Как сделать R файл данных для типа Python

Question

Я хочу сделать тип данных R для типа данных Python ниже весь код

def convert_datafiles(datasets_folder):
import rpy2.robjects
rpy2.robjects.numpy2ri.activate()
pandas2ri.activate()
for root, dirs, files in os.walk(datasets_folder):
    for name in files:
        # sort out .RData files
        if name.endswith('.RData'):
            name_ = os.path.splitext(name)[0]
            name_path = os.path.join(datasets_folder, name_)
            # creat sub-directory
            if not os.path.exists(name_path):
                os.makedirs(name_path)
            file_path = os.path.join(root, name)
            robj = robjects.r.load(file_path)
            # check out subfiles in the data frame
            for var in robj:

                ###### error   happend right here
                myRData = pandas2ri.ri2py_dataframe( var  )
                ####error happend right here



                # convert to DataFrame
                if not isinstance(myRData, pd.DataFrame):
                    myRData = pd.DataFrame(myRData)
                var_path = os.path.join(datasets_folder,name_,var+'.csv')
                myRData.to_csv(var_path)
            os.remove(os.path.join(datasets_folder, name)) # clean up

print ("=> Success!")

Я хочу сделать тип данных R типом Pythone, но ошибка продолжает появляться следующим образом: AttributeError: у объекта 'str' нет атрибута 'dtype'

Как я должен сделать, чтобы устранить эту ошибку?

Answer 1

Документация по rpy2 является несколько неполной, когда дело доходит до взаимодействия с пандами, но модульные тесты предоставят примеры конверсии. Например:

rdataf = robjects.r('data.frame(a=1:2, '
                    '           b=I(c("a", "b")), '
                    '           c=c("a", "b"))')
with localconverter(default_converter + rpyp.converter) as cv:
    pandas_df = robjects.conversion.ri2py(rdataf)