Описание тега lifelines
NoneLifelines - это реализация анализа выживаемости на Python. Используйте этот тег для вопросов о линиях жизни.
2
ответа
Выбор характеристик (ковариат) в CoxPHFitter, Анализ выживаемости жизненных линий
Я использую эту реализованную модель в Python с целью анализа выживания: из спасательных кругов импорт CoxPHFitter К сожалению, я не могу (я не знаю, как) обойти все ковариаты (функции), чтобы запустить регрессию индивидуально с целью выбора признак…
25 ноя '18 в 12:17
1
ответ
Анализ выживания в Python. Какова частичная опасность в этом методе?
Я пытаюсь использовать пакет Python Lifelines для калибровки и использования модели пропорциональной опасности Кокса. Итак, итоговый результат: coef exp(coef) se(coef) z p lower 0.95 upper 0.95 PD -1.1446 0.3183 0.0814 -14.0563 0.0000 -1.3042 -0.985…
02 ноя '18 в 11:51
2
ответа
Как бороться с необратимой матрицей в анализе выживания
Я новичок в анализе выживания. Я пытался с помощью CoxPHFitter Но я наткнулся на эту ошибку. numpy.linalg.linalg.LinAlgError: Matrix is singular. После этой ошибки я узнал, что в одной из моих колонок есть необратимая матрица. Так что мне теперь дел…
04 дек '18 в 05:46
0
ответов
Пользовательский запрос Wordpress - сравнение дат и составление списка событий
Это WordPress (тема для жизни), я хочу показать предстоящее событие... и прошедшее событие отдельно... Помогите мне написать пользовательский запрос
31 янв '19 в 05:04
0
ответов
Верхний предел продолжительности для анализа выживания
У меня есть модель спасательных кругов, которая мне подходит, используя следующее: model = WeibullAFTFitter() model.fit(train, 'duration', event_col='y', show_progress=True) Однако длительность, которую он предсказывает для моего набора тестов, чрез…
20 май '19 в 05:48
1
ответ
Как изменить вывод моего изображения COXPH, нарисованного cph.plot_covariate_groups
Я не знаю, как я могу изменить выходное изображение, предоставленное линиями жизни, так как я не знаком с "cph.plot_covariate_groups". К сожалению, здесь нет подробного описания по этой ссылке; https://lifelines.readthedocs.io/en/latest/Survival%20R…
11 апр '19 в 10:09
1
ответ
python 3.6 virtualenv - сбой openblas
Я работаю на Win7 64 бит, и создал virtualenv с Python 3.6. Для начала я установил последний NumPy от pypi (numpy-1.16.2-cp36-cp36m-win_amd64). Тем не менее, даже простой импорт NumPy приведет к python.exe сбой с: Problem signature: Problem Event Na…
18 апр '19 в 07:36
1
ответ
Прогнозирование вероятности выживания в настоящее время
Я тренирую свою модель выживания со следующими линиями: wft = WeibullAFTFitter() wft.fit(train, 'duration', event_col='y') После этого я хочу посмотреть, какова вероятность выживания в настоящее время (duration колонка). То, как я сейчас это делаю, …
14 май '19 в 08:28
1
ответ
Можно ли запустить модель Кокса-Пропорционально-Опасных Опасностей с экспоненциальным распределением базовой опасности в "линиях жизни" или другом пакете?
Я считаю использование lifelines пакет, чтобы соответствовать модели Кокса-Пропорционально-Опасности. Я читал, что линии жизни используют непараметрический подход, чтобы соответствовать базовой опасности, что приводит к различным baseline_hazards дл…
27 июн '19 в 11:30
0
ответов
Как можно запустить модель Time-Varying-Cox-Proportional-Hazards-Model с экспоненциальным распределением базовой опасности в "линиях жизни"?
У меня есть продолжение этого вопроса. Исходная ситуация: я хотел оценить модель пропорционального риска Кокса с экспоненциальным распределением для базовой опасности. Часть 1.) решения состояла в том, чтобы ближе рассмотреть функцию опасности, кото…
08 июл '19 в 18:18
1
ответ
Предсказать оценку выживаемости и CLTV для договорных дискретных политик / условий
Я пытаюсь предсказать оценку выживаемости и LTV для договорных и дискретных полисов (в страховании) в Python. Я просмотрел несколько сайтов, но смог найти много примеров только для неконтрактных (в розницу).Я использовал следующий код: from lifeline…
04 июн '19 в 18:38
0
ответов
Не удалось загрузить каналы жизни (Результат показывает: ошибка атрибута: модуль 'scipy.misc' не имеет атрибута 'logsumexp')
Я пытаюсь запустить пакет спасательных кругов, import numpy as np from scipy import stats import pandas as pd from scipy.special import logsumexp from lifelines import KaplanMeierFitter, CoxPHFitter from lifelines.statistics import logrank_test И ре…
09 июл '19 в 18:50
1
ответ
Продолжительность цензурированных событий на линиях жизни пакет анализа выживаемости
Я работаю с пакетом Lifelines на Python, который предназначен для анализа выживаемости. когда я устанавливаю разные значения для duration_col для цензурированных событий (тех, которые имеют 0 для event_col), я получаю разные результаты. Дело в том, …
04 окт '19 в 17:42
1
ответ
Модель Кокса PH в "линиях жизни" - нарушенные предположения для фиктивных переменных
Я использую lifelinesбиблиотека для оценки модели Cox PH. Для регрессии у меня есть много категориальных функций, которые я быстро кодирую и удаляю по одному столбцу для каждой функции, чтобы избежать проблемы мультиколлинеарности (ловушка фиктивной…
05 мар '19 в 19:29
1
ответ
Построение кривой KMF с использованием линий жизни в коде выхода Pycharm 0, но без вывода
Извините, я новичок в этом, но я попытался запустить какой-то код и получил код выхода 0 (без ошибок), но я не вижу никаких выходных данных (в консоли Python). Я использую PyCharm Python 3.7 с пакетом линий жизни from lifelines import KaplanMeierFit…
19 апр '20 в 05:35
1
ответ
Есть ли способ извлечь данные из метода plot_covariate_groups в пакете установщика CPH?
Я запустил модель пропорциональной опасности Кокса, используя CPH.fitter из компании lifelines. Теперь мне нужна функция выживания для некоторых индивидуальных параметров в когорте. Используя метод plot_covariate_groups, я получил изображение функци…
12 май '20 в 14:57
1
ответ
<lifelines> Решение пропорциональной опасности Кокса после создания переменной взаимодействия со временем
Я использую пакет lifeelines для выполнения регрессии Кокса. После попытки подобрать модель, я проверил предположения CPH на предмет возможных нарушений, и она вернула некоторые проблемные переменные вместе с предложенными решениями. Одно из решений…
16 мар '20 в 23:03
0
ответов
Вывод stderr в stdout в строке
Используя Windows powershell, я стремлюсь вывести все строки, включая stdout и stderr in-line, в текстовый файл. Это должно позволить мне определить, к чему относится общее предупреждение, а не только stderr. Я использовал myscript.py 2>&1 ou…
09 апр '20 в 00:44
1
ответ
Сплайновый регрессионный анализ для анализа выживаемости COX в Python
В настоящее время я использую спасательный круг для проведения анализа выживаемости коксов. Мне интересно, есть ли какая-нибудь библиотека или функции, которые могут помочь мне выполнить анализ сплайн-регрессии для модели Coxph? Что-то вроде этого: …
19 июн '20 в 14:54
1
ответ
жизненный сюжет вверх ногами
Я изучаю анализ выживаемости с помощью библиотеки линий жизни. Я использую набор данных о лейкемии. Я пытался составить график жизней. Однако я получаю перевернутый сюжет (т.е. перевернутый по вертикали). Я использую этот блокнот в качестве справочн…
24 июн '20 в 20:33