Описание тега metafor
Пакет metafor - это бесплатное дополнение с открытым исходным кодом для проведения и визуализации метаанализов с помощью статистической программной среды R.
1
ответ
Удаление верхнего и нижнего элементов конфигурации из аннотаций в Metafor
Я использую пакет Metafor для построения лесных графиков, и мне было интересно, знает ли кто-нибудь, как опустить верхний и нижний элементы конфигурации в текстовых аннотациях, например, когда одна группа является ссылкой, а результат имеет значение…
23 сен '18 в 12:48
0
ответов
R: RMA метафоры для объединения значений между 0 и 1
Я заинтересован в объединении оценок выживаемости сердечно-сосудистых заболеваний в возрасте 70 лет. Поскольку это оценки выживаемости, они варьируются от 0 до 1 (аналогично пропорции). У меня есть 5 исследований, и резюме оценок, 95% CI, n и SE пок…
16 окт '18 в 15:49
1
ответ
Вычисление оценок с помощью rma.glmm: ошибка, когда 2 оценки идентичны
Я использую rma.glmm для мета пропорций из 2 разных исследований. Например, доля лиц с (xi) и без (xii) нежелательным явлением через 6 месяцев: library(metafor) #6 months study=c("1", "2") ni = c(41, 19) xi = c(26, 14) xii = c(15, 5) NP6monthAT <…
09 дек '17 в 00:13
0
ответов
escalc и rma (metafor) для объединения ставок с положительными и отрицательными значениями в R
У меня есть данные, которые являются оценочными показателями госпитализации по конкретному заболеванию. Тарифы рассчитываются с использованием GAM, отдельно для 6 сайтов. Я хотел бы рассчитать объединенную оценку, суммирующую показатель для всего ре…
18 окт '18 в 04:43
1
ответ
Как избавиться от предварительно напечатанного текста на лесном графике с помощью Metafor/R?
Я использую пакет Metafor для проведения мета-анализа, а затем и лесного участка. Когда я печатаю свой лесной участок, автоматически появляется текст "RE Model", как показано на прилагаемой распечатке. Я не могу понять, как удалить "RE Model", хотя …
26 июл '18 в 09:42
1
ответ
Добавление пробелов в данных для лесного участка в метафоре
Я новичок в R и работаю над созданием лесного участка с набором данных, используя metafor пакет-х forest.default реализация (у меня есть только x, ci.ub а также ci.ub в данных по лесному участку) Я почти закончил, и мой график выглядит примерно так,…
04 янв '17 в 17:11
1
ответ
R metafor лесной участок, как добавить CI 95% заголовка над столбцом
Как добавить заголовок: "ИЛИ [CI 95%]" над столбцом доверительного интервала (3d столбец) и заголовок "Когорта" над первым столбцом? Это мой код: library(metafor) y <- scan(what=numeric()) 0.9158 0.6304 se <- scan(what=numeric()) -0.08461987 -…
18 дек '18 в 02:30
1
ответ
Оставьте один, но для групп в R
Цель Вернуть элементы из нескольких списков, сгенерированных функцией, в виде строк во фрейме данных. Пример данных: delete<- structure(list(f = structure(c(2L, 3L, 2L, 1L, 1L, 4L, 4L, 5L, 3L, 5L), .Label = c("a", "b", "c", "d", "e"), class = "fa…
29 май '18 в 20:09
1
ответ
Как определить координаты x, y при добавлении текста в метафору
Я использую пакет metafor для создания графиков Forest в R. Я хотел бы добавить текст в свои графики для создания меток с помощью функции text(). Мне интересно, как проще всего определить координаты x,y того места, куда я хочу добавить текст? В наст…
26 июл '18 в 01:05
0
ответов
Модераторский анализ для подгрупп в метафоре
У меня есть набор данных с 2 модераторами "модель" и "механизм", которые имеют 3 и 5 уровней соответственно. Отдельная мета-регрессия с каждым модератором с использованием функции "rma()" в "metafor" показала, что оба они значительно влияют на сумма…
17 янв '18 в 12:17
2
ответа
Избегайте предупреждений от ЛОЖНОЙ части ifelse()
Я создал пользовательскую функцию, которая вычисляет поправку смещения Хеджеса для c () для g (Hedges, 1981). Это напрямую основано на metafor::.cmicalc() функция от library(metafor), Это делает это: hedges_c <- function(df) { return(exp(lgamma(d…
23 ноя '17 в 22:16
1
ответ
Неправильный расчет отношения риска / относительного риска с мета-пакетом escalc() для мета-анализа
У меня быстрый (и мне жаль, если глупый) вопрос. Я использую пакет метафора и эту функцию: data<-escalc(measure = "RR", ai=1, bi=0, ci=43, di=443, append=TRUE) рассчитать относительный риск. В то время как мои ручные вычисления говорят о 11.30 (l…
09 май '18 в 19:24
1
ответ
Как разделить участок длинного леса при мета-анализе с помощью пакета metafor в R?
Я провожу метаанализ, используя пакет метафор. Поскольку мой набор данных включает в себя много исследований, лесной участок становится очень длинным, и я едва могу читать. Есть ли способ разделить лесной участок? Спасибо.
19 фев '18 в 02:17
1
ответ
Снять метки на конце элементов конфигурации в метафоре лесного участка
У меня есть foresplot в r с использованием пакета metafor: #forestplot par(mar=c(2.75,0,0,0)) par(font=2,mgp=c(2.3, 0.8, 0), xaxs = "i") metafor::forest.rma(res, alim=c(-1, 3.75), xlim = c(-5, 3.5), at = c(-1, -.5, 0 , .5, 1, 1.5, 2, 2.5, 3), xlab =…
02 мар '18 в 20:45
0
ответов
Как я могу добавить исходные доверительные интервалы отношения рисков обратно в участок метафора леса после преобразования из преобразования журнала?
Я выполняю метаанализ в метафор. После преобразования лесного графика обратно из логарифмического масштаба в нормальный масштаб, я надеюсь добавить исходные доверительные интервалы (указанные в ci.lb и ci.ub в данных ниже). Это связано с тем, что до…
02 дек '18 в 19:29
0
ответов
Многоуровневый метаанализ продольных данных с модераторами с использованием метафоры
Мне нужно использовать metafor Пакет для анализа некоторых вложенных данных и представления результатов довольно наивной статистике, поэтому я надеюсь получить некоторую обратную связь о модели и способах подведения итогов пакета. Данные получены из…
01 окт '18 в 01:35
1
ответ
metafor в сочетании с glmulti: как исключить нежелательные взаимодействия
Я подхожу к следующему: rma.glmulti.ran <- function (formula, data, random, ...) { rma.mv(as.formula(paste(deparse(formula))), Variance, random= ~1 | Experiment, data = msa, method="REML", ...) } msa_res <- glmulti(MSA ~ MAPl+MAT_e+Duration.yr…
05 сен '17 в 08:11
1
ответ
Добавление меток в научной нотации к лесным участкам с использованием пакета metafor
Так что я делаю мета-анализ с использованием meta.for пакет в R, Я готовлю цифры для публикации в научном журнале и хотел бы добавить p-значения к своим лесным графикам, но с научной аннотацией в формате x10-04 скорее чем стандарт e-04 Однако аргуме…
06 фев '18 в 18:30
1
ответ
Двумерная модель и функция "Предсказание.рма ()" (пакет "Метафор")
Предположим, у меня есть следующий результат модели: > summary(msa_res@objects[[1]]) Model Results: estimate se zval pval ci.lb ci.ub intrcpt 0.9397 0.0667 14.0850 <.0001 0.8090 1.0705 *** MAT_e -0.0079 0.0035 -2.2691 0.0233 -0.0147 -0.0011 * …
02 сен '17 в 08:39
2
ответа
R - пакет Metafor - рассчитывает и отображает соотношение шансов вместо логарифмического шанса
По сути, я хочу создать свой лесной участок, используя пакет metafor. В настоящее время он работает очень хорошо, за исключением того факта, что он выдает соотношение логарифмов, в то время как я хочу, чтобы само соотношение чистых коэффициентов. Ес…
10 мар '18 в 21:58