Описание тега dunn.test

NoneDunn.test - это пакет R, реализующий тест Данна для множественных сравнений с использованием ранговых сумм.
0 ответов

Как создать скобки на основе результатов dunn.test для определения значимости

Я пытаюсь поставить скобки, обозначающие важные отношения на моем ggplot. B1 <- ggplot(tissue_A, aes(x=Site, y=d15N.permil, fill = Site)) + geom_boxplot() + geom_signif(comparisons = list(c("Suva", "Nagigi")),y_position = 14.3, map_signif_level=T…
28 апр '18 в 23:10
2 ответа

Записать фрейм данных в файл.xls с заголовком

Я адаптировал скрипт для запуска множественных (post-hoc) сравнений dunn.test функция от dunn.test пакет с несколькими переменными, генерирующий несколько фреймов данных, сохраненный с помощью приведенного ниже (упрощенного) кода в файле.xls в виде …
23 дек '14 в 20:50
1 ответ

Контролировать вывод теста Данна

Я использую dunn.test() из пакета dunn.test, и я не хочу, чтобы он выводил что-либо на вывод std (консоль), потому что я делаю это много раз, и я хочу посмотреть, есть ли у меня какие-либо предупреждения до этого. Поэтому я отменил распечатку теста …
15 фев '17 в 10:14
0 ответов

Матричная визуализация вывода DunnTest в R

Я хочу выяснить, существует ли способ создать матричную визуализацию для отображения выходных данных после специального теста, а именно теста Данна, показывающего p-значения из нескольких сравнений между переменными в моем наборе данных. Причина в т…
01 сен '18 в 17:54
1 ответ

Соблюдаю ли я правильные процедуры с помощью функции dunn.test?

Я проверил различия между участками отбора проб с точки зрения значений численности, используя kruskal.test, Однако я хочу определить множественные различия между сайтами. dunn.test Функция имеет возможность использовать векторные данные с категориа…
20 апр '18 в 22:43
1 ответ

Разница между posthoc.kruskal.dunn.test и dunn.test

В настоящее время я ищу способ выполнить тест Данна в R. При этом я наткнулся на несколько функций, в которых реализован тест Данна. library(dunn.test) library(PMCMR) dunn.test(x=mtcars[,"wt"], g= mtcars[,"cyl"])$P.adjusted posthoc.kruskal.dunn.test…
22 май '17 в 19:41
1 ответ

Найдено значение квадрата ци в R

Мне нужно извлечь / скопировать в переменную значение (p-значение) квадрата Чи Крускала-Уоллиса из dunn.test функция dunn.test пакет, но он не возвращается. Вопрос в следующем: если у меня есть квадрат хи и соответствующая степень свободы, можно рас…
21 фев '15 в 19:57
2 ответа

Как создать таблицу как вывод dunn.test (R)?

Я работаю с данными пиросеквенирования бактерий, и я делаю статистический анализ с R. У меня есть 21 образец и 7 различных обработок. Я загрузил свои данные в R phyloseq, получив: > psR phyloseq-class experiment-level object otu_table() OTU Table…
20 фев '15 в 11:12
1 ответ

Какой специальный тест я должен провести после выполнения Крускала-Уоллиса?

У меня длинный набор данных (N=499). Из которого я сравниваю, как ведет себя индекс с 8 различными обработками (с разным количеством образцов в каждой обработке). Я уже сделал Крускал-Уоллис, и он был значительным (значение р < 2,2e-16). Теперь, что…
15 июл '15 в 15:07
1 ответ

Как преобразовать объект с расплавом, сохраняя имена столбцов строк?

Я хочу преобразовать dunn.test вывод с melt функция от reshape2 пакет, но я теряю парные имена групп. Как сохранить их в "расплавленном" фрейме данных? С использованием melt для pairwise.wilcox.test вывод с кодом: pw &lt;- pairwise.wilcox.test(tabel…
18 дек '14 в 23:00
0 ответов

Функция создания коробочков с скобками в R?

Есть ли в R функция, которая может создавать прямоугольники и печатать дополнительные скобки вокруг этих групп, которые не показывают существенных различий при использовании парного критерия множественного сравнения (например, критерия Данна)? Резул…
28 фев '17 в 08:08
1 ответ

Tidyverse решение для группировки и циклического перебора данных, чтобы выполнить dunn.test

У меня есть пример данных ниже. example.df &lt;- data.frame( species = sample(c("primate", "non-primate"), 50, replace = TRUE), treated = sample(c("Yes", "No"), 50, replace = TRUE), gender = sample(c("male", "female"), 50, replace = TRUE), var1 = rn…
04 мар '19 в 10:14
0 ответов

Тестовый участок Данна - какой пакет?

Я наткнулся на тестовый сюжет Данна: htt ps:https://stackru.com/images/9b411d3dbc12a615395fa638263df8e4d27f483d.png Есть ли пакет, который может сделать эти участки? Я провел тест Данна и хочу представить свои данные графически.
10 мар '19 в 23:23
0 ответов

Каков наилучший способ управления / сохранения результатов из posthoc.krukal.dunn.test() или dunn.test() - где мои входные данные находятся в формате данных?

Я новичок в программировании на R и ищу помощь в анализе данных метаболомики - 118 метаболитов с 4 состояниями (3 повторения на условие). Я хотел бы знать, для каждого метаболита, какие условия значительно отличаются от каких. Вот часть моих данных …
24 апр '19 в 21:14
0 ответов

Тест Данна (особенно Z-статистика) говорит что-нибудь о направлении?

Я провел тест Данна, чтобы сравнить распределение показателей факторов по трем номинальным переменным. Как мне интерпретировать знаки Z-статистики? Z-статистика говорит что-нибудь о направлении?
07 май '19 в 20:26
0 ответов

Почему тест Dunn в Dunn.package и DescTools сообщает о разных результатах?

У меня есть уведомления о том, что пакет dunn.test и DescTools (стр.182) предоставляют процедуру теста Данна для процедуры произвольных парных множественных сравнений, подходящую для отклонения теста Крускала-Уоллиса. Каковы различия между ними? Я в…
10 мар '19 в 16:47
0 ответов

Получить существенно разные группы из теста Данна в R

В R я сравниваю группы с dunn.test. Вот некоторые примеры данных, где "тип" - это переменная группировки: my_table &lt;- data.frame ("type" = c (rep ("low", 5), rep ("mid", 5), rep ("high", 5)), "var_A" = rnorm (15), "var_B" = c (rnorm (5), rnorm (5…
22 авг '19 в 19:33
2 ответа

Написание функции для обобщения результатов dunn.test::dunn.test

В R я выполняю тест Данна. Используемая мной функция не имеет возможности группировать входные переменные по их статистически значимым различиям. Однако это то, что меня искренне интересует, поэтому я попытался написать свою собственную функцию. К с…
02 июл '20 в 13:58
2 ответа

тест Данна для перебора столбцов фрейма данных

Я пытаюсь выполнить тест Данна для данных Ирис. Я хочу перебрать 4 столбца и выполнить тест Данна для каждого столбца на разных видах. Однако, когда я пытаюсь получить имя столбца, это не работает. Кто-нибудь может сказать мне, почему? library(rstat…
30 авг '20 в 06:40
1 ответ

Как интерпретировать P-значения в R (в контексте теста Данна)

Вот мой результат теста Данна. Мне трудно понять скорректированные значения P. Все числа длинные и имеют в центре знак "-" или "+" или "е". Я смутно понимаю, что в общепринятых значимых p-значениях, например <2.2e-16, это означает, что они очень низ…
05 сен '20 в 16:41