Описание тега openslide
OpenSlide - это библиотека C, которая предоставляет простой интерфейс для чтения изображений целого слайда (также известных как виртуальные слайды).
1
ответ
Как установить PATH до того, как импорт произойдет хорошим способом?
У меня есть скрипт Python, который использует openslide-python. openslide-python требует, чтобы двоичные файлы OpenSlide находились в пути поиска DLL в Windows. Я планирую распространять свое приложение в будущем, и я не хочу, чтобы пользователи заг…
30 ноя '17 в 14:34
1
ответ
Получил ошибку при декодировании jpeg2000 в C++ с OpenJPEG
Я пытаюсь декодировать формат JPEG2000 с помощью OpenJPEG. (Декодирование только одного необработанного тайльного буфера из файла SVS.) Но я получил ошибку в opj_read_header(). Есть что-то, что я забыл установить перед вызовом opj_read_header()? opj…
18 дек '18 в 01:58
1
ответ
Можно ли использовать OpenSlide в Google Colab?
Мне нужно разделить изображение TIF на участки. Изображения в гигапиксельном разрешении, и это занимает очень много времени на моей машине. Можно ли использовать OpenSlide в Google Collaboratory?
15 янв '19 в 23:47
1
ответ
Ошибка импорта OpenSlide Python
Я пытаюсь использовать привязки Python от OpenSLIDE ( http://openslide.org/download/) и попробовал практически все, но безуспешно import openslide на Python 2.7. Вот мое сообщение об ошибке: >>> import openslide Traceback (most recent call …
09 мар '16 в 15:57
0
ответов
Установите openslide и его зависимость openjpeg на Ubuntu без прав root
Я подключен к серверу через SSH и не имею привилегий root. В конечном итоге мне нужно установить openslide. apt-get нет, yum требует привилегий root, поэтому я собирался сделать make/install из исходного кода openslide. Мне нужно было установить ope…
24 фев '19 в 22:36
0
ответов
Openslides на Ubuntu 18.04
Я пытаюсь установить Openslide для визуализации медицинских фотографий.Я следовал простым инструкциям, но не смог успешно запустить Openslide на своем ноутбуке. Я использовал: pip install openslides но я получаю эту ошибку, когда я запускаю "opensli…
12 июн '18 в 09:47
1
ответ
Неподдерживаемое сжатие TIFF
Я использую openslide-python открыть svs изображение, и я столкнулся со следующей проблемой: >> import openslide as osi >> a = osi.OpenSlide('image.svs') выдает ошибку TIFFReadDirectory: Warning, Unknown field with tag 347 (0x15b) encoun…
15 июн '16 в 06:19
1
ответ
Openslide: заменить изображение "метка"
Я использую openslide-python для чтения полных изображений слайдов в формате Mirax (mrxs). Теперь я хотел бы заменить изображение штрих-кода "label" на пользовательское. К несчастью, f.associated_images["label"] = label_new повышения TypeError: '_As…
20 апр '18 в 07:32
0
ответов
Openslide read_region дает целочисленное переполнение
Я пытаюсь прочитать блоб изображения с размером чтения больше 32767, 32767. Я получаю ошибку переполнения целого числа. Может кто-нибудь сказать мне, какой максимальный размер я могу читать?
03 мар '18 в 05:31
1
ответ
Ошибка openslide libjpeg: неверная версия библиотеки JPEG
Я работаю с привязками Python Openslide. Я использую изображения Tif, которые поддерживаются Openslide. Кажется, я могу использовать методы read_region а также get_thumbnail с меньшим двоичным TIF в маске около 100 мегабайт. Однако при увеличении RG…
10 мар '16 в 18:19
1
ответ
Импортируемая версия Python OpenSlide: ошибка Windows
Я использую Python 2.7 Win 32 Мне нужно установить openslide в python на странице ниже показать http://openslide.org/download/ какой элемент скачать для windows. я перепробовал все и установил пункт ошибка показывает ниже импорт открывается Tracebac…
16 сен '16 в 08:55
1
ответ
Невозможно установить openslide-python на Google datalabs Блокнот Jupyter
Я пытаюсь установить openslide-python на gat datalabs блокнот Jupyter, используя:! Apt-get install python-openslide Он работает, пока не распечатает: Need to get 13.0 MB of archives. After this operation, 44.7 MB of additional disk space will be use…
29 мар '17 в 22:21
1
ответ
Конвертировать массив изображений в оригинальный формат SVS
Я пытаюсь применить извлечение переднего плана к изображению SVS (Whole Slide Image), используя библиотеку OpenSlide. Во-первых, я преобразовал свое изображение в массив для работы над извлечением переднего плана: image = np.asarray(oslIm.read_regio…
10 ноя '18 в 19:23
1
ответ
Ошибка импорта Openslide-python
Я получаю следующую ошибку при запуске import openslide изнутри терминала питона <code>Traceback (most recent call last): File "<stdin>", line 1, in <module> File "C:\dev_res\python\python2_713\lib\site-packages\openslide\__init__.…
15 май '17 в 19:09
0
ответов
Как сохранить изображение определенного уровня с Python OpenLide?
Я хочу знать, как сохранить изображение TIF с Python OpenLide? Процедура такая шаг 1: чтение изображения с открытым питоном шаг2: изображение имеет размерность 9 уровней, поэтому я выбираю только изображение уровня 3~9 Шаг 3: сохранить 3~9 уровня TI…
07 дек '18 в 05:14
1
ответ
Нет модуля с именем openslide
Я создал виртуальную среду с conda и установил открытый слайд. Я активировал свою среду, но когда я пытаюсь запустить свой скрипт Python, я получаю сообщение об ошибке: import openslide ModuleNotFoundError: No module named 'openslide' Я использую py…
21 сен '18 в 16:57
2
ответа
Java Swing: может ли мышь вносить изменения в два наложенных JPanels одновременно?
Я новичок в качелях, и у меня есть следующая проблема: Я использую библиотеку openslide-java для просмотра целых изображений слайдов. Существует класс OpenSlideView, который расширяет JPanel, и его целью является просмотр изображений. Этот класс име…
29 янв '18 в 15:31
0
ответов
Проблема анонимизации-слайда с созданием объекта
Я пытаюсь обновить анонимный слайд (который удаляет ярлыки слайдов из отсканированных виртуальных слайдов) для работы с Python3. Это было написано для Python2.6 или 2.7. Я не думаю, что проблема заключается в совместимости версий Python, хотя я могу…
13 фев '19 в 04:14
0
ответов
Openslide не будет отображать свойство mmpx для level_count-1
Свойство "openslide.mmp-x" показывает свойство, содержащее число микрон на пиксель в измерении X уровня 0. Поскольку я показываю level_count-1, мне не нужно свойство для уровня 0, но для level_count-1, Как мне получить это свойство этого уровня? sli…
04 фев '19 в 02:44
0
ответов
OpenSlide-Python установить в Windows10
Plateform: win10 home Python 3.7.2 (tags / v3.7.2: 9a3ffc0492, 23 декабря 2018, 22:20:52) [MSC v.1916 32 бит (Intel)] на win32 Я хочу запустить образец DeepZoom в Windows 10. следуйте: https://github.com/openslide/openslide-python 1. Install OpenSli…
01 апр '19 в 01:16