоторых наборов данных, в частности. Например, ко…
11 янв '15 в 00:02
0
ответов
R: RGDAL написание GeoJSON
У меня проблема с rgdal, который сбрасывает информацию о проекции при записи файлов geoJSON. library(rgdal) inputJSON<- readOGR("test.geojson", "OGRGeoJSON") # works! Если я наберу summary(inputJSON) я получаю следующий вывод: Object of class Spa…
25 авг '15 в 11:52
1
ответ
План остановки дракона заставляет его восстанавливать цели, которые он уже построил ранее
Я сейчас пользуюсь drake запустить набор из>1k моделирования. Я подсчитал, что на запуск комплекта уйдет около двух дней, но я также ожидаю, что мой компьютер в любой момент в тот период выйдет из строя, потому что, ну, в общем-то, так и есть. Очеви…
12 ноя '18 в 18:59
2
ответа
Конвертируйте свойства "мультифункционального" GeoJSON в R пространственных объектов
Обычно вы можете читать файлы Geojson в R с верным readOGR, как показано здесь. Однако это не подходит для многоплановых геоджонов. Воспроизводимый пример: downloader::download("https://github.com/Robinlovelace/Creating-maps-in-R/raw/master/data/tes…
01 июн '15 в 20:50
1
ответ
Как индексировать данные с помощью index_create() в эластичном пакете в R
Это мой код в R для индексации данных радужной оболочки. library(elastic) iris<-datasets::iris body <- list(data = list(iris)) index_create(index = 'iris',body = body) но это дает следующую ошибку. Error: 400 - Failed to parse content to map. …
03 ноя '17 в 12:49
1
ответ
Ошибка соединения с защищенным Elastic Search R - клиент запросил протокол TLSv1, не включен или не поддерживается
Я использую elastic 0.7.8 R пакет для подключения к моему Elastic Search пример. Недавно я попытался защитить Elastic Search с помощью Search Guard 2, Все работает штрафом после его обеспечения. Но когда я пытаюсь подключиться с R, это не удается. l…
14 ноя '16 в 08:46
2
ответа
Блестящая ошибка при использовании nearPoints в событии renderPlotly click
Я хотел бы получить nearPoints используя данные из события клика. Я нашел приведенный ниже фрагмент с веб-страницы Shiny, и он работает нормально, как и ожидалось. output$plot <- renderPlot({ d <- data() plot(d$speed, d$dist) }) output$plot_cl…
05 авг '17 в 18:43
1
ответ
Прокси и HTR против RCurl
Кто-нибудь слышал о проблемах с использованием RCurl против httr когда пользователь использует прокси? У меня есть этот пакет taxize, в котором некоторые функции используют RCurl и некоторые используют httr, Пользователь сообщает о двух функциях, ко…
25 авг '14 в 15:35
1
ответ
Как скачать данные геойсона и прочитать их в R
# From http://leafletjs.com/examples/choropleth/us-states.js states <- geojsonio::geojson_read("json/us-states.geojson", what = "sp") bins <- c(0, 10, 20, 50, 100, 200, 500, 1000, Inf) pal <- colorBin("YlOrRd", domain = states$density, bins…
16 апр '17 в 23:32
0
ответов
Агрегировать и извлекать данные из Elasticsearch в RStudio
Я пытаюсь запросить агрегированные данные из Elasticsearch в RStudio. Мой код в R: aggs <- '{ "aggs": { "my_buckets": { "composite": { "sources": [ {"function": {"terms": {"field": "function"}}}, {"session": {"terms": {"field": "session_id"}}}, {…
19 июл '18 в 12:48
1
ответ
Записать фрейм данных в Elastic Search с помощью @timestamp
Я изучаю elastic Пакет R для записи фрейма данных в ElasticSearch. я использую docs_bulk функция. Один из столбцов в моем фрейме данных - @timestamp, который находится в POSIXct формат. Но поле сохраняется в Elastic Search как строка. Любая идея о т…
09 ноя '16 в 16:29
3
ответа
R Блестящая ошибка: как работать с событиями щелчка в случае двух сюжетных графиков?
У меня есть два сюжета в блестящей приборной панели. Когда я нажимаю на первый сюжетный график, интерактивное событие работает нормально. Но когда я выполняю ту же операцию на втором графике, который представляет собой столбчатый столбец, окно закры…
22 авг '17 в 15:49
1
ответ
Связывание функций с purrr и ссылки на вложенные переменные
Я собираю данные из большой онлайновой базы данных (GBIF), которая требует трех шагов: (1) сопоставить идентификатор "ключа" GBIF с названием вида, (2) отправить запрос в базу данных, получив ключ загрузки ("res") взамен и (3) загружать, импортирова…
15 апр '18 в 17:33