Попытка использовать lsmeans без пакета "lmerTest"
Я использую следующую смешанную модель, используя пакет lme4:
moms.rest.lmer <- lmer(rest ~ habitat + (1|year) + (1|ID))
где отдых - это числовое значение, а среда обитания - факторная переменная с 3 уровнями. Я пытаюсь получить попарные сравнения трех уровней среды обитания, используя lsmeans из пакета lsmeans:
moms.rest.lsm <- lsmeans(moms.rest.lmer, pairwise ~ habitat, adjust="Tukey")
Я использовал этот метод более года без проблем, но мне нужно перезапустить модель, и теперь внезапно я сталкиваюсь с этой ошибкой:
Loading required namespace: lmerTest
Failed with error: ‘there is no package called ‘lmerTest’’
Install package 'lmerTest' to obtain Satterthwaite degrees of freedom
Я читал, что пакет lmerTest имеет свою собственную версию lsmeans (lsmeansLT), но я не хочу использовать пакет lmerTest, так как кажется, что он не выполняет парных сравнений. Как мне заставить мой старый код работать с использованием lsmeans?