Выбор функции

Question

Я пытаюсь найти метод выбора полезных функций для набора из 20000 генов из набора экспрессии (микрочип), чтобы получить модель только с полезными генами. Я попытался использовать RFE из каретки, но у меня была ошибка Stackru, так как обратный выбор не поддерживает данные, где n(предикторы) > n(выборки). Может ли кто-нибудь предложить разумный метод для этого? Или решение для этого метода выбора RFE?

Заранее спасибо.

Answer 1

Вы пытались использовать генетические алгоритмы для выбора функций? Для этого есть разные пакеты - GA, genalg, caret (в R).

Взгляните на этот блог, выбор функций с использованием генетических алгоритмов объясняется на примере - http://topepo.github.io/caret/GA.html

Надеюсь, поможет.