Описание тега littler
Используйте этот тег, задавая вопросы о запуске сценариев R, в частности, с помощью команды littler.
1
ответ
R: сборка не удалась для пакета 'littler'
Когда я запускаю R в контейнере и пытаюсь установить пакет R littlerТам выдает несколько ошибок: /usr/bin/ld: cannot find -lpcre /usr/bin/ld: cannot find -llzma /usr/bin/ld: cannot find -lbz2 collect2: error: ld returned 1 exit status Makevars:29: r…
19 окт '18 в 06:20
1
ответ
Кавычки в аргументах для Литтлера / Докопта
Я хочу передать строки, как key="value" к меньшему сценарию. В Bash у меня есть argtest.sh: #!/bin/sh echo $1 который я могу вызвать, сохраняя кавычки из оболочки с помощью обратной косой черты, и я вижу их в выводе: $ ./argtest.sh x=\"1\" x="1" Одн…
21 ноя '15 в 14:34
2
ответа
checkCompilerOptions Ошибка при установке пакета (littler/Docker)
В последней строке этот файл Docker вызывает littler::install.r установить Rcpp RcppEigen а также matrixStats, Весь код работал как шарм пару месяцев назад. Теперь, это бомбы на последнем шаге. Точнее, Rcpp а также RcppEigen по-прежнему устанавливае…
27 янв '16 в 21:52
4
ответа
Установка пакетов R с помощью скрипта bash - ответы на запросы
На моей работе сервер пограничного узла, который обращается к нашему кластеру, обновляется каждый день. Это означает, что я должен клонировать наш репозиторий и устанавливать кучу пакетов R каждое утро. Я написал bash-скрипт (используя https://githu…
03 авг '17 в 21:46
1
ответ
Как позвонить в младший без поиска ~/.Rprofile?
Кажется, когда я звоню littler из командной строки он будет исходным ~/.Rprofile. Есть ли способ предотвратить его поиск ~/.Rprofile?
14 апр '20 в 03:32
0
ответов
проблема getSrcFilename () в R, но не в меньшем
Я ожидал getSrcFilename() также работает в R не просто lr. Это ошибка в командеR? $ lr -e "source('main.R');" [1] "main.R" $ R --slave --no-save --no-restore --no-init-file -e "source('main.R')" character(0) $ cat main.R options(keep.source=T) f=fun…
15 апр '20 в 05:48
1
ответ
Как читать RDS со стандартного ввода?
Я пытаюсь использовать следующую команду для чтения файла RDS. Но не работает. Моя ОС - Mac OS X. $ lr -e "readRDS(file('stdin'))" < /tmp/x.rds Error in readRDS(file("stdin")) : unknown input format $ lr -p -e "readRDS('/dev/stdin')" < /tmp/x.…
16 апр '20 в 02:18
1
ответ
как установить из биокондуктора с помощью install2.r из littler?
Я пытаюсь использовать https://cran.r-project.org/web/packages/littler/vignettes/littler-examples.html для установки некоторых пакетов, во время которых я получаю сообщение об ошибкеdependency 'graph' is not available. Похоже, что этот пакет доступе…
18 июн '20 в 19:34
1
ответ
Как открыть график ggplot/plotly в браузере из сценария оболочки
Я хотел бы сделать сценарий R bash, который создает график ggplot/plotly при его запуске У меня есть следующий сценарий, который работает в интерактивном режиме с использованием littler. #!/usr/bin/env r library(plotly) set.seed(955) # Make some noi…
28 окт '19 в 22:58
0
ответов
Как использовать R littler с докером для установки устанавливаемых исходных файлов?
Я хотел бы установить определенную версию пакета R. Согласно документации, Littler распознает устанавливаемые исходные файлы. Итак, я предположил, что это может сработать: FROM r-base:latest RUN apt-get update \ && install.r --error digest_0…
04 дек '21 в 20:58
0
ответов
Ошибка littler при работе с stderr, не может печатать на stderr
$ cat main.R sink(stderr()) print('xx') sink() Для приведенного выше кода littler и Rscript дают разные результаты. Rscript печатает 'xx' в stderr, как и ожидалось. Но Littler выводит «xx» на стандартный вывод. Это ошибка Littler? $ Rscript main.R …
03 апр '22 в 15:18
0
ответов
Обнаружение того, как запускается файл R
Код R может запускаться различными способами, например, вызываться через , загружаться из пакета или считываться из stdin. Я хотел бы обнаружить это, чтобы создавать файлы, которые могут работать во множестве контекстов. Текущий скрипт экспериментал…
09 мар '22 в 11:59
0
ответов
запустить сеанс R как демон и разрешить одновременный доступ
У меня есть серия сценариев R, и я хочу запускать их при получении некоторых запросов. Я хочу ускорить время выполнения, потому что большинство из них являются сюжетными сценариями, а загрузка пакетов занимает много времени. Я прочитал ссылки, упомя…
28 окт '22 в 10:06