Как стандартизировать преобразование в двоичные изображения с различной яркостью и контрастностью

Question

Я работаю с образцами микроскопии, которые имеют "сеть" темных линий. Я хочу преобразовать изображения в двоичное, чтобы отображались только темные участки, но я не уверен, как стандартизировать этот процесс. Изображения имеют различную яркость и контрастность, поэтому выбор одного числового порога не сработает. Я мог бы стандартизировать яркость и контрастность по всем изображениям, но некоторые образцы имеют больше темных линий, чем другие, поэтому в моей идеальной схеме стандартизации эти образцы на самом деле должны иметь более низкую общую яркость. Я думал о выборе областей на каждом из образцов, свободных от линий, и стандартизации яркости и контрастности для этих областей, но я не уверен, как лучше всего добиться этого, и в любом случае я бы предпочел иметь полностью автоматизированный процесс без места для человеческих противоречий. Любой совет? До сих пор я работаю с Фиджи / ImageJ.

Answer 1

Вы можете использовать адаптивный порог для вашей первоначальной проблемы. Похоже, что есть даже плагин ImageJ, который его поддерживает: https://sites.google.com/site/qingzongtseng/adaptivethreshold