Описание тега rpy2
RPy - это очень простой, но надежный интерфейс Python для языка программирования R. Он может управлять всеми видами объектов R и может выполнять произвольные функции R (включая графические функции). Все ошибки языка R преобразуются в исключения Python. Любой модуль, установленный для системы R, можно использовать из Python
1
ответ
Панды с rpy2 и многопроцессорностью
Я пытаюсь ускорить процесс, используя Панд и Р. Предположим, что у меня есть следующий фрейм данных: import pandas as pd from random import randint df = pd.DataFrame({'mpg': [randint(1, 9) for x in xrange(10)], 'wt': [randint(1, 9)*10 for x in xrang…
20 апр '15 в 18:37
1
ответ
Как отобразить изображение с помощью wxpython и rpy2?
Поэтому я пытаюсь отобразить сгенерированное изображение R при использовании wxpython и rpy2... Полный 131-строчный код находится здесь... https://gist.github.com/ACollectionOfAtoms/4286c0fc32838b03f2ea Таким образом, в рамках программы пользователь…
02 апр '15 в 01:01
2
ответа
Захват трассировки из R при возникновении RRuntimeError
Класс Python выполняет функции R через rpy2, и я хотел бы иметь возможность получить обратную трассировку от R в случае, если функция R генерирует ошибку. Код R является устаревшим, поэтому его изменение было бы очень рискованным; Я бы предпочел сде…
12 окт '16 в 15:50
2
ответа
Использование Rblpapi через rpy2
Я могу успешно использовать Rblpapi от R: > library("Rblpapi") > conn <- blpConnect(host='myhost', port=18194) > bds("SPX Index", "INDX_MEMBERS") Member Ticker and Exchange Code 500 XYL UN 501 YHOO UW 502 YUM UN 503 ZBH UN 504 ZION UW Те…
19 июл '16 в 02:38
1
ответ
Как сделать R файл данных для типа Python
Я хочу сделать тип данных R для типа данных Python ниже весь код def convert_datafiles(datasets_folder): import rpy2.robjects rpy2.robjects.numpy2ri.activate() pandas2ri.activate() for root, dirs, files in os.walk(datasets_folder): for name in files…
05 янв '18 в 10:28
1
ответ
#SuperSet Интеграция Python с R ( rpy2)
Позднее определили надстройку Apache как отличный инструмент визуализации, так как большинство наших приложений Data Science работают на Python (flask) и R (с использованием rpy2) и веб-сервере Tornado, есть ли возможность для интеграции моего текущ…
11 ноя '17 в 14:20
1
ответ
%load_ext rpy2.ipython Изображение не найдено Ошибка
Я пытаюсь использовать магическую команду в ipython, что я видел здесь: слайды rpy2 Я сделал следующее: import rpy2.ipython %load_ext rpy2.ipython Но я получаю следующую ошибку: ImportError: dlopen(/Users/XXX/anaconda/lib/python2.7/site-packages/rpy…
28 сен '16 в 19:24
1
ответ
Неожиданный ввод в "%load_ext rpy2.ipython" в R - ipython
Я новичок в R и пытаюсь выполнить код на этом сайте, но, к сожалению, я вижу эту ошибку "Ошибка: неожиданный ввод в"%load_ext rpy2.ipython"" при вводе "% load_ext rpy2.ipython" в консоли R и Я попытался найти в Google ответы, но не повезло. Любая по…
30 авг '17 в 13:27
3
ответа
Вызов пользовательских функций из Python с использованием rpy2
Есть ли способ вызова функций, определенных в файле, скажем, myfunc.r ---------------myfunc.r -------------- myfunc = function(){ return(c(1,2,3,4,5,6,7,8,9,10)) } getname = function(){ return("chart title") } ---- Python How to call getname() here …
14 мар '13 в 20:41
1
ответ
Извлечение возвращенного значения из rpy2
Я использую ноутбук Jupyter (ядро Python 3) с rpy2 (V2.9.1) для запуска команд в R из Python. Я могу передавать значения в и из R, но моя проблема в том, что я не знаю, как извлечь нужную информацию из переменной, возвращаемой из R. У меня есть след…
17 июл '18 в 07:13
2
ответа
Разница в Python statsmodels OLS и R's lm
Я не уверен, почему я получаю немного разные результаты для простого OLS, в зависимости от того, иду ли я через экспериментальный интерфейс rpy от panda, чтобы выполнить регрессию в R или я использую statsmodels в Python. import pandas from rpy2.rob…
15 июл '12 в 19:44
2
ответа
Печать на Python невероятно медленно
Я сталкиваюсь с проблемой, с которой я никогда не сталкивался, и это чертовски расстраивает меня. я использую rpy2 взаимодействовать с R из скрипта Python и нормализовать массив. По какой-то причине, когда я собираю свои выходные данные вместе и печ…
10 июн '16 в 01:08
1
ответ
rpy2: представляет NA в Python как аргумент функции R
Я пытаюсь передать NA для функции R, например, делать прогнозы с lme4 Смешанная модель, использующая только фиксированные эффекты (т.е. без случайных эффектов): import rpy2.rinterface as ri from rpy2.robjects.packages import importr rstats = importr…
24 фев '19 в 04:05
1
ответ
Как построить (встроенный) с Rpy2 в блокноте Jupyter?
Я учусь использовать rpy2 в ноутбуке Jupyter. У меня проблемы с графиком. Когда я использую этот пример из документов rpy2 для интерактивной работы: from rpy2.interactive import process_revents from rpy2.robjects.packages import importr from rpy2.ro…
30 мар '17 в 06:33
2
ответа
Использование шкалы логарифмических осей в ggplot из Rpy2
Я пытаюсь отформатировать свои оси в масштабе журнала от Rpy2, используя ggplot. В обычном R это можно сделать: qplot(data=data, x=x, y=y) + geom_point() + scale_y_log2() Чтобы получить ось log2. Когда я пытаюсь использовать ggplot2.scale_y_log2 в R…
17 фев '13 в 18:16
0
ответов
Rpy2 - выбор результатов и вывод в файл CSV
В настоящее время я занимаюсь моделированием пропорциональных рисков Кокса с использованием Rpy2 - я думаю, что мой вопрос будет охватывать и другие функции, а также результаты их вызова. После запуска функции у меня есть переменная, которая содержи…
30 июл '13 в 14:42
0
ответов
Как я могу вызвать переменную из Python в коде R
Я работаю в среде Python, используя rpy2 (используя код r в Python). Я пытаюсь передать переменную python в r, пока dong read.csv. Переменная python содержит массив, который показан ниже: var это строка в python var = CAM_4209 команда, которую я пыт…
12 фев '19 в 17:35
1
ответ
Модель как параметр функции r, при вызове функции r с использованием rpy2 из многопоточности
Это скорее проблема эффективности при вызове r функций с использованием rpy2 из многопоточности. Задача функций r в основном загружает файл модели с диска и использует модель для классификации временных рядов. Однако сбор входных временных рядов осу…
28 мар '13 в 20:42
1
ответ
Не удается установить rpy2 через pip в MAC OS
Я не могу установить rpy2(пакет Python) через pip или PyCharm в MAC OS.Но я могу успешно запустить Python(через PyCharm) и R(через RStudio).....Основное сообщение об ошибке "Ошибка: Попытка угадать ДОМОЙ R, но нет команды (R) в ПУТИ". и "Команда" py…
19 мар '16 в 21:02
1
ответ
Эквивалент именованного списка в доступе rpy2/dataframe
Я пытаюсь повторить пример из пакета MNP в R из rpy2 двумя разными способами. Во первых, я просто использую robjects.r со строкой, которая точно копирует и вставляет код R: import rpy2.robjects as robjects import rpy2.robjects.numpy2ri import rpy2.r…
02 июл '15 в 17:20