Прогрессивные последовательности отсутствуют в выводе
Недавно я провел прогрессивное литье 266 бактериальных последовательностей (~1x10^6 п.н. каждая). Это завершено без ошибок, однако bbcols и магистральные файлы содержат данные только для 241 последовательности.
Файл xmfa показывает, что все 266 были прочитаны успешно, но выравнивания пропускают последние 20 с лишним последовательностей.
Я выполнил выравнивание с 260 копиями коротких вымышленных последовательностей, чтобы увидеть, есть ли у прогрессивов максимальный предел последовательности, но это выполнено правильно.
Кто-нибудь сталкивался с подобной проблемой / есть какие-либо идеи, что могло вызвать проблему?
Заранее спасибо Гарри