Описание тега graph-tool
Graph-tool is an efficient Python module for manipulation and statistical analysis of graphs (a.k.a.NETworks).
1
ответ
Постоянное добавление в DYLD_LIBRARY_PATH на MAC вызывает ошибки X11
Я использую Python 2.7 и пытаюсь импортировать graph_tool, и кажется, что мой libboost_thread-mt.dylib находится в / opt / local / lib, а не в / usr / local / lib. Если я запускаю терминал X11 и набираю export DYLD_LIBRARY_PATH='/opt/local/lib' зате…
25 июл '14 в 19:39
14
ответов
Python эквивалент D3.js
Кто-нибудь может порекомендовать библиотеку Python, которая может делать интерактивную визуализацию графов? Я специально хочу что-то вроде d3.js, но для python и в идеале это было бы и 3D. Я посмотрел на: NetworkX - это только делает Matplotlib учас…
19 окт '12 в 15:26
3
ответа
Создание графического инструмента на OSX с Python 3.4
Я попытался установить graph-tool на Mac OSX 10.10, используя homebrew. Процесс сборки brew работает нормально, но когда я пытаюсь импортировать Graph-Tool, я получаю сообщение об ошибке, описанное в этом вопросе. Другая проблема с homebrew заключае…
15 июл '15 в 10:24
0
ответов
В графе-инструменте, как я могу замаскировать подграф?
Я создаю два графика через graph-tool библиотека: g1 = graph(directed=False) g2 = graph(directed=False) g3 = graph(directed=False) Затем: ug = graph_union(g1, g2) ug = graph_union(ug, g3) Если я хочу замаскировать g3 а также g2 в ug, как сделать?
17 июл '15 в 14:01
1
ответ
Более близкие связанные компоненты в Graph-Toll
Я использую библиотеку Python Graph-Tool для создания сетевого графа. На моем графике около 6 различных кластеров / отдельных связанных компонентов. Однако я бы хотел, чтобы они были ближе друг к другу на графике. По сути, я не хочу так много пустог…
14 июл '17 в 15:54
1
ответ
Эквивалент has_path в Graph-Tool
Имеет ли Graph-Tool какую-либо эквивалентную функцию для hasXpath в NetworkX? Я хотел бы вернуть True, если между любыми заданными узлами есть правильный путь.
19 сен '18 в 21:27
1
ответ
Указание позиции вершины через координаты в графическом инструменте python
Можно ли построить вершину в определенной позиции на оси xy, указав координаты? Я хочу иметь квадратную решетку из вершин без ребер между ними (а затем добавить ребра позже, как я считаю нужным). Спасибо
22 июн '16 в 21:00
1
ответ
Graph-Tool: как получить доступ к свойствам?
Я хотел бы хранить экземпляры класса в графе графического инструмента, по одному объекту на узел (или "вершину", как их называет граф-инструмент). Я пытаюсь использовать свойство вершины, так как кажется, что это способ сделать это. class MyClass(ob…
02 мар '12 в 01:34
2
ответа
Graph-Tool: Как изменить цвета вершин?
Как я могу установить цвет фона вершины? Я знаю, что должен быть словарь свойств или что-то подобное, но я не могу найти пример. Мне нужно, чтобы раскрасить разные виды вершин в двудольном графе: gtdraw.graph_draw(g, pos=pos, vertex_fill_color=part,…
08 ноя '15 в 16:36
1
ответ
NameError: имя 'graph_draw' не определено
После установки пакета AUR в arch-linux возникла ошибка при выполнении простого фрагмента кода. makepkg -sri PKGBUILD (to install package) потому что произошла странная ошибка при попытке выполнить компиляцию из источника, поэтому решите использоват…
17 фев '16 в 08:07
1
ответ
Как я могу рассчитать обхват графа, используя Graph-Tool?
Graph-tool предлагает множество инструментов для оценки графа: https://graph-tool.skewed.de/static/doc/topology.html. Тем не менее, я не могу найти какой-либо метод для расчета обхвата, то есть самый короткий цикл на графике. Знаете ли вы, существуе…
06 ноя '18 в 12:58
1
ответ
Правильное связывание PATH и LD_LIBRARY_PATH после установки gcc-5.2 в собственный каталог
Я только что скомпилировал и установил gcc-5.2. У меня не было root-доступа, поэтому я установил его в своем собственном каталоге. Я забыл в конце, что я должен связать через LD_LIBRARY_PATH а также PATH setenv LD_LIBRARY_PATH /bigbang/data/username…
25 май '16 в 00:38
2
ответа
Есть ли библиотека питонов, способная вычислять дуал трехмерной сетки?
Я изучил python-graph и привязки python для библиотеки графов надстроек, но не нашел ничего релевантного в отношении дуализации ячеек (вершины двойственности - это грани исходного графа и связаны ребром в двойственности. если они разделяют ребро в и…
01 апр '13 в 15:33
1
ответ
python graph_tool: получить _все_ кратчайшие пути
Я хочу вычислить все кратчайшие пути между всеми парами в графе. Чтобы достичь этого, я использую функцию all_shortest_paths в graph_tool для каждой пары узлов в графе. Согласно документации, функция может учитывать веса ребер, если они заданы. На п…
05 июл '17 в 14:55
1
ответ
Как график-инструмент определяет количество блоков?
Документация minimize_blockmodel_dl говорит Смотрите peixoto-ierarchical-2014 для подробностей об алгоритме. Тем не менее, в документе четко говорится Однако, чтобы выполнить выбор модели, сначала нужно найти оптимальные разделы сети для заданных з…
22 май '17 в 11:38
1
ответ
Graph-Tool: Как сохранить элементы карты свойств в graphml?
Это моя первая попытка использовать graph-tools с python. У меня есть график с некоторой важной информацией в Картах свойств (имена, темы,...). Когда я сохраняю график, используя g.save("test.graphml"), информация о карте свойств не сохраняется: ест…
16 сен '17 в 18:52
0
ответов
Установка длины ребра в графическом инструменте
Я ищу способ указать точную длину ребер на графике, чтобы получить соответствующий рисунок. Я пытался сделать это через свойства края: import numpy as np import graph_tool.all as gt tree = gt.Graph() # ddmatrix is a symmetric adjacency matrix eprop …
17 ноя '17 в 01:49
1
ответ
Передача информации из сюжета в функцию
Я хочу написать интерактивное моделирование с использованием Graph-Tool. Я хотел бы сначала визуализировать график, а затем выбрать узлы в качестве входных данных для последующего реального моделирования. Как передать информацию из сюжета в функцию?…
22 июн '16 в 18:58
1
ответ
Graph-tool/Autoconf - configure.ac:39: ошибка: возможно, неопределенный макрос: PKG_INSTALLDIR
Я пытался скомпилировать Graph-инструмент из исходного кода. При беге ./autogen.sh Я получаю следующее сообщение об ошибке: libtoolize: Consider adding `-I m4' to ACLOCAL_AMFLAGS in Makefile.am. configure.ac:39: error: possibly undefined macro: PKG_…
04 ноя '16 в 16:47
1
ответ
Библиотека графических инструментов python с базой данных графов
Я хотел бы использовать некоторые функциональные возможности графического инструмента с данными в графической базе данных (скажем, neo4j, но любая графическая БД с поддержкой Blueprints была бы хороша, см. Проект Tinkerpop). Я знаю (и немного балова…
12 май '14 в 10:10