Описание тега ami.js

Описание тега Вопросы с тегом
AMI Medical Imaging (AMI) - это библиотека JavaScript для медицинской визуализации с использованием threejs.
1 ответ

Функции передачи в xtk

Как бы я хотел подключить передаточную функцию для определения окраски и непрозрачности в xtk на основе скалярной интенсивности пикселей и / или величины градиента. Это может быть отдельная 1d функция передачи или 2d функция передачи. В дополнение к…
10 ноя '17 в 23:45
0 ответов

Ami.js: создание буфера массива различной ориентации

В настоящее время я работаю над диссертацией на тему бакалавриата о добавлении функциональности MPR к конференции с веб-хостингом + инструменту Dicom Viewer. Я видел примеры / уроки и играл с Stackhelper + индекс и изменение ориентации с dat.gui, и …
08 ноя '18 в 14:05
0 ответов

Использование stl с квадратом ami.js оставляет артефакты в 2D видах

Я собираюсь рассмотреть пример из ami.js https://github.com/FNNDSC/ami/blob/dev/examples/viewers_quadview/viewers_quadview.js чтобы визуализировать 2D-фрагмент 3D-модели кости, наложенной в качестве маски сегментации. поверх 2D-изображения соответст…
26 сен '18 в 08:52
1 ответ

Используйте движение мыши для изменения уровня / окна в AMI Medical Imaging (AMI) JS ToolKit

Я немного играю с AMI Medical Imaging (AMI) JS ToolKit. Есть ли способ переместить окно на событие мыши, например, щелкнуть правой кнопкой мыши и переместить? Я знаю, что можно изменить окно / уровень с помощью меню на примерах, но я хотел бы измени…
06 июн '16 в 13:42
1 ответ

Набор данных DICOM не загружается правильно

Я пытаюсь загрузить серию DICOM во всех трех направлениях (сагиттальное, осевое и корональное). Набор данных ориентирован по оси, и отображение всех срезов в осевом направлении работает нормально. Но при отображении сагиттального и коронального вида…
16 апр '18 в 07:01
0 ответов

Использование AMI.js для первого выпуска при запуске уроков

Я хотел бы попросить о помощи, потому что я попытался использовать библиотеку AMI.js, https://github.com/FNNDSC/ami и я выполнил шаги, которые написаны в углу для разработчиков: $> git clone https://github.com/FNNDSC/ami.git $> cd ami $> ya…
11 янв '18 в 15:15
0 ответов

Как назначить определенные цвета вершинам в геометрии

Я работаю над переходом на мозговую веб-платформу с three.js и ami.js. Цель состоит в том, чтобы назначить цвета для модели мозга в зависимости от оценки (модель Лоретты). У старой платформы есть реализация на C++, и она работает правильно, но кажет…
06 июл '18 в 01:31
0 ответов

Отображение набора данных DICOM в виде 3D-представления

Я пытаюсь показать серию DICOM в 3D-представлении. Он работал с другим набором данных, но с текущим, 3D-изображение не отображается. Выходные значения в стеке данных windowCenter и windowWidth составляют -964 и -664. Я использую последнюю версию AMI…
16 апр '18 в 11:02
2 ответа

Память продолжает расти, если я загружаю новый файл dicom

Каждый раз, когда я загружаю файл dicom, память растет. Как мне почистить память о старых
03 июл '18 в 08:29
1 ответ

Как использовать виджеты AMI.js

В примере кода для виджетов в AMI.js они получают WidgetsHandle из "base / widgets / widgets.handle". Есть ли способ получить доступ к виджетам при использовании библиотеки AMI без доступа ко всему репо? Я пытался сделать var wh = new AMI.WidgetsHan…
09 мар '18 в 15:02
0 ответов

Обеспечение гладкого затенения материала

Я использую ami.js для исследования мозга. Цель состоит в том, чтобы загрузить модель мозга, которая окрашена в плавный затененный цвет, но вот проблемы: а) Исходная модель stl, которая у меня есть, не имеет нормалей, и кажется невозможным вычислить…
26 июн '18 в 05:38
1 ответ

Javascript Попытка запустить примеры AMIjs в локальной сети не работает

Здравствуйте и спасибо, что прочитали это. Я хотел бы загрузить примеры в локальной среде IDE WebStorm. В частности, я пытаюсь загрузить пример загрузчиков: https://github.com/FNNDSC/ami/tree/dev/examples/viewers_upload Проблема, которую я получаю, …
16 янв '18 в 18:46
1 ответ

Использование XTK или AMI.js для отображения объектов Freesurfer while/pial на T1.mgz

Я хотел бы воссоздать веб-версию пиал / белых поверхностей FreeSurfer, наложенных на T1.mgz, аналогично первому изображению freeview на https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/FsTutorial/PialEdits_freeview. Используя XTK, я могу получить что-то, ч…
24 янв '18 в 14:54
1 ответ

Объединение AMI.js с объемной визуализацией XTK

В настоящее время я работаю над дипломной работой по отображению медицинских данных 3D в браузере. Поэтому я пишу приложение, которое может отображать изображения и сетки DICOM. Насколько я вижу, объемный рендеринг DICOM лучше работает с XTK, чем с …
16 мар '18 в 07:45
0 ответов

Загрузка DICOM из zip-архива

Я пытаюсь загрузить DICOM с сервера DICOM. Загрузка одного файла с URL работает нормально. Теперь я хочу загрузить целую серию данных DICOM. Я получаю данные с сервера с HTTP-запросом в виде zip-архива. Я попытался разархивировать ответ с помощью би…
05 апр '18 в 14:07
0 ответов

Как я могу перемещаться по стеку изображений в файле DICOM, используя ami.js?

Я пытаюсь создать визуализатор DICOM в React, используя ami.js, но я не могу перемещаться по стеку изображений. В идеале я бы перемещался по стеку с помощью колесика мыши, но сейчас я бы согласился с перемещением по нажатию кнопки и позже начал рабо…
10 май '19 в 09:57
1 ответ

Цвет класса наложения карты меток сегментации AMI не отображается

Я имею в виду этот пример. Это на ванильном JavaScript. Импортировал все в качестве угловой службы провайдера в угловой 7.3.8 с версией AMI 0.32.0 (три 0.99.0). Используя те же тестовые примеры, что и в ссылке выше. Загружается оригинальное сканиров…
06 май '19 в 10:20
2 ответа

Как изменить ориентацию файла mgh/dicom/nifti с помощью nibabel

Мне трудно найти правильное аффинное преобразование для 3 различных видов: коронального, осевого и саггитального, у каждого из которых есть отдельные проблемы, как показано ниже: 1: осевая цветовая карта перекрывается саггитальным исходным видом. 2:…
13 май '19 в 11:28
1 ответ

Урок XTK 13 (пример ami) - Удаление граничных линий в срезах, полученных с помощью объемной визуализации 2D

Я реализовал урок XTK 13 из примеров AMI (это - https://fnndsc.github.io/ami/), передав набор изображений DICOM. В полученных срезах есть эти цветные пунктирные линии, которые, я полагаю, являются какой-то границей. Мне нужно удалить их, но я не уве…
28 авг '19 в 14:54
0 ответов

Как получить доступ к заголовкам DICOM из ami.js

Я использую ami.js для отображения DICOM, однако я хочу получить доступ к такой информации, как возраст и пол пациента. Из кода я вижу, что они анализируются в парсере. https://github.com/FNNDSC/ami/blob/master/src/parsers/parsers.volume.js#L166-L18…
22 авг '19 в 10:08