Описание тега r-mice
Множественное вменение с использованием полностью условной спецификации (FCS), реализованной алгоритмом MICE. У каждой переменной есть своя собственная модель вменения. Предусмотрены встроенные модели вменения для непрерывных данных (соответствие прогнозируемого среднего, нормальное), двоичных данных (логистическая регрессия), неупорядоченных категориальных данных (политомическая логистическая регрессия) и упорядоченных категориальных данных (пропорциональные шансы).
1
ответ
Как выбрать строки с определенным отсутствующим рисунком?
Итак, у меня есть набор данных, который содержит много пропущенных значений. Я хочу отделить данные от разных отсутствующих моделей. Я нашел пакет "мыши", который очень удобен для суммирования шаблонов пропущенных значений. Однако, когда я хочу выбр…
23 окт '15 в 03:35
1
ответ
R mouse: указание максимального количества предикторов с использованием quickpred
Я нашел quickpred функция в mice полезно для предоставления некоторых рекомендаций по выбору переменных для использования в качестве предикторов в процессе множественного вменения. Я недавно натолкнулся на сценарий, где quickpred уменьшено количеств…
11 авг '17 в 06:25
0
ответов
Применить набор отсутствующих функций к набору данных в R
Недавно я наткнулся на пакет validate в R, который очень полезен, когда вы хотите проверить полный набор данных с предопределенными правилами, например, например: v <- validator( Species.na = !is.na(Species), Species.range = Species %in% c("setos…
19 май '16 в 05:12
1
ответ
В R, как получить статистику среднего процента по столбцу из нескольких фреймов данных?
Некоторое время назад я провел несколько вменений с mice() 20 раз и сохранил их, используя следующее: for (i in 1:20) { write.csv(complete(imp20, i), file=paste("imp", i, ".csv", sep="")) } Теперь я хотел бы вывести средние значения n и % для переме…
21 авг '17 в 14:42
2
ответа
Заменить все NA с -1 в r на dplyr
В настоящее время я работаю с тидиверсом в R. После использования мышей для вменения NA некоторые столбцы все еще имеют NA из-за того, что они изначально малонаселены (я полагаю). В качестве окончательной проверки я хочу заменить все оставшиеся NA н…
10 окт '18 в 21:45
0
ответов
Объединенные оценки для преобразованных множественных вмененных наборов данных
У меня есть продольный набор данных, на котором я выполнил многократное продольное вменение (см. Здесь метод). Я хочу рассчитать общий балл для каждого из m вмененных наборов данных, сложив вместе баллы за каждый период времени для каждого человека.…
06 фев '18 в 04:48
0
ответов
Ошибка в FUN(newX[, i], ...): "x" должно быть числовым: при использовании мышей
Я пытаюсь вписать пропущенные значения, поэтому я попытался использовать пакет мышей. Мои данные следующие: ID Date DayNum Day Hour Transaction 1 07/01/16 1 6 0 20 1 07/01/16 1 6 1 30 1 07/01/16 1 6 2 NA 1 07/01/16 1 6 3 NA 1 07/01/16 1 6 4 39 1 07/…
22 ноя '16 в 21:32
0
ответов
Функция Pool.Scalar мышей, возвращающих NA
Я ввел данные, используя пакет мышей в R. Набор данных содержит факторную переменную с n уровнями фактора. Я хотел бы рассчитать долю каждого фактора и вернуть стандартные ошибки с учетом вмененных значений. Ниже приведен пример кода. data(nhanes) n…
24 фев '17 в 12:43
0
ответов
Уменьшено количество строк при использовании пакета MICE для вменения
У меня есть многомерный временной ряд. Я использую пакет MICE для заполнения НС. Это приводит к уменьшению количества строк, которые я не могу себе позволить, потому что это данные временных рядов. К сожалению, я не могу воспроизвести данные здесь. …
10 дек '18 в 10:07
0
ответов
Использует ли прогностическое среднее совпадение (pmm) в пакете MICE только строки без каких-либо пропущенных данных для оценки его коэффициентов?
У меня есть дата-фрейм, который содержит данные о количестве различных растений в течение 5 последовательных лет (1 значение в год; от T2 до T6) для разных участков (15 участков) и обработок (просмотр и просмотр без просмотра). Т2-Т6 находятся в сто…
02 авг '17 в 14:16
1
ответ
Непонятная ошибка с пакетом мышей
Я использую пакет мышей для интерполяции некоторых пропущенных значений. Я успешно использую мышей во многих случаях без каких-либо проблем. Однако сейчас я сталкиваюсь с беспрецедентной проблемой, то есть после первой итерации я получаю следующую о…
01 июл '16 в 20:21
0
ответов
Почему импутация мышей дает мне другие результаты после обновления версии R?
После перехода с компьютера под управлением R 3.4.0 на компьютер под управлением R 3.5.0 точно такой же код дает мне другие результаты для моего вменения с использованием пакета mice, который изменился с версии 2.46.0 на 3.3.0. В частности, некоторы…
13 авг '18 в 18:48
1
ответ
Сумма остатков в квадрате для множественного вливания с использованием пакета мышей в R
С mice пакет, как мы проверяем сумму остатков в квадрате объединенного анализа? library(mice) imp <- mice(nhanes, seed = 24500) fit <- with(imp, lm(chl ~ age + bmi)) pool(fit) summary(pool(fit)) fit содержит анализ для каждого входного набора …
13 дек '16 в 18:30
1
ответ
Автоматически сравнивать вложенные модели из glm.mids мышей
У меня есть модель с множественным вменением от R mice пакет, в котором есть много факторных переменных. Например: library(mice) library(Hmisc) # turn all the variables into factors fake = nhanes fake$age = as.factor(nhanes$age) fake$bmi = cut2(nhan…
29 окт '14 в 00:54
1
ответ
Анализ временной задержки в списке вмененных наборов данных
Мой вопрос и данные аналогичны посту в: Циклические данные с последовательными выводами временных задержек Коэффициенты линейной регрессии set.seed(242) df<- data.frame(month=order(seq(1,248,1),decreasing=TRUE), psit=c(79,1, NA, 69, 66, 77, 76, 9…
24 сен '17 в 23:52
1
ответ
Заменить значения выходного столбца в пределах диапазона на "True"
Я пытаюсь написать функцию, включающую пакет MICE, и хочу указать, сходятся ли цепочки Маркова в вменяемом наборе данных по критериям статистики Гельмана и Рубина, используемой в Rhat.mice (из пакета "miceadds"), заменяя все значения между 0,999 и 1…
27 апр '18 в 02:12
1
ответ
Как выбрать лучшие вмененные данные с помощью мышей
Используя пакет мышей, я вычислил набор данных как: имп <- мыши (nhanes) Он генерирует 5 вмененных данных для каждой переменной: imp $ imp $ bmi 1 2 3 4 5 1 35,3 30,1 26,3 28,7 27,2 3 30,1 22,0 30,1 28,7 22,0 4 21,7 27,2 25,5 24,9 21,7 6 24,9 25,5 2…
18 апр '17 в 19:18
2
ответа
Запустите glm.mids для подмножества вмененных данных от мышей (R)
Я получаю сообщение об ошибке при попытке запустить glm.mids на подмножестве mids Вменение объекта: library(mice) imp2 = mice(nhanes) glm.mids( (hyp==2)~bmi+chl, data=imp2, subset=(age==1) ) выдает загадочное сообщение об ошибке "Error in eval(expr,…
20 окт '14 в 19:46
2
ответа
R - как передать формулу в конструкцию with(df, glm(y ~ x)) внутри функции
Я использую mice пакет в R, чтобы умножить-вменять некоторые недостающие данные. Мне нужно иметь возможность указать формулу, которая передается with(df, glm(y ~ x)) построение внутри функции. это with() конструкция является форматом, используемым m…
30 июл '16 в 04:07
3
ответа
Как извлечь агрегированные вмененные данные из "мышей" R-пакета?
У меня есть вопрос относительно агрегирования вмененных данных, созданных R-пакетом "мыши". Насколько я понимаю, "полная" команда "мышей" применяется для извлечения вмененных значений, например, первого вменения. Тем не менее, при выполнении в общей…
02 мар '15 в 16:12