Не могу "связать"SimpleITK::Show() с FIJI

Я бегу на Ubuntu. При вызове метода Show SimpleITK я не могу просмотреть такое изображение в моем окне FIJI ( ImageJ2).

Учитывая, что FIJI является переносимым приложением, необходимо ли выполнить еще какой-то процесс, чтобы правильно связать метод Show с ним?

заранее спасибо

Источник

1 ответ

SimpleITK требует внешнего средства просмотра изображений для отображения изображений (ImageJ, 3DSlicer, ITK-Snap и т. Д.).

Установка ImageJ

  1. Перейдите на https://imagej.nih.gov/ij/download.html.
  2. Обязательно загрузите bundled with 64-bit Java 1.8.0_112 версия

Настройка ImageJ

  1. Перейдите на https://imagej.nih.gov/ij/plugins/nifti.html.
  2. Скачать nifti_io.jar
  3. Идти к C:\blah\blah\ImageJ\plugins\Input-Output
  4. Удалить существующий nifti_io.jar файл из папки
  5. Скопируйте загруженный nifti_io.jar файл в папку
  6. Перезапустите ImageJ и проверьте, если File -> Import -> NIfTI-Analyze есть
  7. Если он есть, плагин был успешно установлен

Настройка SimpleITK

  1. Найдите путь, по которому ваш ImageJ.exe Файл существует
  2. открыто cmd
  3. Введите setx SITK_SHOW_COMMAND "C:\blah\blah\ImageJ\ImageJ.exe"
  4. Вы должны получить сообщение SUCCESS: Specified value was saved

Проверьте, все ли работает

  1. Перезапустите ваш текстовый редактор или IDE (если он уже был открыт)
  2. Запустите ваш код
Источник
Другие вопросы по тегам